LotuS2

搜索
登录

LotuS2

文章数：1篇

用于扩增子测序数据分析的超快、高精度工具LotuS2

扩增子测序是分析微生物群落的最常用技术之一，许多处理这些数据的可用工具需要较高的生物信息学技能和计算能力。近日，英国Quadram生物科学研究所在Microbiome发表最新研究，开发了LotuS2（https://github.com/hildebra/lotus2）扩增子测序分析工具，其程序设计轻巧、易于使用、速度快、且不影响重建微生物群落的质量（支持16S、18S和ITS扩增），支持DADA2、uparse、unoise3、cd-hit和vsearch等不同的序列聚类算法。在真实和模拟数据中，LotuS2性能优越，处理速度更快。此外，其输出数据还可直接导入R或作为文本文件导入其他程序。总之，该工具的开发促进了科研人员便捷的挖掘相关数据，值得关注和测试。

LotuS2 生信分析工具研究论文基础研究扩增子测序