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Diogo M Camacho
文章数:3篇
宿主-细菌互作
Cell子刊:研究宿主-微生物互作的深度学习资源
细菌聚糖是介导宿主-细菌互作的重要分子。Cell Host and Microbe近期发表方法学文章,介绍了一种基于机器学习的细菌聚糖研究方法,可以用于鉴别和研究与细菌免疫原性、致病性、免疫逃逸等相关的聚糖基序,有助于拓展对于宿主-细菌互作进化模式的研究。
宿主-细菌互作
glycobiology
machine learning
Glycans
Deep learning
肠出血性大肠杆菌
为何人比鼠更易感染肠出血性大肠杆菌?菌群代谢物有话说
小鼠作为模式生物,对肠出血性大肠杆菌(EHEC)的易感性明显低于人类,《Microbiome》发表的一项最新研究,通过器官芯片微流控培养技术,揭示出这种对致病菌感染的易感性差异,在一定程度上是由肠道菌群代谢物的差异所介导的。该研究不仅鉴定出可用于防治EHEC的潜在菌群代谢物靶点,其研究方法对于研究菌群-致病菌互作也很有参考价值。
肠出血性大肠杆菌
易感性
器官芯片
微流控技术
肠道菌群代谢物
机器学习
Cell:二代机器学习在生物网络中的应用(综述)
机器学习正在逐渐被整合至现代生物学的研究中。Cell上发表的最新综述详细介绍了二代机器学习在生物网络中的应用前景,机器学习可助力药物研发、菌群研究、合成生物学等领域,同时也面临着包括巨大的数据量需求在内的许多挑战。
机器学习
生物网络
Agnieszka Butwicka
Agnieszka Butwicka