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文章数:1篇
生物信息学工具
青岛能源所徐健+苏晓泉等:微生物组的“三大指数”
菌群研究持续火热,目前的一大挑战是,如何将新的菌群样本在已有的数据中进行定位和比对。中科院青岛生物能源所单细胞中心徐健主任和苏晓泉研究员日前联袂Rob Knight在mBio上发表文章,开发了微生物组搜索引擎(http://mse.single-cell.cn),使大规模、全局性的微生物组比对与搜索成为可能;该搜索引擎基于类似于传统 BLAST 的执行逻辑,对用户十分友好( 用户只需提供菌群的 OTU 表);搜索结果给出微生物组的“新奇指数”、“关注指数”和“影响力指数”,可评估菌群组成的新颖性,预测特定菌群研究领域的潜力和趋势。
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