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文章数:1篇
宏基因组
利用宏基因组数据重建微生物泛基因组
宏基因组数据分析通常会受到参考基因组有限的阻碍(使用分箱、培养组学等方法可以解决一部分)。MSPminer 采用了一种新的思路,不再执着于构建某一物种的基因组,转而通过对丰度相同的基因聚类构建泛基因组(Pan-genome),并区分核心基因组和可变基因组基因。所得结果可用于下游的定性和定量分析。
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肠道菌群宏基因组