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鸟枪法测序
文章数:2篇
宏基因组学
基于鸟枪法读长开展细菌菌株的计算分析
确定菌株水平的微生物组成至关重要,这项研究调查了 20 种计算工具,试图从鸟枪读长中推断出细菌菌株的基因组,并第一次讨论了这些工具背后的方法。作者还在相同数据集上系统地评估了六种新型菌株靶向工具,发现 BHap、mixtureS 和 StrainFinder 的性能优于其他工具,但由于最佳工具的性能仍然欠佳,作者讨论了可能解决这些限制的未来方向。
宏基因组学
鸟枪法测序
工具比较
细菌菌株
菌株基因组重建
Milestones in human microbiota research
Nature人体菌群研究里程碑:测序识别人类菌群
测序技术的发展有助于人类探索和自身相关的微生态结构和功能。本文回顾了检测人体相关菌群的测序方法,介绍了从一代Sanger测序到三代长度长测序在研究菌群特征中的优缺点,以及近期在人类菌群参考基因组构建、新基因组组装上获得的进展。
Milestones in human microbiota research
Sanger测序
扩增子测序
鸟枪法测序
参考基因组