细菌菌株

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细菌菌株

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宏基因组学

基于鸟枪法读长开展细菌菌株的计算分析

确定菌株水平的微生物组成至关重要，这项研究调查了 20 种计算工具，试图从鸟枪读长中推断出细菌菌株的基因组，并第一次讨论了这些工具背后的方法。作者还在相同数据集上系统地评估了六种新型菌株靶向工具，发现 BHap、mixtureS 和 StrainFinder 的性能优于其他工具，但由于最佳工具的性能仍然欠佳，作者讨论了可能解决这些限制的未来方向。

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