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批判性评估

Nature子刊：CAMI2宏基因组分析评测第二阶段成果

在过去的二十年里，宏基因组学的进步极大地增加了我们对微生物世界的了解，并加强了数据分析技术的发展，这就需要对这些方法进行公正和全面的评估，以确定该领域的最佳实践和开放挑战，本研究描述了第二轮 CAMI 挑战的结果，在其中，作者评估了程序在更大、更复杂的数据集上的性能和进展，包括长读长数据和进一步的性能指标，例如运行时间和内存使用。CAMI数据集获取地址：https://data.cami-challenge.org/participate（包括金标准、基于基准数据创建的组装基因组、NCBI分类信息和NCBI RefSeq、nt和nr的参考序列集合）。

批判性评估长读长组装复杂数据集 CAMI

宏基因组仿真数据生成软件：CAMISIM

CAMISIM是特别为生成宏基因组和菌群测序仿真数据而设计的软件。该软件生成的数据集，可用于评测不同宏基因组分析工具的性能，指导软件使用时的参数设置，优化分析流程等。

宏基因组 Benchmarking CAMI Genome binning Metagenome assembly