Molecular typing

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BMC Microbiology：粪便中弯曲杆菌的宏基因组学诊断技术

① 在掺杂有空肠弯曲杆菌的人及鸡的粪便样本中，对DNA进行测序，并使用Kraken及CLARK宏基因组工具进行数据分析；② 掺杂的空肠弯曲杆菌越多，可获得更多的采样数（hit），然而并未呈显著的线性关联；③ 因此，无法测量此方法的检测上限，在人及鸡的粪便样本中最低的检测浓度分别是7.75*10^4 CFU/mL及10^3 CFU/mL；④ 在人的临床粪便样本中，弯曲杆菌的感染负荷预计在9.2*10^4-1.0*10^9 CFU/mL之间。

弯曲杆菌 Culture independent Molecular typing next generation sequencing