基因组流行病学

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基因组流行病学

文章数：3篇

副溶血弧菌

扈庆华+崔玉军+杨瑞馥Nature子刊：数据驱动的食源性病原菌防控网

食源性疾病对公众健康和福祉具有重大和持久的威胁，然而，传统的食源性疾病暴发监测在面临疫情时却处于被动状态，因为其主要通过聚集性病例的通报触发，难以发现小规模、长时间或跨区域的暴发。深圳市疾控中心扈庆华携手北京微生物流行病研究所杨瑞馥和崔玉军团队与合作者在Nature Microbiology发表文章，通过整合深圳市17年来副溶血弧菌的基因组和流行病学大数据，建立了一张以“数据驱动”的监控网，以挖掘隐性疫情、可能的持久性隐藏储库、传播网络及其枢纽和源头，颠覆了散发患者和独立的点源暴发是食源性感染主要来源的传统认知，该研究不仅为副溶血弧菌的防控提供了有效模型，也为其它食源性病原监测网络的编织提供了新视角。

副溶血弧菌基因组流行病学

Nature子刊：分析细菌重组率的新方法

细菌重组与进化，与抗生素耐药性和致病因素的获得及传播有关。本研究开发了一种新的数据分析平台，可利用全基因组数据和宏基因组鸟枪法测序数据，分析细菌重组情况，适用微生物生态学、进化和流行病学领域，值得参考。

细菌重组方法学全基因组(WGS) 宏基因组菌群生态学

Nature Reviews：建设可靠的全球病原体实时监控系统（综述）

这是Nature Reviews Genetics[IF：40.282]发表的关于利用宏基因组学、便携式测序仪等新技术快速诊断病原体并依托此建立全球监控系统的综述，IF巨高，对微生物组相关技术的应用提出了切实可行的方案。值得好好读一读。

基因组学基因组流行病学数字化流行病学传染病临床宏基因组学