微生物系统

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Cell子刊：微生物系统的空间代谢研究（观点）

微生物与人类健康有着密切的关系。通常大多数微生物并不是单个细胞形式存在的，而是构成特定的微生物群落，或称之为微生物系统。微生物系统表现为具有高密度的细胞组成、有序的空间组织结构，如形成生物膜等结构，以及有限的移动能力等特征。这些特征决定了一个微生物系统代谢的空间复杂性，即微生物的种类、数量、空间位置决定了其参与的代谢反应，而不同空间的代谢反应最终组成的复杂的系统代谢。系统代谢不仅仅取决于代谢反应的空间特征，还取决于这些反应的偶联效应以及代谢物质的区域化特征。近期一篇发表在Cell子刊Cell System上的观点型综述，回顾了微生物系统代谢过程的空间架构机制，讨论了决定空间代谢反应的长度尺度决定因素，以及空间代谢结构对微生物系统的影响，并对未来该领域研究提出了关键科学问题。

微生物系统空间代谢酶和化学物质分布长度尺度综述

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Nature子刊：微生物系统中的功能冗余

不同微生物系统间存在一个共同的特点——功能冗余，即同样的群落代谢功能可由多种不同类别的物种实现。Nature Ecology & Evolution近期发表观点性文章，认为这种开放微生物系统中的特性将功能、功能冗余和群落内微生物组成联系起来，对微生物系统的塑造有重要作用。

微生物系统功能冗余代谢组学微生物生态学