功能冗余

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功能冗余

文章数：5篇

微生物生态学

刘洋彧团队：破译人类菌群的功能冗余性

人类菌群在分类学组成上有着很大的个体差异，但在菌群的基因组成——或者说功能能力上，又是高度保守的。这种现象可以用一个生态学术语来描述，即“功能冗余性”（FR）。FR被认为是菌群的稳定性和韧性（抗扰动）的基础，但是这一假说仍缺乏量化数据的支持。人类菌群的FR从何而来？如何量化？对基于菌群的疗法有何重要意义？哈佛医学院的刘洋彧团队近期在Nature Communications发表的研究，为解答这些关于人类菌群FR的问题提供了重要的理论基础。他们通过构建人类微生物组的基因内容网络（GCN），首次对菌群样本的FR进行了量化计算，并揭示了有助于形成高FR的关键的演化和生态学因素。他们进一步使用该框架分析了粪菌移植的临床数据，表明FR可作为衡量菌群韧性的指标，为预测基于微生物组的疗法（如FMT、益生菌干预等）的效果，提供重要的指导和参考信息。

微生物生态学菌群功能功能冗余人类微生物组菌群疗法

缓解期克罗恩病患者的肠道宏蛋白组的功能稳定性及冗余性

Microbiome上发表的一项最新研究，对5名手术后处于缓解期的克罗恩病患者的肠道宏蛋白组进行了为期1年的纵向分析，发现虽然肠道宏蛋白组在不同个体、同一个体的不同时间点均表现出差异，但有着稳定且保守的核心功能，并且，核心功能表现出了门水平上的功能冗余。

IBD Crohn’s disease gut microbiome human microbiome Longitudinal analyses

微生物系统

Nature子刊：微生物系统中的功能冗余

不同微生物系统间存在一个共同的特点——功能冗余，即同样的群落代谢功能可由多种不同类别的物种实现。Nature Ecology & Evolution近期发表观点性文章，认为这种开放微生物系统中的特性将功能、功能冗余和群落内微生物组成联系起来，对微生物系统的塑造有重要作用。

微生物系统功能冗余代谢组学微生物生态学

Microbiome：变形菌门解释肠道菌群可变性

不同肠道菌群之间为什么会有生理差异的特异性基因及分类群呢？菌群的可变性主要与哪些类型的细菌有关？看看这篇文章。

拟杆菌门肠型厚壁菌门功能冗余人体肠道微生物

Cell子刊：别太担心你的菌群，它们说不定冗余着

① 肠道菌群在组成上的动态平衡概念可推广到功能水平；② 功能冗余是指特定菌群之间功能可互相替代，强壮的肠道菌群拥有稳定，抵抗、弹性及功能冗余特性；③ 不同年龄、饮食和疾病诱发的表型受到菌群代谢可塑性和功能冗余的影响；④ 网络生物学的方法可能会揭示出参与预防或促进肠道紊乱/疾病的关键菌群物种；⑤ 肠道菌群组成和功能的不平衡不仅是与疾病相关的肠道黏膜结构缺陷的结果，且有助于整个人类健康系统持续缺陷的恢复或维持。

肠道菌群功能冗余