厚壁菌门

在人类肠道菌群（HGM）中，拟杆菌门和厚壁菌门作为优势菌门，主要依靠聚糖进行消化以满足其能量需求。甘露聚糖是人类饮食中不可或缺的一种聚糖，除了能影响人体健康外，其结构的多样性和复杂性还具有改变某些拟杆菌门和厚壁菌门中特定基因簇表达的分子特征。近期发表在Biotechnology Advances上的研究，简述了甘露聚糖的结构多样性和HGM中细菌如何选择甘露聚糖，以及甘露聚糖对宿主健康和代谢的影响。

甘露聚糖肠菌代谢综述拟杆菌门厚壁菌门

全肠内营养治疗(EEN)

浙江大学揭示全肠内营养对儿童克罗恩病肠道菌群和胆汁酸代谢的影响

本文旨在探究全肠内营养治疗(EEN)对克罗恩病(Crohn’s disease, CD)患儿肠道菌群(GM)和胆汁酸（BAs）代谢的影响，作者在粪便中进行靶向代谢组学分析和宏基因组学分析，研究CD患者在EEN治疗2个月前后BA和GM的变化。通过小儿克罗恩病活性指数(PCDAI)评分和粪便钙卫蛋白检测显示，厚壁菌门和肠道中一级和二级BAs成分的平衡与CD疾病的健康状况密切相关。了解肠道菌群和BAs代谢的恢复过程将有助于我们探索EEN治疗的潜在机制。

全肠内营养治疗(EEN) 肠道菌群胆汁酸（BAs）小儿克罗恩病活性指数(PCDAI) 厚壁菌门

胆汁酸代谢

厚壁菌门中一种新型胆汁酸还原酶

肝脏中胆汁酸合成是机体排出多余胆固醇的主要途径，且胆汁酸在小肠脂质代谢中发挥着重要的作用。胆汁酸部分在肠道中在吸收，重新回到肝脏中，而有部分胆汁酸则进入大肠，最终被排出体外。在大肠中，各种不同的肠道菌群均可以把胆汁酸进行生物转化，从而产生不同的次生代谢物。这些次生代谢物可以作为多种信号分子，与人类健康有着密切的关系。结肠中胆汁酸代谢依赖于胆酸盐水解酶以及胆汁酸诱导（bai）操纵子的调控，此前对L. scindens中的bai基因研究较为深入。近年来有研究发现厚壁菌门也具有bai基因，可能参与形成脱氧胆酸（DCA）和石胆酸（LCA）异构体，但对其具体的机制尚不明确。近期一篇发表在Gut Microbes的研究成果发现baiP和baiJ两个基因均编码一种新型3-oxo-Δ -5ɑ胆汁酸还原酶，在厚壁菌门特异性分布，参与A/B反式扁平胆汁酸次生代谢物的合成。进一步研究发现baiP和baiJ与结肠癌发生相关。

胆汁酸代谢 baiP 胆汁酸次生异构代谢产物胆汁酸5-ɑ还原酶厚壁菌门

膳食纤维

聂少平等：膳食纤维-肠道厚壁菌门-机体互作（综述）

这是南昌大学聂少平和Jielun Hu与团队在Critical Reviews in Food Science and Nutrition发表的综述。厚壁菌门是肠道最主要的菌群门类之一，与机体健康密切相关。最近的研究表明，厚壁菌门含有很多消化膳食纤维的基因，并且可以与肠粘膜作用，保护机体健康。本文主要综述了厚壁菌门对膳食纤维的消化机制、以及膳食纤维-肠道厚壁菌门-机体健康/疾病互作轴的存在，论述了膳食纤维通过增加厚壁菌门从而对健康产生的益处等。文章为相关益生菌和膳食纤维等益生元的使用提供参考。

膳食纤维厚壁菌门

帕金森病

国内团队：帕金森病患者的菌群相关表位变化

广东省中医院的李卓和雒晓东、香港中文大学的路钢和潘伟生及团队在Frontiers in Immunology上发表的一项最新研究，对比鉴定了69名帕金森病（PD）患者与244名对照的菌群相关表位差异，发现这些表位差异可能与免疫应答异常、谷氨酸及丙酮酸代谢异常相关。

帕金森病研究论文肠-脑轴队列研究厚壁菌门

细菌药物

SER-287治疗中轻度溃疡性结肠炎的安全性及初步疗效

北京时间昨晚，Seres Therapeutics公司宣布了旗下肠道微生物组药物SER-109的3期临床试验结果，表明SER-109可有效减少艰难梭菌感染复发风险。消息一出，Seres Therapeutics公司股价暴涨近400%。好事成双，Seres Therapeutics公司开发的另一款口服微生物组药物——SER-287（含有厚壁菌门细菌的芽孢）的临床1b期研究结果，也于近期在Gastroenterology上发表：在58名中轻度UC患者中，SER-287表现出了良好的安全性及耐受性，且相比于安慰剂，万古霉素治疗6天后接着进行持续8周每天1次的SER-287治疗，可更有效地诱导患者的临床缓解。另外，在进行SER-287治疗前，万古霉素预处理可促进SER-287物种在患者肠道中的定殖。

细菌药物研究论文医学研究 1期临床试验 SER-287

噬菌体

饮食中的原噬菌体诱导剂是如何影响肠道菌群的？

在人体肠道内，每一个细菌细胞约含有1个病毒样颗粒(VLP)。这些VLPs大部分是dsDNA噬菌体。人类肠道中的大多数噬菌体属于温和噬菌体，并作为原噬菌体整合到细菌宿主的基因组中。研究表明，许多常见的食物和/或环境化合物可通过激活原噬菌体改变肠道菌群组成。Gut Microbes发表的文章，研究了三种常见肠道细菌和一种条件致病菌对117种常用食品、化学添加剂和植物提取物的反应。结果显示，包括甜菊糖和蜜蜂蜂胶提取物在内的11中化合物，显示出物种特异性生长抑制的原噬菌体诱导作用。以上结果表明，不同的食物可以通过调节温和噬菌体来改变肠道细菌的丰度，本结果或可为调节人类肠道微生物组提供了一条新的途径。

噬菌体饮食-菌群互作 Bacteriophage gut microbiome Diet

肠道适应性

Nature：适应肠道环境的细菌“另类”电子跨膜转运机制

细胞呼吸释放能量的过程涉及电子跨膜转运。本研究发现了一种革兰氏阳性细菌中的电子外排系统，形成特殊的无氧呼吸跨膜电子传递链。该系统有助于细菌适应肠道环境，获得生长优势，因此广泛分布于肠道致病菌和共生菌中，对研究菌群的肠道适应性具有参考价值。

肠道适应性无氧呼吸电子传递链肠道适应性无氧呼吸电子传递链革兰氏阳性菌

肥胖

JAMA子刊：剖腹产和肠道毛螺菌，或促肥胖代际传递

超重或肥胖可从母亲传递给孩子，其背后的风险因素有哪些？JAMA Pediatrics[IF：10.251]本周上线了来自加拿大的研究，对近千名婴儿进行了追踪分析，发现剖腹产和婴儿期（平均3.7月龄）肠道菌群中毛螺菌科的丰度，是超重和肥胖跨代传递的重要风险因素。或许可以推测，孕期肥胖和剖腹产可影响婴儿的肠道菌群，从而增加后代的肥胖风险，不过，这些仍需更多研究验证，对其中机制的研究或有助于对肥胖的预防。

肥胖超重跨代传递分娩方式毛螺菌科

变形菌门

Microbiome：1-8周龄小鼠的肺部菌群动态发育进程

这是一项设计不算新颖但结果值得特别关注的研究，对1-8周龄的小鼠的下呼吸道菌群的发育动态进行了跟踪，发现了很明显的变化，这个可能对其他动物包括人的研究有很大参考意义。

变形菌门厚壁菌门拟杆菌门放线菌门链球菌

抗生素

JPB：微量食品组分对人体肠道菌群的影响（综述）

一篇食品科学领域的人必读的综述，关注食品添加剂、污染物和其他微量组分对肠道菌群的影响，很值得深读。

抗生素拟杆菌食品乳化剂厚壁菌门食品添加剂

拟杆菌属

Microbiome：IBS患者的肠道菌群差异与局部脑容量相关

这项研究，将IBS患者的肠道菌群与中枢神经系统链接了起来，值得认真读一读。

拟杆菌属脑-肠-菌群轴厚壁菌门肠易激综合征宏基因组

鹅盲肠菌群

SR：木薯叶影响中国鹅盲肠菌群多样性

中国热带农业科学院和西北农林大学团队的合作成果，推荐阅读。

鹅盲肠菌群木薯叶饲料厚壁菌门拟杆菌门

麝香鹿菌群

FM：对林麝菌群和高山麝菌群的比较

北京林业大学团队的研究，推荐阅读。

麝香鹿菌群林麝高山麝 16s rRNA测序厚壁菌门

拟杆菌门

Microbiome：变形菌门解释肠道菌群可变性

不同肠道菌群之间为什么会有生理差异的特异性基因及分类群呢？菌群的可变性主要与哪些类型的细菌有关？看看这篇文章。

拟杆菌门肠型厚壁菌门功能冗余人体肠道微生物

食糜

SR：大西洋鲑鱼的肠道菌群跟哺乳动物很像？

大西洋鲑鱼的肠道菌群有什么特点？特别是肠道里不同段的食糜和黏膜里都有哪些细菌，这篇文章给了答案。

食糜黏膜菌群变形菌门厚壁菌门大西洋鲑鱼

拟杆菌属

BMC肠胃病学：分娩方式对婴儿菌群到底有多大影响？（综述）

对分娩方式对婴儿肠道菌群影响的研究非常多，这篇系统性综述对众多研究的数据进行分析，发现在3个月之内，分娩方式对婴儿肠道菌群的影响较为明显（当然，也只是在门的水平），而出生6-12个月后，分娩方式对肠道菌群多样性及定殖水平影响较小。这篇综述值得看一看。

拟杆菌属双歧杆菌属剖腹产梭菌属厚壁菌门

细胞壁糖聚合物

FEBS L：细胞壁糖聚合物对宿主-菌群互作有何影响？

厚壁菌门细菌的糖聚合物作为非蛋白粘附素，对宿主-菌群相互作用有深远影响，这些影响是什么，看看这篇综述，了解深入的分子机理。

细胞壁糖聚合物厚壁菌门非蛋白粘附素革兰氏阳性菌肽聚糖

拟杆菌门

COR综述：肠道菌群对肥胖的影响远比想象复杂！

关于肠道菌群与肥胖的一篇综述，推荐阅读。

拟杆菌门饮食厚壁菌门菌群平衡肥胖

牛奶过敏

JACI：8年跟踪，揭牛奶过敏逆转和菌群的关系

有些孩子，出生后会牛奶过敏，到8岁不再过敏，原来可能跟肠道菌群有关，好神奇。

牛奶过敏肠道菌群 16S rRNA 测序拟杆菌门梭状芽胞杆菌