胆汁酸代谢

补充益生菌已成为一种有前途的治疗工具来管理代谢疾病。近日，里昂第一大学研究人员在Gut Microbes发表最新研究，评估了乳双歧杆菌LA804和格氏乳杆菌LA806混合物对高脂饮食诱导的小鼠代谢疾病的影响，当对高脂饮食喂养的小鼠进行预防性给予益生菌混合物时，发现可能通过抑制肠道中的FXR信号来限制肥胖和相关的脂质代谢紊乱，值得关注。

益生菌脂代谢研究论文基础研究肠道菌群

肠道菌群

何彦+尹恝：肠菌通过介导胆汁酸代谢或可缓解中风后的炎症反应

缺血性中风已被证明会导致肠菌失衡，但其介导的胆汁酸代谢变化机制尚不清楚。近日，南方医科大学珠江医院何彦、南方医科大学南方医院尹恝及团队在Brain Behavior and Immunity发表最新研究结果，肠道菌群会介导胆汁酸代谢，发现恢复熊去氧胆酸可减少梗塞面积，改善小鼠的神经功能和认知功能，与通过TGR5/PKA途径抑制NLRP3相关的促炎细胞因子有关，值得关注。

肠道菌群中风研究论文基础研究胆汁酸代谢

新冠

重度新冠患者肠菌有何特征？

肠道微生物群是宿主免疫的关键调节剂，与呼吸道病毒感染的免疫反应有关。然而，很少有研究探究重度新冠患者肠道菌群有何特征。近日，麻省总医院研究人员在Genome Medicine发表最新研究，纳入127名新冠住院患者（其中79名重度、48名中度患者），探究新冠严重程度与肠菌、生化途径和粪便代谢物的联系，发现肠道微生物组可区分感染新冠后病程更严重的个体，其肠道菌群和胆汁酸代谢失调，值得关注。

新冠肠道菌群研究论文基础研究粪便代谢物

黑木耳多糖

国内团队：黑木耳多糖或能缓解NAFLD

黑木耳是一种药食兼用胶质真菌，黑木耳多糖（AAPs）是木耳中最主要的生物活性成分，具有免疫调节、抗氧化、降血糖、抗肿瘤、抗凝血等多种生物活性。尽管迄今为止关于AAPs可以缓解肝脏疾病的研究有限，但其他真菌多糖已被证明可以通过调节肝脏神经通路来降低NASH风险。南京农业大学曾晓雄和叶红与团队在International Journal of Biological Macromolecules上发表最新研究，发现AAPs对NAFLD/NASH具有有益作用，其保护作用与缓解肠道菌群紊乱、保持肠道屏障、改变胆汁酸谱和调节胆汁酸代谢密切相关。

黑木耳多糖研究论文非酒精性脂肪肝病（NAFLD）基础研究肠道菌群

原发性硬化性胆管炎（PSC）

Nature子刊：胆汁淤积性肝病患者有结肠炎或是好事！

原发性硬化性胆管炎（PSC）是一种以胆汁树慢性炎症和进行性纤维化为特征的慢性胆汁淤积性肝病。大多数PSC患者患有合并炎症性肠病（IBD），这被认为会促进疾病的发展和进展。Nature Communications近期发表的文章，发现了结肠炎触发的保护环路，抑制胆汁酸代谢，改善胆汁淤积性肝病。这提示我们，PSC可考虑多器官治疗策略。

原发性硬化性胆管炎（PSC）结肠炎胆汁酸代谢

肠道菌群

国内团队：肠道菌群调节胆汁酸代谢，影响奥贝胆酸对脂肪肝的疗效

非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）是最常见的慢性肝病，目前全球尚无批准的治疗药物。奥贝胆酸（OCA）属法尼醇X受体（FXR）激动剂，OCA通过激活FXR减少胆汁酸合成，调节胆汁酸动态平衡及其肠肝循环来改善NAFLD。然而，目前尚不清楚肠道菌群是否会影响OCA对NAFLD的治疗效果。npj biofilms and microbiomes近期发表的文章，通过整合宏基因组学和代谢组学方法，研究了OCA治疗NAFLD过程中肠道菌群-胆汁酸轴的动态复杂性。研究表明，肠道菌群在OCA治疗NAFLD中起到关键作用，OCA通过特别富集的肠道菌群调节宿主胆汁酸来改变肠道菌群组成，从而缓解NAFLD。

肠道菌群胆汁酸代谢研究论文基础研究非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）

热量限制（CR)

国内团队：热量限制通过肠道菌群调节肝脏表观基因组和胆汁酸代谢

已知热量限制（CR）通过重新调节代谢来促进宿主健康，但对于表观基因组和微生物组在宿主代谢适应CR过程中如何作用知之甚少。南京医科大学陆春城教授、秦玉峰教授及团队在Genome Biology发表最新文章，研究了CR小鼠模型中的染色质修饰、基因表达以及肠道菌群的改变，结果表明CR诱导的肠道菌群塑造了肝脏表观基因组，随后改变了负责胆汁酸代谢的相关基因表达，提出肠道菌群可以重塑表观基因组以微调宿主代谢适应性的观点。

热量限制（CR) 肠道菌群研究论文基础研究肝脏表观基因组

百菌清

国内团队：农药暴露导致宿主肥胖新证据

百菌清是一种高效低毒广谱的有机氯农药，药效稳定，残效期长，属于2B类致癌物。已有研究表明，接触农药会导致宿主肥胖，然而，关于百菌清（CHI）对宿主健康的影响，特别是CHI低剂量暴露对肥胖的作用仍然未知。中国农业大学和扬州大学团队联合在Journal of Hazardous Materials上发表最新研究，基于肠道菌群介导的BAs-FXR信号通路，探讨CHI对宿主肥胖的影响及其内在机制。

百菌清肥胖研究论文基础研究肠道菌群

妊娠期肝内胆汁淤积

杨仕明等Nature子刊：肠道菌群改变宿主胆汁酸代谢，促进妊娠期肝内胆汁淤积

妊娠期肝内胆汁淤积症（ICP）是一种女性妊娠特异性疾病，其特征是血清胆汁酸升高和胎儿不良结局。ICP的病因和机制尚不清楚；因此，现有的疗法在很大程度上是经验性的。陆军军医大学的杨仕明和佛山市第一人民医院的Xia Chen与团队在Nature Communications上发表文章，ICP患者的肠道菌群中富含脆弱拟杆菌，其通过抑制FXR信号通路，诱导过量胆汁酸合成，抑制肝脏胆汁酸排泄从而促进ICP。调控肠道菌群-胆汁酸-FXR轴或有助于ICP治疗。

妊娠期肝内胆汁淤积肠道菌群胆汁酸代谢

胆汁酸代谢

肠道菌群的胆汁酸调节及其与疾病的关联（综述）

Gastroenterology上发表的一篇综述，详细介绍了肠道菌群的胆汁酸代谢产物（尤其是短链脂肪酸）如何调控宿主的生理过程，并讨论了肠道菌群的胆汁酸代谢与多种疾病（非酒精性脂肪性肝病、IBS、结直肠癌、神经炎症、衰老等）的关联及背后机制。

胆汁酸代谢综述

肠易激综合征

快速结肠转运对IBS患者粪便菌群和短链脂肪酸的影响

Gut近期发表的研究，在先前研究(https://www.mr-gut.cn/papers/read/1060834547)的基础上，进一步比较了有和没有快速结肠转运（CT）的同一队列IBS-D患者（共181人）在调整胆汁酸代谢改变前后的微生物组组成和SCFA。结果表明，在IBS-D患者中，微生物群的改变与胆汁酸代谢的改变有关，而不是与快速CT或SCFA的改变有关。

肠易激综合征胆汁酸代谢短链脂肪酸粪便菌群

非酒精性脂肪肝病（NAFLD）

温州医学院：FGF21通过靶向肠道菌群调控的胆汁酸代谢来改善NAFLD

非酒精性脂肪肝（NAFLD）的特点是肝脏脂肪变性、炎症和纤维化，以及肠道菌群失调。成纤维细胞生长因子21（FGF21）调节葡萄糖和脂质代谢，已被证明对NAFLD有良好的作用。然而在NAFLD的治疗过程中，FGF21、肠道菌群之间是否互作仍不清楚。温州医学院的郑明华、李校堃和龚方华团队合作在Free Radical Biology and Medicine发表的文章，发现NAFLD患者的肠道菌群显著改变，血清FGF21升高。FGF21通过靶向肠道菌群调控的胆汁酸代谢来改善NAFLD。

非酒精性脂肪肝病（NAFLD） FGF21 胆汁酸代谢肠道菌群

非酒精性脂肪肝炎

国内团队：薯蓣皂苷元可减轻非酒精性脂肪肝炎

非酒精性脂肪性肝炎（NASH）是非酒精性肝病（NAFLD）的侵袭性形式，正在迅速成为终末期肝病或肝移植的主要原因。目前，尚无经批准的NASH治疗药物。薯蓣皂苷元对抑制脂质积累、胆固醇代谢、纤维化进展和炎症反应具有多种有益作用。但到目前为止，关于其如何影响NASH，还需要进一步研究。天津科技大学的满淑丽、中国中医科学院的Guo Lanping和天津大学的Gao Wenyuan合作在Pharmacological Research发表文章，薯蓣皂苷元通过干预梭状芽孢杆菌和胆汁酸代谢而改善NASH。研究揭示了薯蓣皂苷元治疗NASH的机制，或为设计新型临床治疗策略提供参考。

非酒精性脂肪肝炎薯蓣皂苷元胆汁酸代谢梭状芽孢杆菌

双硫仑

唐波+杨仕明+魏泓Nature子刊：戒酒药物双硫仑可通过肠肝轴改善NASH

非酒精性脂肪性肝炎（NASH）是非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）的晚期阶段，目前还没有批准的NASH疗法。双硫仑（DSF）多年来一直用于治疗慢性酒精中毒，同时，DSF也是一种多靶点药物，对多种疾病具有潜在的治疗作用，对代谢功能障碍产生有益影响。然而，DSF对NASH的深入机制研究和适当的临床试验尚未系统地进行。陆军军医大学唐波、杨仕明、魏泓与团队，近期在Nature Communications发表研究，证实双硫仑可降低细菌梭菌介导的7α-脱羟基反应，抑制其次级胆汁酸生物合成并改善NASH，并在一项自身前后对照的临床试验中验证了双硫仑对健康人群“肠-肝”轴的调节作用。

双硫仑肠道菌群胆汁酸代谢研究论文非酒精性脂肪性肝炎（NASH）

胆汁酸代谢

厚壁菌门中一种新型胆汁酸还原酶

肝脏中胆汁酸合成是机体排出多余胆固醇的主要途径，且胆汁酸在小肠脂质代谢中发挥着重要的作用。胆汁酸部分在肠道中在吸收，重新回到肝脏中，而有部分胆汁酸则进入大肠，最终被排出体外。在大肠中，各种不同的肠道菌群均可以把胆汁酸进行生物转化，从而产生不同的次生代谢物。这些次生代谢物可以作为多种信号分子，与人类健康有着密切的关系。结肠中胆汁酸代谢依赖于胆酸盐水解酶以及胆汁酸诱导（bai）操纵子的调控，此前对L. scindens中的bai基因研究较为深入。近年来有研究发现厚壁菌门也具有bai基因，可能参与形成脱氧胆酸（DCA）和石胆酸（LCA）异构体，但对其具体的机制尚不明确。近期一篇发表在Gut Microbes的研究成果发现baiP和baiJ两个基因均编码一种新型3-oxo-Δ -5ɑ胆汁酸还原酶，在厚壁菌门特异性分布，参与A/B反式扁平胆汁酸次生代谢物的合成。进一步研究发现baiP和baiJ与结肠癌发生相关。

胆汁酸代谢 baiP 胆汁酸次生异构代谢产物胆汁酸5-ɑ还原酶厚壁菌门

饮食-菌群-免疫互作

郭春君等Nature：菊粉如何通过菌群促进2型炎症？

膳食纤维可以通过肠道菌群发酵产生的短链脂肪酸发挥有益的抗炎作用，然而纤维的种类很多，大多数纤维及其菌群衍生代谢物的免疫调节作用仍然不明。Nature最新发表了美国康奈尔大学David Artis, Frank C. Schroeder和郭春君作为共同通讯作者的研究，发现富含可发酵纤维菊粉的饮食可以改变小鼠肠道菌群的组成和代谢，导致胆酸等胆汁酸水平升高，促进以嗜酸性粒细胞升高为特征的黏膜2型炎症反应，从而加剧过敏并增强抗寄生虫免疫。这些发现阐释了膳食纤维如何通过肠道菌群代谢物来发挥免疫调控作用的新机制，也揭示了膳食纤维-菌群-宿主免疫之间相互作用的复杂和多面性。

饮食-菌群-免疫互作菊粉膳食纤维 2型炎症菌群代谢产物

胆汁酸代谢

毛胜勇团队：奶牛肠道菌群代谢胆汁酸的规律及高精料日粮的扰动效应

胆汁酸（BA）是介导动物肠道菌群与宿主互作的重要信号分子，尽管BA相关微生物菌株和酶对单胃动物的重要性已经得到认可，但有关反刍动物肠道内BA组成、BA代谢相关的微生物群落结构及其功能尚不清楚。近日，南京农业大学毛胜勇及团队在ISME Journal发表最新研究，通过对18头奶牛的108个全肠道内容物样品测序，获得了372个MAGs参与胆汁酸解聚、氧化和去羟化途径。发现奶牛肠道不同部位的胆汁酸组成分布呈区段化特点，高精料日粮干预试验，发现Cluster1（对胆汁盐水解酶相关基因聚类获得）中BSH基因丰度增加与厚壁菌门菌株CAG-110有关，其丰度增加会促进胆酸浓度升高，与肠道炎症密切相关。总之，该研究进一步明确了奶牛肠道菌群代谢胆汁酸的基本规律，也揭示了日粮结构对微生物代谢胆汁酸及肠黏膜免疫稳态的影响，值得关注。

胆汁酸代谢宏基因组组装基因组 (MAGs) 研究论文基础研究奶牛养殖

益生菌

马曦团队：罗伊氏乳杆菌调节肠道菌群及胆汁酸代谢，保护肝脏

中国农业大学的马曦团队在Food Chemistry上发表的一项最新研究结果，罗伊氏乳杆菌SLZX19-12可通过调节小鼠的肠道菌群组成及胆汁酸代谢，以调控肝脏炎症因子的表达及肝细胞凋亡，从而缓解炎症诱导的肝损伤。

益生菌罗伊氏乳杆菌胆汁酸代谢细胞凋亡研究论文

胆汁酸代谢

Cell子刊：次级胆汁酸代谢紊乱是1型糖尿病前兆

胆汁酸是由肝脏中胆固醇为底物合成的两亲性分子，是促进小肠中脂质吸收的重要因子。胆汁酸代谢在体内分为初级代谢和次级代谢，经胆管排入肠道后，大部分胆汁酸会经过二次吸收进入机体，在全身脂质代谢和葡萄糖代谢中发挥关键的调控作用。已有很多研究发现胆汁酸代谢异常与包括脂肪肝、心脏病、2型糖尿病在内的多种疾病相关。因此，肠道菌群-胆汁酸调控轴成为代谢疾病临床治疗潜在的靶点。有研究显示在胰岛自体免疫疾病以及1型糖尿病儿童早期伴随有胆汁酸代谢异常和肠道菌群紊乱的特征，但胆汁酸代谢异常和肠道菌群紊乱在疾病发生的关系尚不明确。近期一篇发表在Cell Reports Medicine的研究工作，对一组后期发展为胰岛自身免疫疾病和1型糖尿病的儿童进行了前瞻性的分析，结果显示胆汁酸代谢异常与疾病的早期特征有强相关性。

胆汁酸代谢肠道菌群胰岛自身免疫相关性分析研究论文

胆囊切除术

国内团队：胆囊切除术会诱导胆汁酸代谢调节免疫细胞改善IBD

胆囊切除术（PC）是胆道外科常用的手术，部分患者术后会伴有胃肠道并发症和较高患结直肠癌的风险，但患炎症性肠病的风险并没有显著增加。近日，北京大学人民医院刘玉兰及团队在Gut Microbes发表最新研究，探究胆囊切除后对结肠炎小鼠的影响，以及PC患者粪便胆汁酸、粘膜菌群和免疫细胞间的关联，发现PC引起的次级胆汁酸积累通过抑制单核细胞/巨噬细胞的招募改善结肠炎，可能与激活LXRα相关通路有关。未来仍需进一步验证胆囊切除术与缓解结肠炎的潜在机制，值得关注。

胆囊切除术结肠炎研究论文基础研究胆汁酸代谢

益生菌

国内团队：益生菌或可激活FXR信号通路缓解胆固醇结石？

胆固醇结石的形成与胆汁中胆固醇、胆汁酸以及卵磷脂等成分的比例失调有关，导致胆汁中的胆固醇呈过饱和状态而发生成晶、析出、结聚、成石，最近研究报道，胆固醇结石与肠道菌群失调密切相关。近日，上海交通大学附属第六人民医院宛新建。上海交通大学附属第一人民医院Jingjing Wang及团队在Microbiology spectrum发表研究，发现补充两株益生菌（罗伊氏乳杆菌 CGMCC 17942和植物乳杆菌 CGMCC 14407）可有效缓解小鼠胆固醇结石，其有益作用可能和激活法尼醇X受体（FXR）信号通路有关，值得关注。

益生菌胆固醇结石胆结石研究论文基础研究

肠屏障

Science子刊：调控肠道菌群的胆汁酸代谢，或是保护肠屏障的新思路

宿主-微生物相互作用的改变与肠道通透性的增加以及疾病发病机制有关，然而肠道微生物影响上皮屏障完整性的机制仍不清楚。近日发表在Science Advances上发表的这篇文章，通过研究细菌代谢对上皮屏障完整性的影响，确定了一种与信号无关的物理化学机制——结合型胆汁酸介导的上皮屏障功能保护，并表明可利用微生物对胆汁酸代谢的合理控制以调节肠道屏障的完整性。

肠屏障胆汁酸代谢

胃癌

幽门螺杆菌感染促胃癌，缺铁或是推手

胃癌的发生是由幽门螺杆菌、宿主和环境因素之间的复杂相互作用介导的。Journal of Clinical Investigation近期发表的文章，揭示出缺铁会增加幽门螺杆菌感染引起的胃炎和胃损伤，这与胆汁酸代谢的改变高度相关，综合作用进一步促进胃癌发生。

胃癌缺铁幽门螺杆菌胆汁酸代谢

菌群-免疫互作

Nature子刊：体液免疫通过调节胆汁酸代谢维持肠道稳态

粘膜抗体通过促进宿主组织与肠腔菌群的空间隔离，以维持肠道稳态，但粘膜抗体应答如何通过调节肠道菌群组成以影响肠道健康尚未明确。Nature Communications上发表的一项最新研究结果，发现在缺失粘膜体液免疫的CD19敲除小鼠中，肠道菌群失调与胆汁酸组成异常相关，而胆汁酸代谢异常可通过增加肠道上皮细胞凋亡，以促进谷蛋白敏感性小肠肠病。该研究结果提示，粘膜体液免疫应答可通过调节肠道菌群的胆汁酸代谢，从而抑制小肠炎症性疾病。

菌群-免疫互作胆汁酸代谢体液免疫粘膜免疫肠道炎症

基因编辑

郭春君团队Cell突破：在复杂菌群中揭示单个肠菌基因功能，新方法来了

肠道菌群中，许多细菌基因是由非模式细菌编码的，因而难以通过靶向性的遗传操作去探索和验证这些基因对宿主生理的影响和机制。建立和筛选能有效针对非模式肠菌的基因操纵方法和工具，对于深入挖掘肠道细菌功能、探索细菌与宿主的互作机制，以及通过基因编辑来操控菌群以改善相关疾病，是至关重要的。Cell最新发表来自康奈尔大学郭春君团队的研究，在这一问题上取得了突破性进展。该团队开发了一套用于对非模式肠菌进行基因操纵的流程，能大规模地鉴定可进行基因转移（引入外源DNA）的肠道细菌及其方法，并建立对应的基因编辑工具，大幅拓展了可进行基因操纵的肠道细菌的范围。该团队在一项概念验证研究中，揭示了特定细菌胆汁酸代谢基因在具有复杂菌群的宿主体内的功能，并表明操纵菌群中的特定细菌基因可“撬动”菌群结构，改变宿主对特定疾病的易感性。总之，这项工作为研究肠道菌群基因与宿主的互作机制及其与疾病表型的因果关联，提供了一套强有力的工具，为进一步研发靶向性操纵肠道菌群的方法迈出了重要的一步。

基因编辑肠道菌群基础研究胆汁酸代谢结肠炎

胆结石

国内团队Nature子刊：肠道菌群如何影响胆结石形成？

胆固醇性胆结石是一种常见疾病，胆囊胆汁中的胆固醇过饱和是其发病的先决条件，而其机制尚不完全清楚。南京医科大学顾爱华、同济大学医学院张小平和蒋兆彦作为共同通讯作者，在Nature Communications发表的一项最新研究，从肠道菌群的角度进行了探索，发现脱硫弧菌目细菌的富集可促进胆固醇结石形成，并从肠肝轴的胆汁酸和胆固醇代谢的角度，阐释了菌群对胆固醇吸收、分泌和转化的调节作用。

胆结石胆固醇代谢胆汁酸代谢肠-肝轴肠道菌群

胆汁酸代谢

肠道上皮细胞的LKB1调控小鼠的胆汁酸代谢

肝激酶B1（LKB1）与多种组织中的营养感知及糖脂代谢相关。CMGH Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology上发表的一项最新研究结果，发现肠道上皮细胞中的LKB1可通过促进FGF15/19的表达，以调控小鼠的胆汁酸代谢。

胆汁酸代谢 FGF15/19 研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）

微生物结构变异

傅静远等Cell子刊：从微生物遗传组成的维度，解析人肠道菌群与胆汁酸代谢的关系

荷兰格罗宁根大学医学中心傅静远教授及团队在Cell Host & Microbe发表文章，整合了荷兰LifeLines-DEEP（LLD）和300-Obesity（300-OB）两个人群队列共计1437名受试者的肠道微生物宏基因组、胆汁酸代谢谱以及多维度表型数据，以微生物基因组结构变异（SV）为切入点，系统探究了肠道微生物遗传组成与胆汁酸代谢的关联。有趣的是，肠道微生物遗传组成关联和相对丰度关联之间的重叠较少，表明SV作为一个新的数据维度，可以提供菌群组成无法反映的额外信息，值得深入挖掘。

微生物结构变异胆汁酸代谢研究论文 human gut microbiome bile acid metabolism

胆汁酸代谢

国内团队：调节胆汁酸代谢或可用于治疗癌症恶病质

癌症恶病质是一种多因素的代谢综合征，胆汁酸代谢可能参与其中。华东师范大学的章雄文团队与上海中医药大学的刘璇团队在Journal of Cachexia, Sarcopenia and Muscle上发表的一项最新研究，在接种C26结肠癌细胞诱导的癌症恶病质小鼠模型中，观察到胆汁酸代谢失调，表现为肝脏胆汁酸合成酶表达下调、总胆汁酸及共轭胆汁酸增加、菌群胆汁酸代谢减少。在癌症患者中，也可观察到共轭胆汁酸的比例上调。另外，通过口服牛磺熊去氧胆酸以调节小鼠的胆汁酸可缓解癌症恶病质。

胆汁酸代谢研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）癌症恶病质

长寿

Nature聚焦百岁老人肠道菌群：一组特殊的胆汁酸或助长寿

长寿肠道菌群胆汁酸代谢次级胆汁酸抗菌机制