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新型RNA病毒
文章数:2篇
新型RNA病毒
港城大开发新型RNA病毒的序列检测工具VirBot
本研究,作者开发了VirBot,这是一个简单而有效的RNA病毒识别工具,其基于蛋白质家族和相应的自适应比对分数阈值。作者在模拟和真实的测序数据上,对比测试了其他七种流行的病毒检测工具,VirBot在宏基因组数据集中显示出较高的精确率,在检测新型RNA病毒方面显示出卓越的灵敏度。并且作者在Github上提交了相关代码,使用指南,和测试数据, https://github.com/GreyGuoweiChen/RNA_virus_detector。
新型RNA病毒
序列检测
宏基因组数据
蛋白家族数据库
比对分数
牡蛎
iMeta:国内团队利用病毒组揭示牡蛎体内新型RNA病毒
本研究基于前期获得的牡蛎病毒组数据(DOV),对其中的18条接近全长的RNA病毒基因组进行了深入分析,发现了sobemo-like viruses和Weiviruses之间重组的证据以及两种在牡蛎样本中高丰度且广泛存在的picobirnavirus,研究结果为牡蛎相关病毒研究和病原鉴定提供了重要的参考依据。
牡蛎
病毒组
新型RNA病毒
基因重组
噬菌体