大肠杆菌菌株多样性

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大肠杆菌菌株多样性

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菌株水平的宏基因组分析

单基因长读长测序阐明了人类肠道菌群中的大肠杆菌菌株动态

肠道菌群因其与健康和疾病的密切关系而备受关注。细菌的基因含量通常不同，导致物种内的功能变异，因此，在生态学和临床意义上，需要比物种水平方法更高的分辨率。本研究中，作者使用高度多样化的细菌鞭毛蛋白基因作为长读长测序中的标记，开发了一种以高分辨率分析菌群中菌株组成的方案，并阐明了人类肠道中详细的种群结构和主要的大肠杆菌菌株更新。

菌株水平的宏基因组分析人体肠道菌群大肠杆菌菌株多样性扩增子序列变异 (ASV)