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病毒预测
文章数:1篇
深度学习
吉林大学团队开发了基于深度学习方法的宏基因组病毒序列分类方法Virtifier
为了进一步提高从宏基因组数据中识别短病毒序列的性能,本文提出了一种基于深度学习的方法Virtifier。Virtifier在CAMI数据集和真实人体肠道宏基因组中的应用证明,它在识别长度小于500bp的病毒序列方面优于VirFinder、DeepVirFinder和PPR Meta。宏基因病毒序列检测是病毒分析的第一步,它对接下来的病毒分析工作有重大影响。Virtifier将在病毒分类和病毒性疾病检测领域发挥重要作用。Github上提供了Virtifier的Python实现和为本研究开发的Python代码 https://github.com/crazyinter/Seq2Vec 。
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