病毒序列

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文章数：4篇

马迎飞团队Nature子刊：揭示人肠道古菌病毒多样性

中国科学院深圳先进技术研究院马迎飞团队近期在Nature Communications发表研究，对人类肠道中的古菌和古菌病毒进行了全面的宏基因组数据挖掘。研究结果表明，人肠道古菌和古菌病毒存在很高的多样性，本研究鉴定的新的人肠道古菌病毒填补了相关的知识空白，并可作为人肠道古菌病毒组的扩充，本研究将为深入了解人体肠道内古菌病毒的多样性和蛋白功能提供前所未有的见解，以供人们更好地了解人类肠道生态系统，该文为人类肠道菌群的研究提供了新视角。

宏基因组肠道古菌病毒组噬菌体蛋白功能病毒簇

吉林大学团队开发了基于深度学习方法的宏基因组病毒序列分类方法Virtifier

为了进一步提高从宏基因组数据中识别短病毒序列的性能，本文提出了一种基于深度学习的方法Virtifier。Virtifier在CAMI数据集和真实人体肠道宏基因组中的应用证明，它在识别长度小于500bp的病毒序列方面优于VirFinder、DeepVirFinder和PPR Meta。宏基因病毒序列检测是病毒分析的第一步，它对接下来的病毒分析工作有重大影响。Virtifier将在病毒分类和病毒性疾病检测领域发挥重要作用。Github上提供了Virtifier的Python实现和为本研究开发的Python代码 https://github.com/crazyinter/Seq2Vec 。

深度学习病毒序列分类器宏基因组病毒预测

Nature子刊：直接从宏基因组识别病毒序列

一项重要的宏基因组方法学研究，提出了直接从宏基因组中识别病毒序列的新方案，值得关注，特别推荐。

宏基因组病毒序列病毒聚类 Michiel Kleerebezem Michiel Kleerebezem

宏基因组学

孙凤珠等：从宏基因组数据中更有效“捞出”病毒数据的方法

这是美国南加州大学孙凤珠团队开发的机器学习方法，能够在宏基因组数据中更准确鉴定出病毒数据，很酷的生物信息学突破，特别推荐！

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