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文章数：3篇

宏基因组组装基因组 (MAGs)

国内团队：基于宏基因组测序数据组装方法的基准测试

宏基因组组装是一种利用宏基因组测序数据重建微生物基因组的有效方法，多种组装工具也被开发用于简化组装并解决微生物基因组中序列重复的问题。然而，目前还没有对宏基因组测序技术进行全面评估，也缺乏选择合适的宏基因组组装工具的实用指南。近日，香港浸会大学张璐及团队在Briefings in Bioinformatics发表最新研究，使用由一系列测序技术生成的32个宏基因组测序数据集，对19种主流组装软件工具进行了全面的基准测试，发现通过杂合组装是提高总组装长度、获得近乎完整MAGs有希望的方法，值得关注。

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StrainXpress：一种针对宏基因组数据快速准确的组装方法

随着下一代测序技术的发展以及测序成本的降低，多种组装方法已经被开发在物种水平上识别和重建基因组。然而，它们在菌株水平上区分基因组的能力仍有很大的改进空间。近日，研究人员在Nucleic Acids Research发表最新研究，他们开发了StrainXpress工具，基于OLC（overlap-layout-consensus）算法从头组装，可以快速准确地从宏基因组数据中组装出单个基因组，通过模拟和真实数据也证明StrainXpress工具重建菌株特异性序列的数量优于当前最先进的方法，值得相关人员关注和测试。

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Nature之刊：基于HiFi数据的三代宏基因组组装工具hifiasm-meta

宏基因组样品的从头组装是探究微生物群落的常用方法，近日，李恒团队在Nature Methods上发表最新研究，在hifiasm的基础新开发了hifiasm-meta（https://github.com/lh3/hifiasm-meta）工具，一种针对HiFi数据的高准确性宏基因组组装软件。在真实数据集上评估了三个HiFi宏基因组组装软件，Hifiasm-meta可以很好的重构其他组装软件发现的大多数高质量的contigs，同时在接近完整的contigs中，Hifiasm-meta的组装效果优于HiCanu和metaFly，值得相关生信人员关注和尝试。

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