序列读长

搜索
登录

序列读长

文章数：1篇

长读长和短读长宏基因组测序技术恢复的MAGs有何差异？

随着测序技术和生信方法的进步，短读长和长读长测序技术间的差距逐渐缩小。从短读长到长读长宏基因组方法的转变是否会在MAG恢复方面引入偏差以捕获微生物种群的遗传潜力如何尚不清楚。近日，马克斯普朗克海洋微生物学研究所研究人员在Microbiome发表最新研究，比对了长读长和短读长宏基因组测序技术在恢复MAGs方面差异，发现短读长技术比长读长回收了更多的MAGs和更多物种，而长读长样本产生了更高质量的MAG和相似的物种组成。此外，还发现尽管可以在高和低GC含量的MAG中观察到差异，但两种技术回收的群体基因组相对丰度相似，值得关注。

测序技术宏基因组组装基因组 (MAGs) 研究论文基础研究序列读长