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Brian W Ji
文章数:2篇
微生物生态学
Nature子刊:用宏观生态动力学表征肠道菌群
肠道菌群是一种动态的生态系统,但我们目前对控制微生物动力学的生物学过程仍然知之甚少。Nature Microbiology近期发表的一项研究,利用宏观生态学方法分析人和鼠的肠道菌群时序数据,表明如同其他的宏观生态系统一样,肠道菌群的动态也可以通过多种定量关系来表征,并利用观察到的宏观生态关系鉴定了受环境变化影响的特定细菌类群。
微生物生态学
Microbial communities
Ecological modelling
microbial ecology
生态建模
宏基因组
Nature子刊:宏基因组研究中取样和技术重复对时间和空间下物种丰度变化的影响
宏基因组测序已经能够对不同的微生物群落进行详细调查,但了解它们的时空变异仍然是一个重要的挑战。本文采用绝对定量、技术重复、不同取样部分的连续时间实验,经过方差分解法确定了各影响因素对不同丰度OTU丰度变化的影响大小,对我们研究中差异OTU的选择、丰度与差异可视度的关系、结果的评估有非常好的参考和借鉴意义。
宏基因组
Shivani Sahni
Courtney L Millar