细菌群落

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细菌群落

文章数：6篇

细菌相互作用

Science：群落中的细菌很少一起合作（观点）

细菌通常生活在不同的群落中，每个物种都会影响其他物种的生长和生存。这些物种间的相互作用是细菌生态学的核心，对健康、农业和工业有着不同的影响。因此，为了理解和控制细菌群落，了解物种如何相互作用至关重要。发表在Science上的一项观点认为，不同细菌群落中的细菌间存在广泛的负相互作用并占主导地位，并且随着群落中细菌多样性的改变，细菌间的相互作用亦随之改变，并指出细菌种内或种间的相互作用可被合理用作应对抗生素耐药性危机的一种策略。

细菌相互作用微生物竞争细菌群落

Strainberry：使用长读长在低复杂度宏基因组中自动分离菌株

该研究，作者提出了一种使用易错配的长读长技术在低复杂度宏基因组中执行菌株分离的方法。其利用最先进的工具进行变体识别、单倍型定相和基因组组装，作者提出了一个名为 Strainberry 的自动化流程。它以比其他最先进的长读长组装工具更高的质量实现了菌株的单样本组装。Strainberry 结合了忽视菌株的组装程序，精心使用了长读长变体识别和单体型工具，然后是一个执行长读长宏基因组scaffolding的组件。作者在合成群落和真实样本上测试，结果表明其对现有长读长宏基因组样本的重新分析揭示了未表征的菌株。作者预计这项工作将成为在更复杂的环境中进一步改进菌株水平的宏基因组组装方法的起点。

长读长宏基因组组装菌株分离细菌群落 N50

抗生素抗性基因(ARG)

浮丝藻水华促进抗性基因传播转移

我们对蓝藻水华对抗生素抗性基因(ARG)的传播富集及人类健康的影响知之甚少，浙江工业大学钱海丰组联合城市环境研究所苏建强组研究了太湖蓝藻水华对ARG组成的影响。本研究结合野外监测与室内模拟验证实验发现并验证了浮丝藻水华期驱动淡水水体抗生素抗性基因的多样性的改变，表明，蓝藻水华是淡水中ARG扩散和富集的关键驱动因素之一。本研究结果对于确定全球淡水湖泊的生态风险非常有用，并为ARG和耐药菌的生态进化以及更全面的水质评价和管理提供了参考。

抗生素抗性基因(ARG) 蓝藻水华细菌群落移动遗传元件(MGE) 共培养

土壤微生物组

南土所：大空间尺度下，空间比季节对土壤菌群的影响大

土壤微生物的群落结构会受到时间和空间的共同影响。然而，鲜少有大尺度范围的研究在相同的采样点多时间采样的。中国科学院南京土壤研究所褚海燕与团队的研究中，作者通过对华北平原小麦主产区约878km大尺度范围内土壤细菌群落和真菌群落的时空变异进行研究，发现空间距离对微生物群落结构影响远大于季节变化，且土壤微生物群落的季节变异主要是通过影响快速变化的环境变量来驱动的。由于微生物的季节变异能够被快速变化的环境变量所解释，因此，研究者推测大尺度范围内微生物的空间分布规律可以通过单次采集的数据集获取。

土壤微生物组细菌群落真菌群落空间季节

胞外酶-化腐朽为神奇的催化剂

堆肥是一个极其复杂的物理化学变化过程，其包含着微生物群落的演替与复杂有机成分的降解，本文通过在不同初始C/N的堆肥堆中监测堆肥过程中（升温期，高温期，腐熟期）关键细菌群和胞外酶的演替过程以及有机物的转化，详细阐明了特定细菌群驱动的高效堆肥的特性和机理，确定了最佳C/N的范围及促进高效堆肥的潜在的关键微生物种类。作者对堆肥整个过程的每个时期都进行了详实的解读，通读本文能使我们对整个堆肥工艺有更深入的了解。

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土壤微生物群落的特征究竟由什么决定

时势造英雄，还是英雄造时势，作者开启灵活大胆的思维方式运用巧妙的实验构思设计，通过一番“玩泥巴”的骚操作严密谨慎全面的论证了“时势造英雄”的观点，使我们更进一步了解了土壤细菌群落产生和维持的机制，表明了土壤的pH值是影响重建新细菌群落的主导因素，最终得出土壤微生物群落的组成和功能主要取决于土壤性质，而不是微生物接种物的观点，实验设计新颖巧妙，VPA分析等结果说服力强，最后提出一“橄榄球”模型“画龙点睛”之笔深入浅出地说明了问题。

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