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mNGS
文章数:1篇
加标引物
Nature子刊:低成本的靶向富集病毒的宏基因组测序方法(MSSPE)提高病毒诊断效率
本文开发了带有靶向引物富集(MSSPE)的宏基因组测序,该方法可富集目标RNA病毒序列,同时保留对其他病原体的宏基因组敏感性。本文对14种不同病毒的进行了评估,结果显示,与仅用mNGS相比,其基因组含量增加了10倍,平均值覆盖度增加了47%(±16%)。值得注意的是,利用MSSPE成功富集了未被预先特异性靶向的重新出现和/或共感染病毒(包括Powassan和Usutu)的序列。MSSPE简单,低成本,快速并且可部署在台式或便携式纳米孔测序仪上,从而使该方法直接适用于诊断实验室和现场使用。
加标引物
宏基因组测序
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mNGS
RNA病毒