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系统发育分析

VBCG：经验证的20个核心基因集，可提高系统发育分析？

系统基因组分析已成为细菌多样性和进化研究中不可分割的一部分，许多不同的细菌核心基因已被整理并用于系统基因组树重建。然而，这些基因的选择是基于它们在所有细菌基因组中的存在和单拷贝比率，而忽略了基因的“系统发育保真度”。近日，伊利诺伊理工大学研究人员在Microbiome发表最新研究，提炼出经过验证的20个核心基因集，用于提高系统发育分析的保真度和分辨率。此外，还开发了一个Python流程和桌面应用程序，用于自动重建系统基因组树，值得关注。

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