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CheckM2
文章数:1篇
CheckM2
Nature子刊:利用机器学习评估微生物基因组质量的工具CheckM2
基因组组装或者Binning获得的基因组草图,首先需要评估其质量,包括基因组完整度、污染度、序列分布等信息,其中CheckM是最常用的工具之一。近日,昆士兰大学研究人员在Nature Methods发表了最新生信工具CheckM2。CheckM2比现有方法更快、更准确,当应用于新的谱系和基因组大小减少的谱系时,它的性能优于现有方法,如Patescibacteria和DPANN超级门,值得关注。
CheckM2
宏基因组组装基因组 (MAG)
研究论文
基础研究
机器学习