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微生物物种
文章数:2篇
疾病诊断
朱立新+刘占举+朱瑞新等:基于肠菌基因的炎症性肠病AI诊断模型
炎症性肠病与肠道菌群关系非常密切,可作为一种有前途的非侵入性诊断工具。近日,同济大学朱瑞新、中山大学六院朱立新、上海市第十人民医院刘占举、中山大学附属第六医院贺青及团队在Gut Microbes发表最新研究,整合了来源于多中心的CD和健康对照共1418例样本的粪便微生物测序数据,全面描绘了CD患者中微生物多维度特征的变化模式,利用AI构建了微生物多维度诊断模型,评估了各个维度特征诊断潜能的优劣,以鉴定最优诊断模型,并验证其疾病特异性,值得关注。
疾病诊断
人工智能
研究论文
基础研究
微生物物种
MetaPhlAn
Nature子刊:MetaPhlAn再度更新,这次有何新特征?
MetaPhlAn是针对宏基因组数据进行微生物分类分析最常用的工具之一,近年来也逐渐更新扩展到第三版。近日,意大利特伦托大学研究人员在Nature Biotechnology发表最新研究释放了MetaPhlAn4版本,MetaPhlAn4整合了来自分离株和宏基因组组装的基因组的信息,可以在SGBs水平对物种进行鉴定和丰度定量,此外,MetaPhlAn4在分析灵敏度、特异性、微生物多样性以及未知物种与疾病和饮食标记物相关性等方面都进行了显著扩展,值得相关人员进一步测试。
MetaPhlAn
宏基因组
研究论文
基础研究
微生物物种