细菌系统发育

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16S rRNA 基因

使用16S rRNA基因推断细菌系统发育需谨慎

使用16S rRNA基因推断系统发育是当下微生物组研究中最常用的分析方法之一，然而最新发表于Microbiome的一项研究指出，16S基因及其可变区的系统发育一致性远不及由核心基因构建的系统发育关系，导致了一些多样性指标被扭曲，尤其是在属水平内，建议将来系统发育相关分析中尽量使用全基因组或结合其它标记位点。

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