差异丰度推断

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差异丰度推断

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用于从16S微生物组数据进行差异丰度推断的R包—Prokounter

目前，使用高通量16S rRNA标记基因分析微生物组数据很有吸引力，但16S测序也产生了大量虚假的微生物分类群。近日，丹娜法伯癌症研究院人员在Genome Biology发表最新研究，开发了一款R包Prokounter（https://github.com/mskb01/prokounter），用于调查各级别16S测序微生物数据的高度灵活差异丰度推断，从样本到特定分类群。总之，本研究提出了一种灵活的方法，并被证明可以克服目前丰度差异推理方法所注意到的混淆问题，值得相关人员尝试。

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