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校正工具
文章数:1篇
校正工具
用于校正微生物组数据中批次效应的新工具—PLSDA-batch
多项研究发现微生物组数据很容易受到批次效应的影响,现有的批次效应校正方法主要是针对基因表达数据开发的,没有很好地考虑微生物组数据的固有特征。近日,澳大利亚墨尔本大学研究人员在Briefings in Bioinformatics发表最新研究,开发了一种基于偏最小二乘判别分析(PLSDA)的多变量和非参数批量效应校正方法PLSDA-batch(https://github.com/EvaYiwenWang/PLSDAbatch),在真实和模拟数据中发现该工具在保留处理差异的同时可以有效消除批量差异,值得进一步测试。
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