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文章数:2篇
metaMDBG
Nature子刊:适用于PacBio HiFi数据组装的工具metaMDBG
长读长测序技术,如PacBio HiFi,正在迅速成为基因组学研究的新黄金标准。近日,研究人员在Nature Biotechnology发表最新研究,开发出metaMDBG,一个基于MDBG的长而准确的宏基因组读取组装工具,相比现有的工具,metaMDBG组装速度更快,占用内存较小,实测性能较好,值得关注。
metaMDBG
HiFi测序
研究论文
基础研究
宏基因组
从头宏基因组组装
MetaPlatanus:宏基因组二三代测序混合组装工具
本研究报告了一个混合宏基因组组装工具,MetaPlatanus。作者用短读长和长读长进行了基准测试,发现与现有的组装工具相比,MetaPlatanus 可以组装更多具有生物学重要元素的区域,例如基因、基因簇、病毒序列和近乎完整的基因组。总之,作者研究表明 MetaPlatanus 可能是探索宏基因组大规模结构的有效方法。
从头宏基因组组装
重叠群
物种特异性序列组成
覆盖深度
基准测试