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Jacob T Barlow
文章数:2篇
微生物富集法
Nature子刊:微生物富集法或可助力处理高宿主率宏基因组样本?
宿主-微生物互作已经通过微生物分类分析与健康和疾病状态联系起来,主要是通过16S rRNA基因测序。然而,许多机制的见解仍然难以捉摸,部分原因是研究与哺乳动物组织相关的微生物基因组是困难的,因为这些样本中宿主与微生物DNA的比例很高。近日,美国加州理工学院研究人员在Nature Methods发表最新研究,描述一种微生物富集法,利用宿主和细菌细胞间的大小差异,利用机械应力(头部敲打)结合选择性裂解方案,进而有效去除高宿主率样本,在多个样本中测试性能较好,值得关注。
微生物富集法
宏基因组样本
研究论文
基础研究
高宿主污染
小肠菌群
分析小肠菌群绝对丰度,揭示潜在的SIBO“幕后黑手”
小肠菌群及其与人类疾病的关系尚未得到充分研究。Microbiome近期发表的一项研究,提供了迄今为止人类十二指肠菌群绝对丰度的最大数据集,揭示了口腔菌群与十二指肠菌群的关系,鉴定出与小肠细菌过度生长(SIBO)及胃肠道症状相关的一组十二指肠细菌。这些发现强调了菌群绝对丰度在研究小肠健康和功能方面的价值,为研究SIBO等消化道疾病的机理带来了新启示。
小肠菌群
十二指肠菌群
小肠细菌过度生长