小肠菌群

益生菌小肠菌群研究论文基础研究致病菌

小肠是机体吸收营养的主要部位，但目前小肠菌群却仍是一个亟待探索的领域。当下对小肠菌群的研究主要受限于样本的采集，目前只能通过外科手术或清除肠道内容物后使用内窥镜等手段实现样本采集。近期Cell Host & Microbe杂志上发表了一篇资源型论文，通过患者腹壁上的人工开孔（造口）实现了对人类小肠菌群样本的采集，证实了来自小肠造口的样本是小肠菌群的代表；随后在宏观（物种构成和多样性）和微观层面（菌株多样性和基因选择压力）研究了小肠菌群的时间同动态性和与饮食有关的波动性，重点是发现了小肠中微生物群体可以通过改变亚株（sub-strain）的比例来适应小肠中不断变化的环境，从而防止整个物种灭绝。总之，该研究提供的资源和结果为研究肠道疾病中宿主与小肠菌群的相互作用，以及新治疗方法的开发法奠定了基础。

小肠菌群菌群波动性

克罗恩病

克罗恩病患者的小肠菌群变化

克罗恩病（CD）可影响整个肠道，但大多数研究使用粪便样本对菌群进行分析。Gut上发表的一项最新研究结果，通过刷检及活检采样，对比鉴定了克罗恩病患者与健康对照的小肠（包括十二指肠及回肠）黏膜菌群的多样性及组成差异。

克罗恩病研究论文小肠菌群

昼夜节律

Cell子刊：高脂饮食破坏回肠菌群和基因表达的节律性，限食进食来改善

Cell Reports发表的这项小鼠研究表明，不限时间的高脂饮食会使小肠（回肠）菌群和宿主基因表达丧失昼夜节律变化，而限时进食可部分恢复这些有害变化，包括恢复回肠菌群震荡、昼夜节律基因、胆汁酸信号和GLP-1调节。

昼夜节律小肠菌群限时进食高脂饮食胆汁酸

减肥手术

减肥手术如何影响小肠细菌来改善代谢？

垂直袖状胃切除术（VSG）能有效治疗肥胖症，有研究表明其疗效与大肠中的菌群变化有关，而小肠菌群的变化和作用尚不清楚。Molecular Metabolism发表的一项小鼠研究，揭示了VSG手术后小肠菌群的变化在改善代谢中的作用。该研究发现，手术后小肠中的乳杆菌属细菌增多，乳杆菌通过生成乳酸，促进了HIF2α信号通路活化，从而改善小鼠的代谢健康。

减肥手术小肠菌群乳杆菌 HIF2α 肥胖

小肠菌群

分析小肠菌群绝对丰度，揭示潜在的SIBO“幕后黑手”

小肠菌群及其与人类疾病的关系尚未得到充分研究。Microbiome近期发表的一项研究，提供了迄今为止人类十二指肠菌群绝对丰度的最大数据集，揭示了口腔菌群与十二指肠菌群的关系，鉴定出与小肠细菌过度生长（SIBO）及胃肠道症状相关的一组十二指肠细菌。这些发现强调了菌群绝对丰度在研究小肠健康和功能方面的价值，为研究SIBO等消化道疾病的机理带来了新启示。

小肠菌群十二指肠菌群小肠细菌过度生长

IBD

炎症性肠病患者的小肠菌群组成及代谢潜能

Journal of Crohn's and Colitis上发表的一项最新研究，描述了IBD患者的小肠菌群的组成和代谢潜能，并发现IBD患者（尤其是小肠切除的）的结肠菌群与小肠菌群具有相似性，而且小肠菌群中的几个特征也在之前的报道中与IBD相关。表明研究小肠菌群或有助于揭示IBD病理发生的机制。

IBD 研究论文队列研究小肠菌群

胆汁酸

小肠TCDCA-FXR轴调控局部营养素感应和糖耐受

研究对大鼠进行营养素（比如油酸、葡萄糖）注射，测定上小肠和回肠部位葡萄糖的耐受度；并通过菌群移植的方法检测肠道菌群对局部营养素感应葡萄糖调控途径的调节作用。研究结果显示，TCDCA-FXR轴在此过程中发挥了必要作用。

胆汁酸血糖调控小肠菌群牛磺鹅去氧胆酸小肠

菌群移植

王军军+魏泓+赵江潮：全肠菌群移植或比粪菌移植更精准

肠道菌群在整个肠道中的分布呈现明显的区室化特征，即不同肠段有不同的菌群组成和功能。近年研究已经表明，粪便菌群一定程度上能代表大肠肠腔内的菌群，而与其它肠段（如小肠）的菌群有明显差别，因此目前的常规粪菌移植（FMT）可能仅对大肠菌群有明显的干预作用，而对有潜在重要生理功能的小肠菌群可能影响甚微。Microbiome最新发表了来自中国农业大学王军军、华中农业大学魏泓和美国阿肯色大学赵江潮与团队的研究，首次证明了不同肠段的菌群定植具有区域特异性，即源于大肠的菌群易定植于大肠，而小肠的菌群易定植于小肠。该研究进一步对比分析了FMT和全肠菌群移植（WIMT，空肠、回肠、盲肠和结肠的菌群组合）在塑造无菌小鼠特定肠段菌群方面的差异，表明WIMT更有助于小肠菌群的植入。因此，WIMT或能作为FMT的替代方法，对整个肠道不同区域的菌群进行更为精准和靶向性的干预。

菌群移植全肠菌群移植粪菌移植空间异质性小肠菌群

血糖调控

小肠菌群如何影响胰岛素敏感性？

在2型糖尿病患者中，血液牛磺酸结合型胆汁酸水平的升高与胰岛素抵抗相关，而结合型胆汁酸的水平受到小肠菌群的调控。Gut近期发表的一项研究表明，短期高脂喂养可通过改变小肠菌群，升高牛磺鹅去氧胆酸（TCDCA）的水平。而TCDCA能活化迷走神经背核簇（感知胰岛素并调控血糖稳态的脑干区域）中的法尼酯X受体（FXR），从而对胰岛素作用造成不良影响。因此，在肠道菌群对宿主胰岛素敏感性的调控中，TCDCA-FXR轴有重要作用，而抑制TCDCA诱导的FXR活化，或是逆转胰岛素抵抗的潜在治疗策略。

血糖调控小肠菌群胆汁酸法尼酯X受体肠-脑轴

昼夜节律

Cell：饮食组成及进食节律调控小肠菌群、免疫及屏障功能

在一天的24小时里，小肠暴露于不同的食物及菌群抗原中，但仍维持免疫稳态，在遗传易感性个体中，这一平衡的破坏可能导致克罗恩病。Cell最新发表了来自以色列魏茨曼科学研究所Eran Elinav团队和Hagit Shapiro团队的最新合作研究，发现饮食组成及进食节律可通过调控小肠菌群的周期性变化，介导小肠上皮细胞（SIEC）中的MHCII表达的昼夜震荡，从而影响小肠的IL-10分泌及上皮屏障功能的节律。破坏上述饮食-菌群-SIEC MHCII-IL-10-上皮屏障轴的节律可恶化小鼠的克罗恩病样肠炎，对该轴的调控或可作为未来克罗恩病干预的潜在策略。

昼夜节律小肠菌群小肠上皮细胞肠道免疫饮食-菌群-免疫互作

自身免疫性疾病

Nature：两株小肠细菌组队，恶化神经炎症

在多发性硬化等自身免疫病中，一些肠道微生物可诱导疾病的发生、影响疾病严重程度。Nature最新发表了来自日本理研综合医学科学中心Hiroshi Ohno团队的研究，发现两株小肠细菌的组合会加剧多发性硬化模型小鼠的症状。这些发现提示，在研究肠道菌群在自身免疫病中的作用时，需要考虑不同微生物之间的协同作用，而且小肠菌群对自身反应性T细胞的调控可能在相关疾病中起关键作用，这对未来的菌群研究取样提出了更高的要求。

自身免疫性疾病小肠菌群交叉反应协同作用多发性硬化

食粪性

食粪性显著影响小鼠上消化道菌群和胆汁酸谱

小鼠肠道菌群研究中非常重要的模式生物，但是小鼠与人体的实际情况仍有不小的差异。Microbiome近期发表一项研究，首次系统地分析了食粪性对小鼠消化道不同部位菌群的组成和功能的影响，发现小鼠小肠的菌群和胆汁酸谱明显受到食粪行为的影响，而非食粪小鼠的情况则与人类更为接近。这些发现提示，研究小肠菌群时，需要注意模式动物食粪性对研究结论的影响。

食粪性小肠菌群 Microbial quantification Metabolomics analyses mouse models

胃肠道菌群

Cell子刊：消化道菌群的区域多样性（综述）

从口腔至肛门，消化道的不同区域有不同的生理特征，塑造了具有不同组成和功能的菌群。Cell Host and Microbe近期发表一篇重磅综述，充分介绍了消化道不同部位的菌群组成和功能，以及对其有影响的宿主因素，并讨论了与区域性菌群有关的疾病和该领域面临的挑战，值得专业人士关注。

胃肠道菌群口腔菌群食管菌群胃菌群小肠菌群

功能性胃肠疾病

Nature子刊：功能性胃肠病相关的肠道菌群失调

小肠细菌过生长与功能性胃肠病有关。《Nature Communications》近期发表研究，发现功能性胃肠疾病患者的小肠菌群发生了改变，且低纤维、高糖饮食可能有助于病症恶化。该结果对于开发针对性菌群干预、饮食干预手段具有参考价值。

功能性胃肠疾病小肠菌群菌群失调 Jia Sun Li‐Long Pan

小肠菌群

以FXR为靶改变胆汁酸合成，可调控小肠菌群

小肠在人体生理中有重要作用，但小肠菌群的研究一直比较缺乏。近期Gastroenterology上线一项人体+小鼠研究，表明用胆汁酸类似物奥贝胆酸（OCA）激活胆汁酸受体FXR，可抑制内源性胆汁酸合成，从而影响小肠菌群的组成。该研究为开发小肠菌群标志物、精准调控小肠菌群用于疾病防治，提供了新思路。

小肠菌群 gene regulation Genetics Metabolism nuclear hormone receptor

小肠菌群

Cell子刊：小肠菌群促进饮食脂质的消化吸收

Cell Host and Microbe[IF：14.946]发表的最新研究表明，小肠菌群是饮食信号的关键转化者，促进宿主对脂质的消化和吸收。高脂饮食诱导的空肠菌群，可直接促进肠粘膜的脂质吸收，对营养过度和营养不良有潜在影响。这些发现或能为治疗肥胖带来启示。

小肠菌群脂质消化吸收 Gut microbiota small intestine high-fat diet

肝硬化

李兰娟团队：肝硬化病人的小肠菌群有何特征？

李兰娟院士和团队近期发表在Scientific Reports上又一篇关于肝硬化的肠道菌群的文章，推荐一读。

肝硬化十二指肠小肠菌群 Cheryl P Andam Michael G Campana

消化不良

Gut：消化不良与菌群：是时候关注小肠了

Gut这篇Letter，短小，但其实说了肠道菌群研究的“难言之隐”或是“皇帝的新装”，那就是受限于取样方法，菌群研究主要关注于粪菌，而小肠中的菌群往往不被重视，但可能起到重要的生理学作用，为此，是时候重视小肠菌群研究了！

消化不良质子泵抑制剂（PPI）小肠菌群十二指肠粘膜 Marisol Aguirre

寄生虫感染

PLoS One：寄生虫和营养限制如何影响小肠菌群？

① 寄生虫感染与营养物质可分别影响肠道菌群的组成及相对丰度，但两者的组合效应尚未被研究；② 寄生虫感染减少了十二指肠菌群的多样性及丰度；③ 寄生虫感染与营养限制的组合相比于单独的寄生虫感染，菌群的多样性及丰度增加，但感染程度未受影响；④ 营养限制后的动物十二指肠菌群的多样性及丰度最高；⑤ 在寄生虫感染的动物中，相比于营养限制后的动物，菌群的改变与免疫反应的改变更加相关。

寄生虫感染营养限制小肠菌群 Gagandeep Kaur Gagandeep Kaur