gene regulation

Annual Review of Nutrition发表的这篇文章同样聚焦RNA与营养调控的相互作用，重点关注非编码小RNA在机体代谢过程的表现。这些小RNA分子可以干预营养相关代谢通路。同时，机体也可以通过膳食摄入一些小RNAs分子，进而影响机体状态。但是肠道菌群在此过程的作用研究并不深入。虽然有这些发现，关于小RNA于机体营养调控还存在很多争议和疑问点，需要进一步研究。

非编码RNAs microRNA Diet Nutrition Metabolism

长寿

Nature子刊：肠上皮中的一种小RNA或是寿命调节的关键

遗传因素及环境因素均影响寿命，但背后的机制尚不清晰。Nature Communications上发表的一项最新研究，在果蝇中鉴定出一种可延长寿命的核仁小RNA——Jouvence。Jouvence在肠道上皮细胞中表达，缺失Jouvence的果蝇表现出肠道增生及寿命缩短，而在肠道上皮细胞中过表达Jouvence可延长果蝇的寿命。Jouvence可能通过促进假尿苷修饰维持核糖体的稳定及功能，并提高果蝇对各种压力的抗性。进一步研究发现，Jouvence的结构及功能在进化中十分保守，在小鼠及人中均存在其同源物，提示Jouvence可能也在哺乳动物的寿命调节中发挥作用。

长寿 Gene expression analysis gene regulation small RNAs 核仁小RNA

囊性纤维化

囊性纤维化患者的宿主-肠道菌群互作

囊性纤维化（CF）是白种人中常见的常染色体隐性遗传病，早发性大肠癌是CF患者的一个潜在并发症。Genome Medicine近期发表的一项研究，分析了CF患者结肠粘膜的基因表达和菌群组成的变化，以及二者间的关联，表明宿主-微生物互作可能在CF大肠癌的发病机制中有关键作用。这些结果为CF患者的大肠癌风险预测，提供了潜在的生物标志物。

囊性纤维化结直肠癌 cystic fibrosis Host-microbe interactions gene regulation

肠道干细胞

代谢调节因子LKB1调控肠道干细胞命运

LKB1调控干细胞和细胞代谢，但其对肠道干细胞稳态的调控作用未知。Gastroenterology近期发表的文章，发现肠道干细胞中，LKB1通过PDK4抑制ATOH1的转录，从而限制肠道干细胞向分泌系分化，维持肠道干细胞稳态。研究建立了代谢和肠道干细胞命运分化之间的联系。

肠道干细胞 gene regulation renewal mitochondria DCA

结直肠癌

前列腺素E2促进结直肠癌转移的机制

前列腺素E2可促进结直肠肿瘤形成，但机制尚未明确。Gastroenterology上发表的一项最新研究，发现前列腺素E2可通过增加特定miRNA——MIR675-5p的表达，以降低p53蛋白的表达，从而促进结直肠肿瘤在小鼠体内的转移。在结直肠癌患者中，MIR675-5p的表达与更短的生存期相关。

结直肠癌 gene regulation tumor suppressor post-transcriptional modification Inflammation

胃癌

南京医科大学：中国人群胃癌易感基因分析

为综合描述中国胃癌易感基因特征，南京医科大学靳光付团队在Gut上最新发表研究，荟萃分析了四个全基因组关联研究，结合其他五项研究，共分析了中国人群中10806例胃癌及13749例对照。通过靶向测序、功能注释、体内外实验等方式，破解了5p13.1和10q23.33位点的基因突变影响胃癌发生发展的机制。

胃癌 gene regulation Genetics Mutation stomach cancer

炎症性肠病

于政权+刘占举等：MIR31可减轻小鼠结肠炎

MIR31是一种microRNA，其表达水平在炎症性肠病（IBD）患者的肠道组织中升高，《Gastroenterology》近期发表了中国农业大学于政权与上海市第十人民医院刘占举与团队的研究，揭示了MIR31对肠道炎症的抑制和缓解作用及其背后的分子机制，并表明MIR31类似物微球或是治疗IBD的潜在策略。

炎症性肠病 IBD gene regulation nanoparticle deliver system post-transcriptional processing

炎症性肠病

郭非凡+刘占举：ATF4或是治疗IBD的新靶点

中国科学院上海营养与健康研究院郭非凡团队与同济大学上海第十人民医院刘占举团队合作的研究表明，ATF4在肠道炎症中表达降低，缺乏ATF4使谷氨酰胺转运子SLC1A5表达降低，进而减少潘氏细胞生成的抗微生物肽、改变回肠菌群、促进炎症。因此ATF4或是治疗炎症性肠病的潜在靶点。相关成果发表在Gastroenterology，值得专业人士关注。

炎症性肠病 gene regulation immune response Intestine mouse model

小肠菌群

以FXR为靶改变胆汁酸合成，可调控小肠菌群

小肠在人体生理中有重要作用，但小肠菌群的研究一直比较缺乏。近期Gastroenterology上线一项人体+小鼠研究，表明用胆汁酸类似物奥贝胆酸（OCA）激活胆汁酸受体FXR，可抑制内源性胆汁酸合成，从而影响小肠菌群的组成。该研究为开发小肠菌群标志物、精准调控小肠菌群用于疾病防治，提供了新思路。

小肠菌群 gene regulation Genetics Metabolism nuclear hormone receptor

噬菌体

Cell子刊：噬菌体调节大肠杆菌的毒力基因表达

噬菌体在调节细菌上的生理功能中其重要作用。Cell Host and Microbe上发表的最新研究显示，噬菌体转录因子Cro在溶原状态下，可激活肠出血性大肠杆菌的III型分泌系统（T3SS），并增强细菌的毒力基因表达。

噬菌体肠出血性大肠杆菌毒力基因 enterohemorrhagic E. coli (EHEC) Bacteriophage

肥胖

抑制肠上皮HDAC3，或能预防饮食引发的肥胖

肠上皮细胞（IEC）中的组蛋白脱乙酰酶3（HDAC3）整合来自菌群的信号，调控肠稳态。Gastroenterology近期发表研究表明，IEC中HDAC3介导了饮食诱导的小鼠肥胖，菌群产物丁酸可抑制IEC内HDAC3活性，从而预防饮食诱导的肥胖。调节丁酸-HDAC3通路或可用于预防和改善肥胖相关疾病。

肥胖表观遗传学组蛋白脱乙酰酶3 丁酸 epigenetics

宏基因组学

EM：Patescibacteria中DNA损伤诱导网络的比较基因组学

Environmental Microbiology[IF：5.395]上关于特定细菌的比较基因组学研究一项，特别推荐。

宏基因组学遗传学多样性比较基因组学 SOS调控网络转录抑制因子LexA

拟杆菌属

Cell：人工调节拟杆菌的基因表达

人工给拟杆菌植入一套可控的基因表达系统，可以通过合成的诱导物调节启动子以调控特定基因的表达，缺少诱导物，基因不表达，人工给诱导物，基因表达提供4-5个数量级。很多人可能会忽视这个技术突破，但事实上，研究和转化的价值巨大，值得特别特别关注！

拟杆菌属基因表达调控系统 Bacteroides anhydrotetracycline gene regulation

carcinogenesis

Gastroenterology：具核梭杆菌促进大肠癌的信号通路

这是复旦、同济大学团队合作的重要工作，强烈推荐给大家。

carcinogenesis gene regulation microbe signal transduction Jordana E Hoppe