Bacteroides

肠道生物膜拟杆菌 Anaerobic Bacteria Bacteroides Gut microbiota

透明质酸（HA）是一种由N-乙酰氨基葡萄糖和D-葡萄糖醛酸的重复二糖单元组成的线性糖胺聚糖，被广泛用作膳食补充剂和保健食品添加剂。HA的口服制剂具有抗炎、缓解膝盖疼痛、增加皮肤水分含量和缓解慢性疼痛等多种生物学功能。研究表明，HA可被肠道菌群降解。然而，关于肠道菌群对HA的详细降解概况以及HA与肠道菌群之间的相互作用仍知之甚少。来自中国海洋大学和青岛海洋科学与技术试点国家实验室的尚庆森、李国云、于广利等人在Carbohydrate Polymers上发表研究，通过体外发酵实验对肠道菌群降解HA的能力、HA的代谢产物、HA对肠道菌群结构的影响和HA活性酶等方面进行了细致的研究。该项研究为HA的代谢提供了新的思路，并为从肠道菌群的角度理解HA的生物利用度奠定了基础。

透明质酸肠道菌群体外粪菌发酵 Bacteroides 肠道菌群及代谢产物

细菌成像

对厌氧肠道菌进行动态成像的新方法

肠道菌群内包含大量的厌氧细菌，但使用基于荧光标记的成像技术来直观地研究厌氧菌中的动态过程，仍有很大困难，这是因为荧光蛋白的成熟需要氧气存在。PNAS近期发表的一项研究，利用一些表达细胞色素bd氧化酶的厌氧菌（如拟杆菌、Akk菌），具有在纳摩级别氧含量的条件下进行需氧呼吸的能力，建立了可用于在这些细菌中进行活菌荧光成像的方法，该方法或将有助于对肠道厌氧细菌进行多方面的研究分析。

细菌成像 fluorescent proteins Bacteroides nanaerobic GFP

噬菌体

Cell子刊：噬菌体的溶源性感染影响其细菌宿主的转录及功能

噬菌体 Bacteroides gut microbiome Bacteriophage temperate phage. bile acids. host-microbe interactions. phage-host interactions

肠-肝轴

刘宏伟、刘双江等：肠道拟杆菌-叶酸-肝脏轴的活化可减轻NAFLD

非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）是一种常见的代谢疾病，但目前缺少有效的药物疗法。中科院微生物所刘宏伟、刘双江与团队此前合成了一种可有效改善小鼠代谢综合征的灵芝杂萜衍生物（GMD）（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1087350568），在此基础上，他们在Cell Reports发表的最新研究中，以大鼠为模型探究了GMD治疗NAFLD的效果，并揭示了GMD通过富集解木聚糖拟杆菌等特定的肠道拟杆菌属细菌，激活拟杆菌-叶酸-肝脏轴途径，从而调节肝脏脂代谢减轻NAFLD的机制。这些发现为GMD和解木聚糖拟杆菌对NAFLD的潜在治疗作用提供了证据。

肠-肝轴非酒精性脂肪性肝病 nonalcoholic hepatic steatosis a Ganoderma meroterpene derivative a gut Bacteroides-folate-liver axis

细菌-噬菌体互作

Cell子刊：挖掘肠道微生态中的“暗物质”——未知噬菌体

肠道噬菌体是肠道微生态的重要组成部分，但是收到的关注较少。Cell Host and Microbe近期发表研究，通过分离27株多形拟杆菌噬菌体以及基因组分析，发现了在人肠道宏基因组中广泛存在的但未被解析的噬菌体群体，及其感染细菌的相关基因，为研究肠道噬菌体建立的一种可借鉴的方法。

细菌-噬菌体互作 Bacteriophage phage isolation comparative genomics gut microbiome

多组学

不同肠型之间发生直接转变可能很难

包括肠道菌群在内的多组学分析，有助于精准医疗的发展。PNAS上发表的一项研究，对108名受试者进行了纵向多组学分析，鉴定出两种肠型及其与血液代谢物和临床标志物等的关系。该研究表明，个体的肠道菌群很难在两种肠型之间发生直接转变，提示二者之间可能存在相互拮抗，而靶向菌群的干预方法，需要设计可行的路径来跨越肠型之间的壁垒。

多组学肠型 Microbiome multiomic state transition

胃肠道感染

多糖降解细菌促进轮状病毒感染

《Gut Microbes》上发表的一项最新研究，发现轮状病毒感染后可增加小肠中的黏蛋白分泌，并改变回肠中的菌群多样性与组成，其中增加的拟杆菌属与Akkermansia菌属可降解黏蛋白多糖，以降低黏蛋白与轮状病毒的结合能力，从而促进轮状病毒的感染。

胃肠道感染 Rotavirus Microbiome Mucus Muc2

高血压

国内团队：肠道菌群介导高盐饮食诱导的高血压

高血压 Bacteroides arachidonic acid Corticosterone high-salt diet

菌群恢复力

Cell子刊：缺少膳食纤维不利于抗生素治疗后的肠道菌群恢复

饮食和环境卫生因素如何抗生素干预后的肠道菌群恢复？Cell Host and Microbe近期发表的一项小鼠研究，对抗生素后的肠道菌群恢复进行了系统化的分析，表明低纤维饮食和过于干净的环境（单独饲养）不利于菌群复原，相关发现对于减少抗生素治疗引起的菌群失衡有参考意义。

菌群恢复力 Bacteroides S24-7 antibiotics Co-housing

粪菌移植

胶囊式粪菌移植后，患者肠道菌群如何变化

用口服胶囊的形式进行粪菌移植（cFMT），可简单便捷的治疗艰难梭菌感染（CDI），mBio近期发表的一项研究对接受cFMT的CDI患者进行长达1年的随访，分析其肠道菌群变化，揭示出供体菌群对受体菌群的持久影响，鉴定出拟杆菌属在维持受体菌群与供体相似性中具有关键作用。

粪菌移植 Bacteroides capsule FMT donor Engraftment

细菌-宿主互作

Cell子刊：拟杆菌鞘脂有助于维持肠道稳态

鞘脂类是细菌重要的结构物质，也是真核生物的信号物质。《Cell Host and Microbe》近期发表研究，拟杆菌对维持肠道稳态的作用依赖于表面鞘脂的合成。该研究不仅揭示了肠道细菌-宿主互作的一种新机制，还详细阐述了新的细菌鞘脂的合成通路，值得参考。

细菌-宿主互作肠源鞘脂神经酰胺 sphingolipids Microbiome Bacteroides

克罗恩病

特定克罗恩病相关SNP的潜在致病机制

克罗恩病 ATG16L1T300A Bacteroides Bacteroides ovatus CROHN'S DISEASE

噬菌体

逆转录因子驱动噬菌体多样性

产生多样性的逆转录因子（DGR）是一种基因盒，可选择性突变噬菌体基因组，产生高突变蛋白。《Microbiome》近期发表研究，报道了新发现的92个DGR，发现其中一种含有DGR的拟杆菌噬菌体广泛分布于共生菌群中，指出DGR的基因突变功能很可能介导了菌群中噬菌体-细菌互作，对于研究病毒组、病毒-细菌互作具有参考价值。

噬菌体噬菌体-病毒互作 Bacteroides Diversity-generating retroelements prophage

饮食干预

Cell子刊：膳食成分控制肠道共生菌定植

开发可控的菌群干预手段意义重大。本研究利用非常规膳食成分，影响特定肠道共生细菌在肠道菌群内的定植和丰度，并发现早期饮食干预的频率影响该成分对相应细菌的作用。该成果为开发通过饮食进行可控性菌群干预手段提供了参考，值得专业人士关注。

饮食干预 Bacteroides gut microbiome Gut microbiota orthogonal niche

代谢调控

肠道普氏菌属/拟杆菌属丰度或有益于代谢

European Journal of Nutrition上的一项最新研究，根据普氏菌属/拟杆菌属的比值，对99名健康人的肠道菌群进行分类，发现比值不会影响对大麦仁面包的代谢应答，但可能对宿主的代谢调节有益。

代谢调控普氏菌属拟杆菌属 Bacteroides Barley

肠道共生菌

Cell子刊：肠道菌怎样挨过“饥荒”？

肠道菌群内部竞争激烈，当营养物质不足时，肠道细菌会如何应对？Cell Host and Microbe上的一项研究表明，人体肠道共生菌——多形拟杆菌在碳源不足时会调节自身核心代谢基因表达，从而停止生长进入“冬眠”状态，以增强细菌生存能力。这种停止生长的策略，可能是共生菌确保在肠道内长期存留的决定性因素。

肠道共生菌多形拟杆菌严紧反应 Microbiome Bacteroides

底物偏好

mBio：不同的多糖利用偏好，促进不同肠道细菌的共生

这是对同期发表的研究论文（http://www.xunludkp.com/papers/read/1041836960）的简要介绍，没有图，但仍然值得按老规矩好好读一读。

底物偏好多糖利用位点多糖利用偏好 Bacteroides community diversity

拟杆菌属

Cell：给拟杆菌装上荧光蛋白启动子，精确分辨单株细菌

又是一项人工给拟杆菌植入一套可控的基因表达系统，以实现用荧光蛋白显示特定菌株拟杆菌的技术突破。很重要很酷的研究，依然特别特别推荐！

拟杆菌属噬菌体启动子 Bacteroides colonization fluorescent microscopy

拟杆菌属

Cell：人工调节拟杆菌的基因表达

人工给拟杆菌植入一套可控的基因表达系统，可以通过合成的诱导物调节启动子以调控特定基因的表达，缺少诱导物，基因不表达，人工给诱导物，基因表达提供4-5个数量级。很多人可能会忽视这个技术突破，但事实上，研究和转化的价值巨大，值得特别特别关注！

拟杆菌属基因表达调控系统 Bacteroides anhydrotetracycline gene regulation