antibiotics

肥胖 brain fibroblasts arachnoid barrier leptomeninges single-cell RNA sequencing

耳念珠菌（Candida auris）和白色念珠菌（Candida albicans）可导致侵袭性真菌病。然而，这些物种可以稳定和无症状地定植于人类皮肤和胃肠道。Cell Host and Microbe发表的这篇综述探讨了微生物组、宿主生理学、宿主免疫力和抗生素在调节白色念珠菌物种在共生、致病和感染之间转换的作用。

真菌念珠菌 Candida Mycobiome antibiotics

肠干细胞

Cell子刊：细菌产生的基因毒素tilmycin引起结肠干细胞突变

人类肠道的早期定植菌群包括产生β-乳糖酶的克雷伯氏菌属，它们还携带用于非核糖体肽肠毒素生物合成的til基因。该种群的过度生长会导致DNA烷化剂tilimycin（TM）及其衍生物tilivaline在肠腔里浓度较高。Cell Reports近期发表的文章，发现til+ 产酸克雷伯菌定植在小鼠肠道后，产生基因突变诱变剂TM，TM分布在整个肠道，渗透到结肠隐窝深处。数天短暂暴露于TM，会导致结肠上皮干细胞的体细胞突变。

肠干细胞 intestinal stem cell Gut microbiota bacterial metabolite genotoxin

产前抗生素暴露

胎儿产前抗生素暴露或增加产后感染事件发生风险

产前使用抗生素，随之而来的母亲肠道菌群失调以及胎儿在生命早期获得的微生物群改变，后代儿童期各种感染的易感性或许也会增加。因此，本研究通过大数据验证产前抗生素暴露与产后感染发生率之间的关系。

产前抗生素暴露 pregnancy antibiotics cohort study deaths

母乳喂养

母乳喂养或可降低婴儿因抗生素暴露导致的哮喘风险

早期接触抗生素可能导致婴儿肠道菌群的持续破坏，这将与随后儿童哮喘风险升高有关。母乳喂养在生命早期充当肠道菌群的主要调节剂，但其对哮喘的发生风险的影响仍不清楚。本研究通过对儿童队列的数据分析，发现母乳喂养在一定程度上降低因抗生素暴露导致的哮喘风险增高。这为未来哮喘的预防提供了新的思路。

母乳喂养抗生素暴露 HMOs Translation to population health antibiotics

药物递送系统

朱书+王育才Nature子刊：新型口服递送载体，防止抗生素“误伤”肠道菌群

抗生素是人们应对细菌感染的有效武器，然而，频繁使用口服抗生素可引起肠道菌群失调，菌群多样性丧失，从而增加多种疾病风险以及耐药细菌的出现。如何能够避免抗生素对正常肠道菌群的“误伤”，是亟需解决的重大课题。Nature Biomedical Engineering最新发表了来自中国科学技术大学生命科学与医学部朱书教授与王育才教授团队的研究成果，设计合成了一种新型口服递送载体，并在小鼠中证实这种载体能促进抗生素在小肠中高效吸收，增强药物疗效，有效防止抗生素进入大肠，大大降低对肠道菌群的破坏作用以及由此造成的疾病风险和抗生素耐药基因的积累。该成果具有很强的转化前景，期待早日实现临床应用。

药物递送系统 antibiotics Dysbiosis Nanoparticles 抗生素

药物-菌群互作

国内团队：非抗生素药物与抗生素联用，可大幅增加细菌耐药性

天津环境医学与作业医学研究所金敏团队，近期在Gut Microbes发表研究，以常见的肠道细菌大肠杆菌为模型，发现非抗生素药物与抗生素的联合使用，可协同增强细菌的多重耐药性，加速抗生素耐药细菌的进化，并可能加强其传播。这些发现为药物对肠道细菌耐药性的影响带来了新启示。

药物-菌群互作 Non-antibiotic pharmaceutics antibiotic-resistant bacteria antibiotics synergism

高血糖

Cell子刊：高血糖影响肠道菌群结构和功能

抗生素可以影响肠道菌群的结构和功能。但是，宿主和菌群代谢对抗生素的敏感性尚不可知。本文使用链脲佐剂诱导的高血糖模型，结合宏基因组、元转录组和代谢组学方法分析微生物代谢与抗生素易感性的相互作用。研究结果显示，链脲佐剂诱导的高血糖（HG）可以引起盲肠内代谢物的变化、影响肠道菌群的结构和功能。本文也初步启示，高血糖足以引起盲肠代谢物变化，加剧抗生素带来的微生态失调，降低定殖抗性。

高血糖 antibiotics Dysbiosis hyperglycemia metabolomics

结肠炎

Cell子刊：TNFR1促进早期免疫，预防结肠炎

中和TNF是一类治疗自身免疫疾病的常用策略，包括炎症性肠病（IBD）的治疗。但是，很多IBD患者对anti-TNF没有响应。Cell Reports近期发表的文章，发现TNF/TNFR1信号通路通过调控小鼠早期的结肠免疫稳态发挥抗炎功能，揭示出TNF信号在IBD疾病中的功能多态性。

结肠炎 IBD Microbiome antibiotics barrier

抗生素

抗生素扰动对人体肠道菌群的影响（综述）

Genome Medicine近期发表的综述文章，详细总结了抗生素对不同阶段人体肠道菌群的扰动作用，归纳了其中的关键影响因素，推荐专业人士参考。

抗生素 gut microbiome Resistome antibiotics Perturbation

抗生素

浙江省中医院：培菲康可减少抗生素诱导的肠道菌群失调

浙江中医药大学附属第一医院的吕宾团队在Gut Pathogens上发表的一项随机对照试验结果，在196名使用β-内酰胺类抗生素的患者中，发现口服培菲康（含有长双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、及粪肠球菌）可以剂量依赖性方式降低抗生素诱导的肠道菌群失调的发生率，并恢复肠道菌群的物种丰富度。

抗生素 16S rDNA sequencing AIGD antibiotics BIFICO

蜜蜂

农科院：肠道菌群保护蜜蜂抵抗塑料微粒的有害影响

塑料微粒对生物体和生态系统的危害，正在得到人们越来越多的关注。中国农业科学院吴黎明、齐素贞与团队近期在Journal of Hazardous Materials发表研究，揭示了塑料微粒对蜜蜂的危害，以及蜜蜂肠道菌群在其中的保护性作用。

蜜蜂 Polystyrene microplastics honey bees Gut microbiota antibiotics

肿瘤免疫治疗

改善癌症免疫治疗，菌群调节从何入手？（综述）

肠道菌群与癌症患者对免疫检查点抑制剂（ICI）治疗的应答密切相关。European Journal of Cancer上发表的一篇综述文章，详细讨论了如何通过直接方式（粪菌移植、抗生素、益生菌、合生制剂、特定菌群组合、噬菌体）及间接方式（饮食干预、膳食纤维、发酵食品等）调控癌症患者的肠道菌群，以提高患者对ICI治疗的应答，同时对于开始ICI治疗前的患者及医生给出了一些广泛的建议。

肿瘤免疫治疗 immunotherapy gut microbiome microbiota Nutrition

新型抗生素研发

Cell：双重作用机制的新型广谱抗生素

面对抗生素耐药性的威胁，人们急需新型开发新型抗生素。《Cell》近期发表的一项研究，报道了一种具有双重作用机制的新型广谱抗生素，对革兰氏阳性和阴性菌均有强力杀灭作用，且不易产生耐药性。这种在单一化学分子骨架上集成多重抗菌机制的思路，或为未来的抗生素研发带来新启示。

新型抗生素研发 antibiotics broad spectrum Gram-negative pathogens Acinetobacter baumannii

antibiotics

肠道促进原发性硬化性胆管炎发展的机制（综述）

原发性硬化性胆管炎（PSC）是肝脏和胆管的一种慢性炎症性疾病，常伴发炎症性肠病（IBD）。肠道菌群及其代谢产物、肠道通透性改变和免疫应答可能是导致PSC肝胆纤维化发生和进展原因。《Hepatology》近期发表的综述系统的回顾了肠道菌群推动PSC发展的可能机制，讨论可行的治疗手段和未来的研究方向，推荐阅读。

antibiotics Enteric Microbiome gut-liver axis intestinal permeability Leaky gut

早期肠道菌群

新生小鼠肠道菌或可防止小肠上皮脱落

生命早期肠道菌在调节和维持肠道屏障中起着至关重要的作用，但早期肠道菌在病理性细胞脱落过程中的作用尚不清楚。《FASEB Journal》最近发表的文章，对出生14、21、29天的新生小鼠和成年小鼠腹腔注射脂多糖（LPS）诱导细胞脱落，分析早期肠屏障功能和调节机制。结果发现，与成年小鼠相比，新生小鼠可抵抗LPS诱导的上皮脱落，用抗生素处理生小鼠肠道菌，这种抵抗作用减弱，提示新生儿肠道菌群在健康和疾病中调节宿主生理的重要作用。

早期肠道菌群 antibiotics cell shedding early life fecal microbiota transplant

婴儿呼吸道菌群

婴儿抗生素治疗增加哮喘风险，或与鼻腔菌群变化相关

生命早期接触抗生素可能会增加儿童患哮喘的风险。然而，我们对抗生素暴露影响哮喘的机制知之甚少。Clinical Infectious Diseases近期的人群队列研究发现，0-11个月期间接触抗生素治疗与生命前2年的鼻腔纵向微生物群结构存在剂量依赖关系，且广谱抗生素的影响更大。同时还发现，接触抗生素与患哮喘的风险增加有关，这在一定程度上是由鼻腔微生物群的纵向变化介导的。以上结果提示，临床上应避免儿童过度使用抗生素，同时，本研究结果也可能为预防儿童哮喘提供新的途径。

婴儿呼吸道菌群哮喘抗生素儿童 airway microbiota

动脉粥样硬化

抗生素改变肠道菌群代谢功能并促进动脉粥样硬化

肠道菌群代谢产物在心血管代谢疾病的发病中发挥重要作用，长期使用抗生素是动脉粥样硬化的风险因素之一。Molecular Metabolism上发表的一项最新研究，在载脂蛋白E敲除小鼠中发现，抗生素处理可促进动脉粥样硬化的发展，这与抗生素诱导的肠道菌群组成及代谢功能变化相关，而动脉粥样硬化患者与抗生素诱导的动脉粥样硬化小鼠模型有着相似的代谢组及肠道菌群特征。

动脉粥样硬化 atherosclerosis antibiotics Gut microbiota Dysbiosis

广泛耐药（XDR）

Nature Reviews：临床开发抗菌药的现状和方向（综述）

此文综述了临床开发中的抗菌剂，并确认了这些新型抗菌剂的范围有限，尤其是针对革兰氏阴性关键优先病原体。特别是，所有正在开发的针对关键优先病原体的药剂都表现出某种程度的预先存在的交叉耐药性。研发新的抗菌药物，尤其是针对世卫组织关键优先病原体的抗菌药物的需求仍然很旺盛。为了提供针对最强耐药性病原体的药物并为未来不可预测的耐药性挑战做准备，应将精力集中在没有预先存在交叉耐药性的创新和抗菌剂上（即针对新类别或新靶标）。新抗生素的发现需要长时间的持续投入，需要大量的资源来解决新型抗菌剂的众多挑战，还需要集体努力来扩大科学基础。

广泛耐药（XDR）泛耐药（PDR）抗菌剂革兰氏阴性菌交叉抗性

抗生素

山东大学：黄海附近水产养殖场中的抗生素含量及分布

来自山东大学的王曙光团队与赵珊团队在Environment International上发表的一项最新研究，在山东海阳（黄海附近）的代表性水产养殖场中进行取样，对海水、沉积物/生物膜、饲料及水生生物中的17种抗生素分析，发现在水产养殖场的不同环境中有着不同的抗生素分布，在水生环境中沉积物/生物膜可能作为抗生素的储存库，而重金属水平与抗生素浓度存在显著关联。

抗生素 antibiotics Marine aquaculture Heavy metal Potential source

抗生素

频繁使用抗生素或增加感染住院风险

文章基于人群大队列研究，发现频繁使用抗生素反而增加患者因感染住院风险。即使在无感染并发症人群中，抗生素的暴露也增加了其发病风险。研究认为，这种现象可能是由于抗生素造成患者体内菌群紊乱，造成抗药致病菌在体内的定殖，从而诱发机体感染发病。该研究结果呼吁谨慎使用抗生素。

抗生素感染 antibiotics Primary care effectiveness

药物代谢

细菌可将特定抗炎药转化为抗生素

Angewandte Chemie International Edition发表的一项研究发现，治疗自身免疫病的抗炎药Tapinarof，可被某些细菌通过特定的酶转化为二聚体，具有抗生素功效。相应的，这类转化后的分子丧失了Tapinarof对小鼠结肠炎的改善作用。值得注意的是，研究者在人体微生物组中也鉴定出类似的细菌酶，或许会影响Tapinarof的治疗效果。

药物代谢 antibiotics Photorhabdus Inflammation Microbiome

新型抗生素研发

Cell：用人工智能发现新型抗生素

抗生素耐药性是普遍存在的公共卫生问题，需要采用创新的方法来开发新药物。近期Cell以封面文章的形式发表了一项用机器学习来研发新型抗生素的研究，使得人们能从化学文库中根据分子结构来找出有潜在抗菌活性的化合物，为研发新型抗生素开辟新道路。

新型抗生素研发 antibiotics antibiotic resistance antibiotic tolerance machine learning

肝癌

肠道微生物在肝癌中的作用（综述）

肝细胞癌（HCC）是全球癌症死亡的第三大原因，最新发表在Journal of Hepatology的综述文章回顾了肠道微生物在HCC中的作用。讨论了肠-肝轴在小鼠模型和患者中促进HCC发展的机制，包括生态失调、肠道渗漏和细菌代谢物，并特别关注非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）作为HCC发展最快的诱因。此外，还回顾了近年来利用肠道菌群作为肝癌患者潜在的诊断工具和新的治疗靶点的研究进展，特别是在免疫治疗方面。

肝癌 liver cancer Dysbiosis checkpoint inhibitor antibiotics

益生菌

内蒙农大：植物乳杆菌P-8适应抗生素时发生了什么变化

内蒙古农业大学张文羿团队近期在mSystems发表研究，分析了植物乳杆菌P-8在对抗生素的适应中发生的变化，发现一些应激蛋白可能有助于细菌形成抗生素耐药表型，并表明相关基因通过可移动遗传元件传播给其它细菌的风险比较低。该研究为具有高耐药性的新型益生菌的生物安全性，提供了新的见解。

益生菌抗生素耐药性 Lactobacillus Lactobacillus plantarum P-8 adaptive laboratory evolution

allo HCT

调控肠道菌群或可优化异基因造血干细胞移植的疗效（综述）

微生物可调节多种疾病，影响预后、治疗反应和并发症等。异体造血细胞移植是癌症治疗的重要方式，目前有大量研究报道了这种治疗方式与微生物组之间的互作关系。Annual Review of Medicine上发表的一篇综述系统地回顾了这方面的研究，并阐述了目前正在研究的调控微生物群的策略，包括抗生素的适当选择和时间，饮食方式和给药途径，添加益生菌和益生元以及粪菌移植等，或为优化患者的治疗方式提供新方法。

allo HCT GvHD TRM 造血干细胞移植移植物抗宿主病

脓毒症

重症患者的肠道菌群或可作为脓毒症的生物标志物

脓毒症 Intestinal Microbiota antibiotics critically ill patient Intensive care unit

抗生素残留

兰州大学团队：用工程菌减少抗生素污染

抗生素被广泛应用于畜禽养殖业，大量的抗生素无法被动物代谢或吸收，其中有大约50-90%的抗生素以原始形式或作为母体化合物排出，导致动物粪便中有大量抗生素残留，影响后续处理。抗生素经常出现在不同的环境中，不但通过促进耐药菌株的形成而威胁人类健康，而且对生态系统具有严重的破坏性。因此亟需开发一种有效的控制污染源抗生素释放的方法。兰州大学李祥锴团队在《Journal of Hazardous Materials》上发表的一项研究，应用细胞表面展示技术将红霉素酯酶（ereA）表达于肠道细菌大肠杆菌表面，获得的工程菌E. coli ereA具有非常稳定的酯酶活性，可有效降解溶液中及小鼠肠道中的红霉素。该研究表明，应用细胞表面展示技术使肠道细菌表达抗生素降解酶系或可作为减少抗生素污染的有效方法之一。

抗生素残留细胞表面展示技术 Cell surface display antibiotics Erythromycin esterase

抗生素

生命早期抗生素暴露可长期增加致病菌易感性

抗生素 Citrobacter rodentium pathogen-induced colitis gastrointestinal microbiota host resistance

抗生素

60岁后长期使用抗生素或增加全因及心血管死亡风险

Circulation Research上发表的一项前瞻性队列研究结果，对近4万名女性进行多年随访后，发现在60岁以后，使用抗生素2个月以上，与全因死亡及心血管疾病死亡风险增加显著相关。

抗生素 antibiotics mortality cardiovascular outcomes risk factor