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文章数：13篇

抗生素扰动对人体肠道菌群的影响（综述）

Genome Medicine近期发表的综述文章，详细总结了抗生素对不同阶段人体肠道菌群的扰动作用，归纳了其中的关键影响因素，推荐专业人士参考。

抗生素 gut microbiome Resistome antibiotics Perturbation

养殖场与屠宰场工人的粪便耐药组

Environment International上发表的一项最新研究，对比分析了养鸡场工人、养猪场工人、猪肉屠宰场工人及对照的粪便抗菌素耐药基因（ARG），发现粪便耐药组受到养殖场类型、养殖场工作时间、屠宰线工作位置等因素的影响。

耐药组 Resistome Microbiome Antimicrobial resistance occupational exposure

口服粪菌移植胶囊或能根除青霉烯酶肠杆菌科

产碳青霉烯酶肠杆菌科（CPE）感染会导致相当大的发病率和死亡率，粪菌移植（FMT）有消除CPE携带的潜力。《Clinical Infectious Diseases》近期发表的文章，利用FMT对15名CPE携带者进行治疗，发现FMT根除成功率为9/15，应答者和失败者的肠道菌群组分和功能变化具有差异，FMT或是一种持续根除CPE的有效策略。

粪菌移植 oral capsulized fecal microbiota transplantation carbapenemase-producing Enterobacteriaceae multidrug resistant bacteria carriers

呼吸道中的核心耐药组

《American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine》上发表的一项最新研究，对患有严重哮喘、慢性阻塞性肺病（COPD）、支气管扩张等慢性呼吸道疾病的患者及健康人的呼吸道样本进行宏基因组分析，鉴定出了一类以大环内酯类抗生素耐药基因为主的核心耐药组，该核心耐药组与疾病状态及抗生素暴露无关。另外，通过对比分析患者的呼吸道样本及其使用的吸入器，发现两者之间的菌群及耐药组有着很大的重叠，提示吸入器菌群可作为替代，用于评估慢性呼吸道疾病患者的呼吸道菌群。

耐药组 Respiratory disease metagenomics Antimicrobial resistance Macrolides

中科院微生物所团队：候鸟肠道菌群中的耐药组

人及动物的肠道菌群可能作为抗生素耐药基因的“蓄水池”。来自中国科学院微生物研究所的高福团队及朱宝利团队在Microbiome上发表的一项最新研究，对多种不同的候鸟物种的肠道菌群宏基因组进行了分析，重点关注了其中的抗生素耐药基因的多样性与丰度，提示候鸟可能作为环境中抗生素耐药基因的传播者。

候鸟耐药组 Microbiome Resistome antibiotic resistance

抗生素耐药菌

人类引起环境中的抗生素耐药基因爆发，原因何在？

人类活动可影响环境中的细菌耐药组，但这是否是源于人体耐药菌的直接增殖，尚不清楚。Microbiome发表的这项研究表明，人粪便中的耐药菌携带的抗生素耐药基因，能转移至环境中的近亲细菌中，从而可能造成了环境耐药组的爆发。

抗生素耐药菌 antibiotic resistance Antibiotic resistance gene Resistome mobile genetic element

抗生素耐药性

抗生素治疗增加结肠袋炎患者肠道菌群的抗生素耐药性

结肠袋炎患者通常接受抗生素治疗，部分患者可能出现复发、抗生素依赖或需要更长或更多疗程的抗生素治疗。来自Gastroenterology上发表的一项最新前瞻性队列研究结果，发现多数结肠袋炎患者可对4周的抗生素治疗产生应答，但大多数会在短期内复发，而这可能是抗生素治疗导致的耐药细菌富集引起的。因此，短期交替使用抗生素、基于菌群及营养的干预手段等应被考虑用于治疗结肠袋炎。

抗生素耐药性 IBD UC Resistome metagenome

替加环素作用下生物膜反应器中的抗性组变化

在一个周期为636天的实验中，来自于中科院生态环境中心的研究人员通过在合成污水中加入 0-25 mg/L 的替加环素，探索抗生素持续暴露对水处理系统中好氧生物膜群落的结构和抗性组的影响。

抗性组 Dynamics Resistome Biofilm microbiota Tigecycline

抗生素耐药性基因

华农大+港大：抗生素如何影响肉鸡的粪便菌群

抗生素使用在肉鸡养殖中非常普遍，可导致耐药菌增加。华南农业大学曾振灵教授和香港大学张彤教授，两个团队合作的相关研究近期发表于Microbiome[IF：8.496]。该研究分析了抗生素使用所致的肉鸡粪便菌群和其中耐药基因的变化，相关发现或许可供养鸡场专业人员参考，以优化对抗生素耐药菌感染的治疗方案。

抗生素耐药性基因抗生素肉鸡 Antibiotic resistance genes Bacterial community

EP：绵羊瘤胃中的耐药基因

这是Environmental Pollution[IF：5.099]发表一项关于绵羊瘤胃中的耐药基因的研究，结果值得关注，其研究方法也推荐学习。

瘤胃绵羊抗生素耐药基因 Antibiotic resistance gene metagenome

磺胺类药物

Microbiome：鉴定出第四类迁移性磺胺类药物耐药基因

这是Microbiome[IF：8.496]杂志发表的鉴定特定耐药基因的方法学研究，值得专业人士特别关注。

磺胺类药物耐药基因 Bioprospecting environment evolution

Microbiome：通过富集系统检测宏基因组中低丰度的耐药组分

这是关于在宏基因组富集耐药相关组分的方法学研究，特别推荐专业人士阅读。

耐药组分子富集 Resistome Antimicrobial resistance Molecular enrichment

antibiotic resistance

Microbiome：人、动物及环境抗性组的结构及多样性

比较人、动物和环境中的抗生素耐药基因、可移动遗传元件（MGE）及细菌分类学组成，会有怎样的发现？看看这篇文章。

antibiotic resistance Biocide resistance Environmental microbiome human microbiome metagenomics