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文章数：9篇

膳食、健康与环境

健康的食物，通常也是环境友好型食物（综述）

研究分析了常见的15种食物分别与5种人类疾病（冠心病、二型糖尿病、直肠癌、中风和死亡）、5项环境因素（土地酸化、水体富营养化、温室气体排放、耕地利用以及稀缺水资源占用）的关系，一个总的趋势为：那些健康食物更倾向于是环境友好型，那些不利于机体健康的食物对环境的危害也比较大。更广泛的受众（比如儿童和老人）以及更多的膳食种类（糖、反式脂肪酸等等）需要被进一步研究。

膳食、健康与环境 food health environment Diet

人口、环境、病理等多种因素如何影响健康个体中肠道菌群多样性

肠道菌群的多样性受多种因素的调节。Microbiome 上的这一研究通过整合问卷调查、血液指标测量、医疗记录等多种来源的数据，得出了110个与人口、医疗和环境相关的因素，包括人口学特征、生理指标、饮食习惯、生活习惯、医疗记录等六大类。这些指标被用于更全面评估不同因素对肠道菌群的影响。

肠道菌群 16S rRNA gene sequencing Demographics environment GWAS

室内菌群与儿童哮喘风险相关

Journal of Allergy and Clinical Immunology上发表的一项前瞻性队列研究结果，在对近400名儿童随访10年后发现，儿童住宅的室内菌群组成及丰富度与哮喘风险显著相关。

哮喘 Asthma development Lactococcus Children diversity

Domain annotation

用于分析宏基因组、宏转录组蛋白质结构域的注释流程

Microbiome上发表了一篇进行宏基因组、宏转录组功能注释的生物信息学方法——MetaCLADE，值得专业人士关注。

Domain annotation environment Functional annotation Metagenomic Metatranscriptomic

mBio：警惕医院内的抗生素耐药性

碳青霉烯类抗生素是治疗严重细菌感染的重量级武器，但能生成碳青霉烯酶的细菌（CPO）可对其产生抗性，医院内感染CPO发病率和死亡率都令人担忧。mBio[IF：6.956]近期发表了美国NIH临床中心的一份报告，调查了美国医院内的CPO及其携带的耐药基因质粒等情况，结果不容乐观，推荐医院管理者参考。

质粒耐药性碳青霉烯类抗生素 Antimicrobial resistance carbapenem resistant

磺胺类药物

Microbiome：鉴定出第四类迁移性磺胺类药物耐药基因

这是Microbiome[IF：8.496]杂志发表的鉴定特定耐药基因的方法学研究，值得专业人士特别关注。

磺胺类药物耐药基因 Bioprospecting environment evolution

Microbiome：影响狗狗皮肤菌群的因素

这是一项针对狗的皮肤菌群的研究，纳入35只狗，进行全方位的皮肤菌群测序分析，发表在Microbiome，值得关注。

皮肤菌群狗 16s Canine Dog

抗生素耐药

Microbiome：中国城市污水中耐药基因高启，过半或来自人体！

这是来自中科院城市环境研究所和香港大学团队联合完成的研究，对中国城市污水中的耐药基因进行定量分析，这是中国相关领域的里程碑似研究，其中发布的中国不同地区耐药基因丰度图，很直观，很经典，预计会被经常引用。强烈推荐本文！

抗生素耐药耐药基因抗性组污水处理 antibiotic resistance

JN：影响肠道菌群、炎症和2型糖尿病的因素（综述）

这是业内知名的营养学期刊The Journal of Nutrition[IF：4.145]关于菌群、炎症和糖尿病之间关系的综述，很实用，特别推荐！

膳食酸奶炎症环境 2型糖尿病