16S rRNA gene sequencing

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16S rRNA gene sequencing

文章数：15篇

婴儿菌群发育

婴儿断奶前后的菌群发育

Gut Microbes上发表的一项最新研究，招募了157对来自印度尼西亚的母亲与后代儿童，对后代儿童断奶前后的粪便菌群进行分析，发现断奶前，后代儿童的菌群与母亲有显著差异，断奶后则逐渐与母亲菌群相似。另外，断奶后，后代儿童的细胞因子水平及胆汁酸组成也发生了显著改变。

婴儿菌群发育 Fecal microbiome Bifidobacterium Prevotella Indonesian mother-infant pairs

国内团队：绝经后骨质疏松与肠道菌群及其代谢物的关系

来自厦门大学附属中山医院的Jian Chen团队、南方医科大学的Guangchuang Yu团队与上海健康医学院的Guohua Zheng团队在《Aging》上发表的一项最新研究，报道了绝经后骨质疏松症患者的肠道菌群多样性及组成变化，以及肠道菌群代谢产物的变化，并鉴定出了与骨密度及骨转化标记物相关的肠道细菌属及菌群代谢产物。

骨质疏松 16S rRNA gene sequencing LC-MS metabolomics Gut microbiota postmenopausal osteoporosis

人口、环境、病理等多种因素如何影响健康个体中肠道菌群多样性

肠道菌群的多样性受多种因素的调节。Microbiome 上的这一研究通过整合问卷调查、血液指标测量、医疗记录等多种来源的数据，得出了110个与人口、医疗和环境相关的因素，包括人口学特征、生理指标、饮食习惯、生活习惯、医疗记录等六大类。这些指标被用于更全面评估不同因素对肠道菌群的影响。

肠道菌群 16S rRNA gene sequencing Demographics environment GWAS

饮食模式影响老年女性的肠道菌群组成

American Journal of Clinical Nutrition上发表的一项最新研究，对超过500名65岁以上的社区老年女性的饮食模式与肠道菌群进行分析后发现，饮食模式显著影响了肠道菌群的组成。

饮食 16S rRNA gene sequencing alpha diversity beta diversity dietary patterns

癌症免疫疗法

菌群在癌症免疫治疗中的作用（综述）

《Journal for ImmunoTherapy of Cancer》近期发表综述，着重探讨了菌群与癌症免疫疗法效果的关联及其背后的生物学机制，并对未来的临床研究方向提出了建议，对于研发菌群相关干预方法来改善癌症免疫治疗很有参考意义。

癌症免疫疗法 16S rRNA gene sequencing anti-PD-1 Germ-free mice gut microbiome

饮食与健康

反式脂肪酸如何影响肠道菌群

氢化植物油是一种人工合成的油脂，比如奶精和人造奶油等，其加工过程中可产生的反式脂肪酸对健康有害。European Journal of Nutrition近期发表一项小鼠研究，首次揭示了反式脂肪酸对肠道菌群的影响，并分析了炎症和菌群代谢产物短链脂肪酸的变化，为反式脂肪酸与疾病的关联提供了潜在的作用机制。

饮食与健康 16S rRNA gene sequencing Gut microbiota Short-chain fatty acid Trans-fatty acid

上海理工：酒精改变小鼠的菌群、代谢产物及行为

来自上海理工大学团队在Frontiers in Microbiology上发表的一项最新研究，发现饮酒可改变小鼠的肠道菌群、代谢产物及抑郁、焦虑相关的行为。

alcohol addition Gut microbiota 16S rRNA gene sequencing LC-MS tissue damage

低丰度细菌驱动饮食变化引起的肠道菌群组成改变

Microbiome上发表的最新研究，评估不同饮食对白蚁菌群的影响，发现低丰度细菌驱动了饮食引起的肠道菌群变化。

白蚁菌群人工神经网络深度学习低丰度物种 16S rRNA gene sequencing

高膳食纤维

BJN：日常饮食高纤维，对菊粉响应更明显

这是British Journal of Nutrition[IF：3.706]做的一项菊粉干预研究，发现日常饮食中摄入更多膳食纤维的人，吃了菊粉后肠道菌群的响应更明显，或更能受益于菊粉。这是很值得一看的研究，特别推荐。

高膳食纤维低膳食纤维肠道菌群习惯性膳食纤维摄入菊粉型果聚糖益生元

mSphere：健康的中国老年人，拥有更年轻的肠道菌群

这是之前备受业内关注，由江苏天益健康研究院团队与国内外团队联合做的中国人肠道菌群调查研究，纳入了1000多名不同年龄的中国人的肠道菌群数据。特别的结果是发现中国健康老年人拥有与年轻人相似的肠道菌群。值得好好看一看，特别推荐。

健康衰老 16S rRNA gene sequencing DNA sequencing compositional data cross-sectional study

16S rRNA基因测序

Microbiome：用于分析16S rRNA基因测序结果的流水线方法

关于16S rRNA基因测序的重要方法学文献，推荐专业人士精读。

16S rRNA基因测序标记基因测序 16S rRNA gene sequencing Marker gene sequencing Microbiome

PeerJ：糖尿病足溃疡患者的皮肤和伤口菌群

这是专门针对2型糖尿病足溃疡患者的皮肤和伤口菌群研究，推荐阅读。

糖尿病糖尿病足溃疡皮肤菌群伤口菌群 16S rRNA gene sequencing

BMC Gastroenterology：肠道菌群改变与小鼠胆结石形成相关

① 肠道菌群在调节与胆结石形成有关的胆固醇和胆汁酸方面的作用鲜有报道；② 成年小鼠喂食致结石饮食（1.2%胆固醇+0.5%胆酸）或正常饮食，持续56天，分析粪便菌群组成；③ 致结石饮食导致小鼠肠道菌群的丰度及α多样性降低，厚壁菌门显著减少（59.71%下降到31.45%），厚壁菌门与拟杆菌门比值也下降；④ 同时观察到肠道菌群组成在门、科、属水平上的不同。⑤ 肠道菌群失调在小鼠的胆结石形成中起重要作用。

胆结石 16S rRNA gene sequencing Cholesterol gallstone Gut microbiota

JPBA：大鼠与抑郁症相关的肠道菌群和粪便代谢表型变化

来自协和医学院团队（我们的群友）的研究，特别推荐！

LC–MS 抑郁症粪便代谢表型脑肠轴慢性可变应激

16S rRNA gene sequencing

CMI：突然之间，人人都成了菌群专家！

肠sir最近写的科普，主要是参(chāo)考(xí)这篇文献，非常值得大家读一读。

16S rRNA gene sequencing Bias metagenomics Microbiome Microbiota analysis