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DNA sequencing
文章数:5篇
肠道菌群
坚果对人体肠道菌群的影响(综述)
坚果是一种富含纤维和多酚的食物,这些食物成分已被证明对肠道菌群有益。近期发表于《British Journal of Nutrition》的一项系统综述通过调研、筛选、总结已发表的相关文献,旨在综合有关坚果摄入对人体肠道菌群影响的证据。这篇综述表明坚果摄入有可能对肠道菌群产生一定的影响,尽管确切的影响在各个研究中并不一致。更多的研究需要考虑试验设计、个体间菌群差异、分析方法、饮食习惯等因素,以获得可靠结论。
肠道菌群
坚果
Nuts
gut microbiome
Gut microbiota
微生物组
宏基因组学能回答什么问题?什么不能?(综述)
本文介绍了使用宏基因组学的优势,以及当前可用的分析工具得出的结论的范围,例如跨门和功能组成在物种和菌株水平的高分辨率,同时强调了宏基因组学数据分析的挑战,且表明将来技术和方法的改进和创新将导致成本降低,并预期我们将不仅能够表征复杂的微生物群,而且能够操纵群落以实现人类健康、农业和环境可持续性发展的结果。
微生物组
宏基因组学
DNA测序
微生物学
计算生物学
皮肤微生物组
mBio:人真皮微生物群组成
由于个体间的差异,皮肤微生物被描述为微生物指纹图谱。目前对皮肤微生物的理解是基于对表皮最外层的采样,而其余皮肤层的微生物群尚未得到充分研究。mBio近期的研究,对皮肤的表皮和真皮微生物组成进行了分析,结果显示,表皮和真皮之间的组成和功能有所不同。真皮在个体间通常含有较多的同源微生物组成,是表皮微生物群的一个特定亚群。猜测真皮微生物能直接接触到人体宿主的免疫应答,研究宿主与菌群之间的互作,如皮肤疾病和慢性感染等,可以真皮为研究对象。
皮肤微生物组
真皮微生物
16S rRNA 基因
DNA测序
皮肤活检
健康衰老
mSphere:健康的中国老年人,拥有更年轻的肠道菌群
这是之前备受业内关注,由江苏天益健康研究院团队与国内外团队联合做的中国人肠道菌群调查研究,纳入了1000多名不同年龄的中国人的肠道菌群数据。特别的结果是发现中国健康老年人拥有与年轻人相似的肠道菌群。值得好好看一看,特别推荐。
健康衰老
16S rRNA gene sequencing
DNA sequencing
compositional data
cross-sectional study
微生物生态
Microbiome:测序虽好但无法分辨细菌是死是活,怎么办?(综述)
这是一项非常重要的方法学综述,提出一个很重要的问题——用测序方法分析的微生物无法区分是死是活,那么有什么其他方法可以解决这个问题呢?好好看看这篇综述!
微生物生态
DNA sequencing
Flow cytometry
Infectivity
Live/dead