微生物生态

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文章数：7篇

Cell子刊：构建体外微生物群落，助力肠道菌群研究

研究病人来源的细菌群落的系统模型，有助于探究肠道微生物群在疾病中的作用。Cell Host and Microbe发表的文章，通过体外培养不同来源的粪便样本，构建了体外菌落（SICs）。SICs保留了其粪便来源的分类学多样性，再现了微生物群对病原体入侵和抗生素治疗的反应，提示利用SICs可以对肠道微生物群进行低成本、定量和高通量实验研究。

肠道菌群环丙沙星培养组学抗生素微生物生态

肠道菌群进化

健康人的肠道菌群在绝对变化中保持相对稳定

诚所谓“年年岁岁花相似，岁岁年年人不同”，肠道菌群也是如此。《ISME Journal》近期发表研究，对健康人群的一项长达512天的队列研究表明，尽管每个个体中肠道菌群种群结构能够保持相对稳定，但事实上菌群的成员早已今非昔比。

肠道菌群进化队列研究肠道菌群大肠杆菌肠杆菌科

微生物生态

是时候发动一场生态学大统一运动了（观点）

宏观生态学是研究多尺度下通用生态原理的科学。长期以来，微生物生态学和宏观生态学的研究彼此隔离。Trends in Ecology and Ecolution上发表的综述中，作者呼吁当下是跨过二者鸿沟的时候了。因为它们都是以物种和个体为共同的研究对象，以了解生物多样性变化的原因和后果为共同的研究目标。

微生物生态 Zhe Wang Qunye Zhang Xuefang Yan

菌群代谢物改变微生境，驱动菌群组成的变化

ISME Journal发表的一项最新研究中，分析了牛在喂食前后一段时间内瘤胃菌群随时间的变化情况，提出牛进食后瘤胃菌群的代谢产物改变了瘤胃微生境，从而导致菌群的组成和功能发生改变。

瘤胃菌群微生物生态菌群组装微生境修饰瘤胃微生物

细菌江湖中的“强盗”和“杀手”（观点）

作者介绍了他们在葡萄球菌等群体中的研究成果，展示了细菌通过抗生素和铁载体两种不同策略展开种间竞争时的复杂情况。

种间竞争微生物生态铁载体抗生素 Nicholas Chia

微生物生态

Microbiome：测序虽好但无法分辨细菌是死是活，怎么办？（综述）

这是一项非常重要的方法学综述，提出一个很重要的问题——用测序方法分析的微生物无法区分是死是活，那么有什么其他方法可以解决这个问题呢？好好看看这篇综述！

微生物生态 DNA sequencing Flow cytometry Infectivity Live/dead

土壤微生物

NC：微生物如何驱动土壤有机质形成？

土壤有机质(SOM)和碳及其养分驱动着基本的超微生物地球化学过程，并影响碳循环-气候反馈，这其中微生物的作用不容小觑，这篇文章特别介绍了相关知识。虽然与肠道菌群关系不大，却也很值得一读。

土壤微生物土壤有机物碳循环微生物生态 Kai Zhao