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菌群组装
文章数:7篇
群体感应
丁涛等:细菌群体感应协调纵向互作,形成微生物群组装
细菌群体感应(QS)作为细菌交换信息和相互作用的重要机制,具有普遍性、特异性和调控能力,但细菌QS如何调控人类微生物群落的组装过程尚不清楚。近日,中山医学院丁涛及团队在Microbiome发表最新研究,利用在体外搭建的优化的口腔生物被膜(OBM)的组装平台,结合体外模型培养、宏基因组测序、高通量数据分析以及信号干扰实验,发现OBM的组装过程中,依次处于优势地位的核心菌会通过时序性的QS网络进行信息交流实现菌种间互作,推动菌群结构的序贯演替,值得关注。
群体感应
菌群组装
研究论文
基础研究
口腔生物被膜
植被演替
国内团队:长期植被演替下土壤活性碳组分与菌群的联系
iMeta近期发表了来自中科院水保所邓蕾团队的研究,基于一个典型的160年次生演替序列,探究了表层土壤 (0–20 cm) 和底土 (20–40 cm) 中菌群构建与有机碳组分之间的联系,该研究揭示了土壤活性有机碳组分与菌群在长期尺度上的联系,强调了活性有机碳组分的重要性。
植被演替
土壤活性有机碳组分
菌群组装
共生网络
r-策略
粪菌移植
Cell子刊:FMT后供体的菌株植入受哪些因素影响?
粪菌移植(FMT)在治疗与菌群密切相关的疾病方面具有潜力,但FMT后患者(受体)菌群的组装及其决定因素,尚有很多未知。Cell Reports Medicine近期发表研究,对接受FMT治疗的患者菌群进行了全面的菌株水平分析,表明供体菌株的植入取决于菌群和临床参数,包括对受体进行抗生素预处理和肠道灌洗,并从生态学的角度进行了分析。
粪菌移植
细菌植入
菌群组装
鸟类菌群
什么塑造了雏鸟的肠道菌群?
Microbiome近期发表研究,分析了雏鸟的肠道菌群变化以及塑造其肠道菌群的因素,表明母鸟的肠道菌群是雏鸟菌群的主要贡献者,鸟巢是传播的关键途径。
鸟类菌群
Avian microbiota
Host-microbiome interactions
Maternal effects
Gut microbiota assembly
竞争性彩票模型
肠道菌群中存在基于竞争性彩票模型的组装模式
竞争性彩票模型认为来自区域物种池的不同生物群能够在相同的生态位定殖,且第一个到达的物种将占据整个生态位并排除其它群体成员。对于进化关系较近的同一属的细菌来说,因其具有类似的代谢能力,可能更契合这一模型。
竞争性彩票模型
菌群组装
Competitive lottery model
Computational modeling
ecology
瘤胃菌群
菌群代谢物改变微生境,驱动菌群组成的变化
ISME Journal发表的一项最新研究中,分析了牛在喂食前后一段时间内瘤胃菌群随时间的变化情况,提出牛进食后瘤胃菌群的代谢产物改变了瘤胃微生境,从而导致菌群的组成和功能发生改变。
瘤胃菌群
微生物生态
菌群组装
微生境修饰
瘤胃微生物
菌群组装
ISME:水管中长期滞留的自来水,细菌猛增
当你离开家前,一定会检查并关好水龙头。但你可能不知道的是,在这段时间内,管道中滞留的水里,菌群的数量快速增加,可能导致水质恶化。
菌群组装
饮用水滞留
水质恶化
中性过程
Benjamin C Creelan