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文章数：7篇

动物微生物组

张永振团队Cell：多维度、系统性分析野生小型哺乳动物的病毒组

蝙蝠、啮齿动物和鼩鼱是人类传染病最重要的动物传染源。然而，对于它们携带的病毒仍缺乏系统性研究。Cell最新发表了复旦大学张永振团队的一项大型研究，对我国不同自然生境地区野生小型哺乳动物的3个目（翼手目（蝙蝠）、食虫目（鼩鼱）和啮齿目（鼠类））的病毒组，进行了全面、系统、多维度的分析，揭示出不同宿主之间的病毒组差异，分析了这些病毒的多样性、进化生态学、播散规律，以及宿主特征等生态因子如何影响病毒组组成和跨物种病毒传播，并首次发现哺乳动物可能感染节肢动物相关病毒的证据。

动物微生物组病毒组 wild small mammals bats rodents

乳杆菌与醋酸杆菌共培养可改变pH，影响抗生素耐受

人类肠道微生物群是由上千个微生物物种组成的复杂生态系统，对我们的健康和寿命有着重要影响。即使在健康状况下，也很难阐明构成我们肠道微生物的不同物种之间是如何相互作用和影响的。同时，物种间的相互作用还可以通过许多机制影响抗生素的活性，包括改变细菌的生理机能等，因此，预测抗生素在微生物群落中的有效性具有一定难度。果蝇因其肠道微生物种类简单，成为研究该问题的理想模型。近期发表在eLife上的文章发现了一种影响细菌抗生素耐受性的新方式。通过体外共培养果蝇肠道微生物植物乳杆菌（Lp）和醋杆菌属细菌，证实醋杆菌属细菌通过利用Lp产生的乳酸来调节pH，进而影响Lp的生长状态来调节其抗生素耐受性。本研究结果表明，环境的简单变化可以驱动细菌群落中复杂的生理行为和抗生素反应，并提示，当使用抗生素时，不仅要考虑目标细菌，也要考虑其所在的微生物群落，以防止耐药性的形成。

果蝇植物乳杆菌醋酸杆菌 pH 抗生素耐受性

晚发性败血症

Nature子刊：特定益生菌可预防小鼠晚发性败血症

早产儿晚发性败血症（LOS）被认为是由肠道共生菌的全身性扩散所引起的，临床经验表明有些益生菌对预防LOS有效。Nature Medicine发表的一项最新研究，在小鼠模型中证实，婴儿期的肠道菌群组成是抵抗由致病共生菌肺炎克雷伯菌（Kp）过度生长引起的LOS的关键因素，特定乳杆菌（鼠乳杆菌和约氏乳杆菌，而非鼠李糖乳杆菌GG）以及大肠杆菌Nissle 1917，可起预防作用。进一步研究表明，早期肠道菌群随肠道内氧含量降低而发生演替，逐渐发育为以厌氧菌为主的成熟菌群，可抵抗Kp引起的LOS。这些发现对于理解早期肠道菌群发育有参考意义，也为后续研发可预防LOS的益生菌干预方法带来启示。

晚发性败血症 ecology IMMUNOLOGY Medical research Microbiology Pathogenesis

竞争性彩票模型

肠道菌群中存在基于竞争性彩票模型的组装模式

竞争性彩票模型认为来自区域物种池的不同生物群能够在相同的生态位定殖，且第一个到达的物种将占据整个生态位并排除其它群体成员。对于进化关系较近的同一属的细菌来说，因其具有类似的代谢能力，可能更契合这一模型。

竞争性彩票模型菌群组装 Competitive lottery model Computational modeling ecology

肠道菌群代谢产物

评估肠道菌群的“致病功能”

Microbiome上发表的一项最新研究，提出了一种新概念：基于肠道菌群产生的“有害”代谢产物评估菌群的“致病功能”，并发现在不同疾病状态下，表现出不同的携带“致病功能”相关基因的细菌的丰度增加，提示可基于肠道菌群的“致病功能”评估宿主的健康状态，并实现靶向肠道菌群的精准医疗。

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肠道菌群建立

“独一无二”的肠道菌群，定植顺序很重要

肠道菌群的形成受遗传、饮食、生活方式等因素影响，但即便是生活在相同家庭环境中的同卵双胞胎，也可能有非常不同的肠道菌群，提示还有不少“未知”因素在菌群塑造中有重要作用。eLife近期发表研究，以无菌小鼠为模型，从生态学角度分析了幼年期细菌定植顺序对肠道菌群构建的长期影响。将生态学概念纳入菌群研究，对理解菌群构建的机制，以及开发相关疗法，都有重要意义。

肠道菌群建立 Lactobacillus colonisation history community ecology ecology

【营养前沿】引入生态学方法，弥补营养学不足

本文回顾营养学的发展，指出传统营养学在治疗肥胖和心血管疾病（OACD）方面存在局限性，并分析了可能的原因。① 鉴于此，文章提出“营养生态学”概念。② 营养生态学强调：觅食行为是复杂的；缺乏与过剩都会造成损失；复杂的问题可以找到简单的解决方法；必须重视食欲的影响。③ 最后，文章以肥胖为例，解释理论对实践的指导作用，包括如何分析影响因素，确定优先级，发现机会点；如何整合信息，推导出营养干预方案。

生态学进化论营养几何学肥胖心血管健康