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动物微生物组

张永振团队Cell：多维度、系统性分析野生小型哺乳动物的病毒组

蝙蝠、啮齿动物和鼩鼱是人类传染病最重要的动物传染源。然而，对于它们携带的病毒仍缺乏系统性研究。Cell最新发表了复旦大学张永振团队的一项大型研究，对我国不同自然生境地区野生小型哺乳动物的3个目（翼手目（蝙蝠）、食虫目（鼩鼱）和啮齿目（鼠类））的病毒组，进行了全面、系统、多维度的分析，揭示出不同宿主之间的病毒组差异，分析了这些病毒的多样性、进化生态学、播散规律，以及宿主特征等生态因子如何影响病毒组组成和跨物种病毒传播，并首次发现哺乳动物可能感染节肢动物相关病毒的证据。

动物微生物组病毒组 wild small mammals bats rodents

肠道菌群与疾病

Cell：肠道菌群与人类疾病间的因果关系被夸大（观点）

人源菌群鼠模型（HMA）是体内植入人体肠道/粪便菌群的无菌鼠类模型，为目前研究肠道菌群和疾病之间因果关系的主流手段。现有大量使用HMA证明多种诸如炎症、过敏、肿瘤等与肠道菌群成因果关系，但已知在人体中能确定具有因果关系的只有两种：幽门螺旋杆菌导致人患胃癌和艰难梭菌感染导致人腹泻。作者认为啮齿动物无法还原人体，自身生理结构、处所和饮食等都会造成不同结果，因此对该领域的研究结论需谨慎说明。在这里补充原文作者提出的相关建议：1）探索HMA中与疾病相关的菌群变化；2）使用考虑了生物差异性的供体样本量量；3）要将供体的重复组数量考虑进实验设计中；4）不混合供体样本以确保个体间差异；5）确保菌群移植成功，如特定的“失衡”菌群特征是否在受体内出现；6）诚实探讨动物实验不足；7）相关性分析HMA多组学数据和可能的菌群特征后进行功能性实验；

肠道菌群与疾病 causality Chronic disease Dysbiosis Fecal transplant

同济大学等：胖瘦鼠肠道菌群荟萃分析

Physiological Genomics发表的由同济大学团队主导的研究，纳入9项啮齿动物研究的原始数据，分析饮食诱导的肥胖与菌群组成和功能变化的关联，值得专业人士关注。

肥胖 Gut microbiota high-fat diet META-ANALYSIS Obesity