Nicholas Chia

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Nicholas Chia

文章数：8篇

胰腺导管腺癌(PDAC)

胰腺外分泌瘤内的菌群特征

在手术切除的胰腺导管腺癌（PDAC）中，有76%的样本被检测到含有细菌DNA。瘤内微生物组的组成可能影响治疗药物的敏感性和疾病的生存。最新发表在Gut的研究揭示了非手术新鲜冷冻内镜超声（EUS）标本中胰腺外分泌瘤内细菌DNA组成，以揭示肿瘤微生物组的组成和多样性。

胰腺导管腺癌(PDAC) 研究论文细菌DNA 内镜超声（EUS）微生物表型

粪便代谢组学特征或预示大肠癌早期事件

结直肠腺瘤是结直肠癌（CRC）的癌前病变，为观察CRC早期发展的关键事件提供了一些方法和思路。肠道微生物群在腺瘤和癌发生发展中的变化和作用也被广泛探讨，并强调了其对癌变的影响。然而，目前很少有研究关注调节宿主和肠道微生物之间相互作用的肠道代谢组。最新发表在mBio的研究纳入102位高危腺瘤患者、102位健康对照，以及36位CRC患者，收集其粪便，并检测粪便代谢组学特征和肠道菌群。该研究发现，与对照组相比，腺瘤患者粪便中多种类型的生物活性脂类，包括多不饱和脂肪酸、次级胆汁酸和鞘脂质升高，且多不饱和脂肪酸和鞘脂类在CRC患者中进一步升高。此外还发现在微生物组和代谢组数据之间有非常强的整体关联，并对细菌分类群以及包括腺瘤特征在内的代谢组学特征的稳健相关对进行了编目。该研究强调了肠代谢物及其与肠道微生物相互作用在CRC发病早期事件中的重要性。

结直肠癌 carcinogenesis colorectal adenoma colorectal cancer metabolomics

艰难梭菌感染

Science子刊：肠道菌群失调促艰难梭菌感染的新机制

Science Translational Medicine上发表的一项最新研究，发现在腹泻患者中，肠道菌群失调可增加肠道中的游离氨基酸（特别是脯氨酸），艰难梭菌可利用这些氨基酸作为能量来源，从而促进艰难梭菌感染。另外，在一项对腹泻患者的回顾性队列研究中，鉴定出一些临床风险因素（抗生素、住院、免疫抑制、先前的CDI），可预测肠道菌群失调及更高的CDI易感性。

艰难梭菌感染艰难梭菌感染脯氨酸氨基酸 Peng Zheng

宏基因组测序

用宏基因组测序鉴定人工关节感染中的病原体

在人工关节感染（PJI）中，通常难以鉴定病原体。利用宏基因组测序方法，可鉴定出传统的培养法无法鉴定的病原体。

宏基因组测序人工关节

肠道菌群互作网络

Nature子刊：人类肠道菌群全球代谢互作网络的情境特异性群落规模分析

① 搭建复杂的微生物-微生物及宿主-微生物化学交流的系统水平框架，有助于阐明肠道菌群在健康和疾病中的作用；② 基于文献组织建立人类肠道菌群的种属间网络，称为NJS16；③ 在此网络的内容基础上，开发一种数学方法，阐明给定人群中如患者群体的肠道菌群的代表性微生物和代谢特征；④ 将该方法应用于2型糖尿病患者的微生物组数据，揭示出肠道菌群生态系统的情境特异性基础结构；⑤ 此网络提供整合人类肠道的群落规模微生物活性研究的基础。

肠道菌群互作网络

AJE：收集粪便样本，不必太纠结取样方法

又是方法学必读文献，为什么必读，看标题。

feces microbiota specimen collection Craig Baker-Austin Craig Baker-Austin

Genome Medicine：子宫菌群如何影响内膜癌？

关于子宫菌群的研究不算多，这是近期的一篇，关注女性菌群和疾病的群友可以重点看看。

16S rDNA Atopobium Endometrial cancer Microbiome Porphyromonas

多发性硬化

SR：多发性硬化患者的肠道菌群有什么特别？

① 多发性硬化（MS）是一种受遗传和环境因素影响的免疫疾病；② 肠道菌群在MS发病中可能起重要作用；③ 比较31名MS患者与36名健康人的肠道菌群；④ 枝动杆菌属、嗜血杆菌属等5个属的细菌丰度在MS患者中显著增加，普氏菌属等3个属的细菌显著减少。

多发性硬化肠道菌群 Edward C Deehan Jens Walter