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质粒
文章数:9篇
微生物生态学
Nature子刊:质粒编码防御蛋白,抵抗毒素
肠道环境有非常密集的微生物生态系统,其中质粒广泛分布。质粒促进了微生物之间遗传物质的交换,同时使各种辅助功能得以转移。然而,它们对微生物群落组成和功能的确切影响,尚不清楚。Nature Microbiology近期发表的文章,发现质粒编码的防御蛋白可对肠道微生物产生的毒素——罗伊氏素具有抵抗功能,从而对群落结构产生影响,同时还能介导攻击菌和防御菌之间的代谢交换,互惠互利。
微生物生态学
质粒
基因组编辑技术
国内团队Nature子刊:新型非模式假单胞菌的高效基因组编辑技术
基于噬菌体编码的同源重组系统是细菌基因组编辑的有效工具。近日,山东大学微生物技术国家重点实验室符军、李瑞娟、湖南师范大学尹佳及团队在Nature Protocols发表最新研究,利用噬菌体编码的同源重组系统和CRISPR-Cas3系统对假单胞菌进行精准基因组工程编辑,开发了非模式假单胞菌的高效基因组编辑技术,性能较好,值得关注。
基因组编辑技术
噬菌体编码
研究论文
基础研究
同源重组系统
同一健康
Nature Reviews:从同一健康的角度看质粒介导的抗生素耐药性(综述)
Nature Reviews Microbiology近期发表的综述文章,从同一健康的视角,对决定质粒介导的抗生素抗性基因在局部地区和全球传播的研究进行了整理,就影响质粒在复杂微生物群落中的生态和演化的因素展开了讨论。
同一健康
抗生素耐药性
质粒
长读长测序
扬州大学:长读长宏基因组测序助力解析蛋鸡粪便中高流行耐药基因
动物源抗生素耐药基因(ARGs)的出现和流行已经对全球公共卫生构成了巨大威胁。随着测序技术和生物信息学的快速发展,长读长宏基因组测序越来越多地被用于破译环境中耐药基因的命运。近日,扬州大学王志强、李瑞超及团队在Science of the Total Environment发表最新研究,小质粒可能是一些耐药基因在粪便微生物群落中高流行的原因。纳入4个大型蛋鸡养殖场20份粪便样本进行长读长宏基因组测序,小质粒可能是一些耐药基因在粪便微生物群落中高流行的原因。在部分蛋鸡粪便样本中检测到一种携带floR的IncQ型质粒和一种携带tet(L)的小质粒,这两个小质粒在粪便微生物中可形成串联重复结构,增强耐药基因的富集,值得关注。
长读长测序
抗生素抗性基因 (ARGs)
研究论文
基础研究
肠道菌群
宏基因组测序
SCAPP:组装宏基因组质粒的Python包
本研究开发了 SCAPP(一个易于使用的 Python 包),可以从宏基因组样本中组装完整的质粒序列。SCAPP 以 Recycler 算法的一些关键思想为基础,同时通过整合有关质粒的生物学知识改进质粒组装。在大多数情况下,它的性能优于现有的宏基因组质粒组装软件,SCAPP 是开源软件,可从以下网址获得:https://github.com/Shamir-Lab/SCAPP。
宏基因组测序
组装
质粒
算法
Python
耐药性
污水处理厂中的耐药质粒传播频率及范围
选取来自大肠杆菌或恶臭假单胞菌的3种多重耐药性质粒,分析在污水处理厂活性污泥菌群中,耐药质粒的传播频率及范围。
耐药性
污水处理
质粒
质粒
mBio:警惕医院内的抗生素耐药性
碳青霉烯类抗生素是治疗严重细菌感染的重量级武器,但能生成碳青霉烯酶的细菌(CPO)可对其产生抗性,医院内感染CPO发病率和死亡率都令人担忧。mBio[IF:6.956]近期发表了美国NIH临床中心的一份报告,调查了美国医院内的CPO及其携带的耐药基因质粒等情况,结果不容乐观,推荐医院管理者参考。
质粒
耐药性
碳青霉烯类抗生素
Antimicrobial resistance
carbapenem resistant
沙门氏菌
mBio:沙门氏菌的多重耐药质粒,怎样传播给其他细菌?
这是一项利用体外恒化器系统模拟鸡肠道模型,以分析多重耐药性质粒如何在细菌之间传播的研究。很值得关注的研究,特别推荐!
沙门氏菌
大肠杆菌
质粒
体外肠道模型
粘菌素
浙大冯友军等:中国人及猪体内携带耐药基因的细菌新质粒
这是浙江大学医学院冯友军教授和合作者对携带粘菌素耐药基因mcr-1的大肠杆菌的研究,发现了超过10种携带mcr-1基因的质粒。这是重要的耐药性机制研究,值得认真读一读。
粘菌素
mcr-1基因
质粒
colistin resistance
Dissemination