抗生素抗性基因 (ARGs)

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抗生素抗性基因 (ARGs)

文章数：8篇

Nature子刊：抗生素对婴儿和成人肠道菌群的不同影响

Nature Communications近期发表的文章，探究了成人和婴儿肠道菌群和肠道抗性组的差异，以及抗生素暴露对肠道菌群和肠道抗性组的影响。

肠道菌群抗生素抗生素抗性基因 (ARGs)

长读长测序

扬州大学：长读长宏基因组测序助力解析蛋鸡粪便中高流行耐药基因

动物源抗生素耐药基因（ARGs）的出现和流行已经对全球公共卫生构成了巨大威胁。随着测序技术和生物信息学的快速发展，长读长宏基因组测序越来越多地被用于破译环境中耐药基因的命运。近日，扬州大学王志强、李瑞超及团队在Science of the Total Environment发表最新研究，小质粒可能是一些耐药基因在粪便微生物群落中高流行的原因。纳入4个大型蛋鸡养殖场20份粪便样本进行长读长宏基因组测序，小质粒可能是一些耐药基因在粪便微生物群落中高流行的原因。在部分蛋鸡粪便样本中检测到一种携带floR的IncQ型质粒和一种携带tet(L)的小质粒，这两个小质粒在粪便微生物中可形成串联重复结构，增强耐药基因的富集，值得关注。

长读长测序抗生素抗性基因 (ARGs) 研究论文基础研究肠道菌群

抗生素抗性基因 (ARGs)

抗生素耐药基因数据库再更新—ResFinderFG v2.0

宏基因组学可用于监测抗生素耐药基因（ARGs）的传播，2016年，ResFinderFG v1.0数据库被开发用于识别多种类型样本的ARGs。近日，巴黎城市大学研究人员及团队在Nucleic Acids Research发表最新研究，开发出ResFinderFG v2.0（https://cge.food.dtu.dk/services/ResFinderFG/），从50个数据集中共鉴定出3913个ARGs。此外，ResFinderFG v2.0的特异性较好，能检测到较多的未被识别的ARGs，值得关注。

抗生素抗性基因 (ARGs) ResFinderFG v2.0 研究论文基础研究宏基因组

人类宿主过滤

南方科技大学团队开发快速检测病原细菌及耐药基因的宏基因组流程

本文报道了一个对临床研究样本中的病原细菌及其携带耐药基因进行快速检测的宏基因组学工作流程，该流程整合了基于GPU运算的Nanopore适应性采样“人类宿主DNA过滤”测序模式和自主研发的实时物种鉴定/抗性基因预测的分析工具RUARGpore（https://github.com/sustc-xylab/RUARGpore.git），实现了上机4.5小时内病原及所携带耐药基因的精准检测。同时，该方法相比现有宏基因组学检测方法有效的降低了成本，有潜力应用于大规模临床推广。

人类宿主过滤宏基因组学流程病原体检测抗生素抗性基因 (ARGs) 纳米孔适应性采样

郑浩+张雪等：我国蜜蜂肠道中耐药组分布规律及传播机制

东方蜜蜂（Apis cerana）和西方蜜蜂（Apis mellifera）是我国养殖数量最多的两种蜜蜂。中华蜜蜂是我国特有的东方蜜蜂种群，主要采取传统的养蜂方法，蜂群会保持半自然状态，受人工驯化蜂群影响较少，但其肠道耐药基因组成尚不明确。近日，中国农业大学郑浩、张雪及团队在Microbiome发表最新研究，通过分析不同地区东、西方蜜蜂肠道菌群，发现不同蜂种耐药基因组成及丰度存在显著差异，且不同地区的中华蜜蜂肠道菌群中抗生素抗性基因（ARGs）组成及丰度也存在不同程度差异。此外，发现蜜蜂肠道菌能够通过质粒介导发生水平转移，获得和传播ARGs，进而促进蜜蜂肠道物种及环境中耐药基因的传播和富集，可能对蜂群健康、生态环境以及人类健康造成威胁。总之，该研究为未来研究蜜蜂肠道菌群中ARGs传播与进化提供了新见解。

中华蜜蜂抗生素抗性基因 (ARGs) 研究论文基础研究昆虫（果蝇、蜜蜂等）

可移动遗传元件（MGEs）

Nature子刊：人微生物组中参与耐药基因转移的可移动遗传元件

抗生素耐药菌是目前人类面临的重大健康威胁之一。抗生素滥用是导致耐药菌产生的重要的原因之一。当患者使用抗生素时，会导致肠道菌群组成的变化。在清除大多数的抗生素敏感型共生菌和致病菌的同时，会导致具有抗性基因（ARG）的共生菌不断富集。而有研究显示，这些具有抗性的共生菌可能通过移动遗传元件（MGE）的水平基因转移（HGT）而使得致病菌获得抗性。近年来，尽管在该领域人们已经发现一些HGT转移ARG的事件。但对人类肠道共生菌和致病菌之间的HGT的真实规模，和高风险的MGE认知不足。近期一篇发表在Nature子刊Nature Communications上的研究工作，系统地研究了病原菌和共生菌之间的HGT程度和规模，重点研究了ARG相关MGE的特征。该研究工作建立了MGE介导的ARG在人类肠道共生菌和病原菌之间的传播网络，提出广泛宿主范围的MGE应作为潜在ARG传播的管理目标。

可移动遗传元件（MGEs）致病菌与肠道共生菌的关系水平基因转移（HGT）抗生素抗性基因 (ARGs) 研究论文

鸡肠道菌群

中国农大团队：鸡肠道菌群的参考基因组和基因集用于解析耐药基因

中国农业大学胡永飞团队在Communications Biology发表研究，结合来自中国和欧洲国家的鸡肠道菌群的宏基因组数据，构建了一个完整的鸡肠道菌群参考基因集和基因组集，并使用多种生物信息学工具和数据库对组装的基因和基因组集进行了注释和分析，同时还使用新组装的宏基因组组装基因组 (MAGs)和基因集对鸡肠道菌群中的耐药基因 (ARGs)进行了分析，并比较了鸡和人类肠道抗生素抗性组。这些整合的基因和基因组集资源对于更好地了解鸡肠道菌群的结构和功能至关重要。本研究提供了迄今为止最大的鸡肠道整合宏基因组数据集，并证明了其在探索鸡肠道菌群基因方面的价值。

鸡肠道菌群肠道抗性组宏基因组组装基因组 (MAGs) 抗生素抗性基因 (ARGs)

抗生素抗性基因 (ARGs)

华南农业大学：猪场废水处理前后抗生素抗性基因分布

人类、动物和农业对抗生素的过度依赖和使用导致了抗生素耐药细菌（ARB）和相关抗生素抗性基因（ARGs）的广泛传播。这些病原体和ARGs的出现和扩散严重影响了临床治疗，并对公众健康构成威胁。此外，ARB和ARGs也可以通过转化、接合和转导等在空气和水中传播，将进一步导致对周围生态系统的间接不利影响。作为ARGs的重要储存库，深入了解噬菌体在动物相关环境中对抗生素耐药性的贡献非常重要。来自华南农业大学的曾振灵和孙永学团队发表在《Frontiers in Microbiology》上的一项研究，检测了中国广东省养猪场不同处理阶段废水中的ARGs的分布情况，并对携带ARGs的噬菌体是否有助于抗生素耐药性传播进行了全面分析，为降低抗性基因传播风险提供了一定的借鉴。

抗生素抗性基因 (ARGs) 猪场废水 Bacteriophages metagenomics antimicrobial resistance genes