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可移动遗传元件(MGEs)
文章数:4篇
可移动遗传元件(MGEs)
Nature子刊:人微生物组中参与耐药基因转移的可移动遗传元件
抗生素耐药菌是目前人类面临的重大健康威胁之一。抗生素滥用是导致耐药菌产生的重要的原因之一。当患者使用抗生素时,会导致肠道菌群组成的变化。在清除大多数的抗生素敏感型共生菌和致病菌的同时,会导致具有抗性基因(ARG)的共生菌不断富集。而有研究显示,这些具有抗性的共生菌可能通过移动遗传元件(MGE)的水平基因转移(HGT)而使得致病菌获得抗性。近年来,尽管在该领域人们已经发现一些HGT转移ARG的事件。但对人类肠道共生菌和致病菌之间的HGT的真实规模,和高风险的MGE认知不足。近期一篇发表在Nature子刊Nature Communications上的研究工作,系统地研究了病原菌和共生菌之间的HGT程度和规模,重点研究了ARG相关MGE的特征。该研究工作建立了MGE介导的ARG在人类肠道共生菌和病原菌之间的传播网络,提出广泛宿主范围的MGE应作为潜在ARG传播的管理目标。
可移动遗传元件(MGEs)
致病菌与肠道共生菌的关系
水平基因转移(HGT)
抗生素抗性基因 (ARGs)
研究论文
抗生素抗性基因
中科院微生物所:人、鸡和猪肠道微生物抗生素抗性基因表达谱
肠道微生物是抗生素抗性基因(ARG)的储存宿主。然而,关于肠道微生物中ARG的存在(宏基因组DNA水平)和表达谱(宏转录组RNA水平)的信息有限。中科院微生物研究所高福与团队在《Environment International》发表一项研究,通过宏基因组测序和宏转录组测序对来源于人、鸡和猪肠道微生物中的ARG进行了基因组和转录水平的分析,加深了对ARG在人、鸡、和猪肠道菌群中的分布、进化和传播的理解。
抗生素抗性基因
肠道微生物
metagenomics
metatranscriptomics
gut resistome
MinION纳米孔测序
香港理工:MinION纳米孔测序用于研究致病菌抗性质粒的多态性
香港理工大学团队的一项研究中,采用了MinION单分子测序平台研究了沙门氏菌抗性质粒中的异质性。在单分子水平上,接合质粒可能含有不同拷贝数的可移动元件,可被看成非典型的质粒组。这一研究展示了单分子测序的独特优势。
MinION纳米孔测序
水平基因转移
沙门氏菌
可移动遗传元件(MGEs)
接合转移
早产婴儿
Pediat Res:婴儿来自不同医院,菌群中可动遗传因子各异!
不同医院出生的早产儿,他们的肠道菌群有何不同呢?这项研究做了一定的分析,特别关注了菌群中的可动遗传因子(mobile genetic elements,MGEs)的区别,有一些新意,特别推荐。
早产婴儿
坏死性小肠结肠炎(NEC)
肠道菌群
出生体重
分娩方式