MinION纳米孔测序

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MinION纳米孔测序

文章数：5篇

Nature子刊：快速检测临床宏基因组样本和耐药致病菌

MinION测序平台可提供近乎实时的DNA测序分析，具有临床应用前景。Nature Microbiology发表的一项最新研究显示，MinION结合NanoOK RT软件，可在物种水平上快速分析临床宏基因组数据，鉴定肠道相关的潜在致病菌及其抗生素耐药性情况，从而及时为抗菌治疗决策提供关键参考信息。

临床检测抗生素耐药性肠道菌群早产儿 MinION纳米孔测序

Nature子刊：牛瘤胃微生物组的参考基因组集

反刍动物为全世界数十亿人提供必需的肉、奶等重要营养。瘤胃是一种特殊的胃，适应植物来源的复合多糖的分解。瘤胃微生物组的基因组编码数千种适于消化植物物质的酶，它们主导反刍动物饮食结构。本文对近三百个牛胃样本进行宏基因组二、三代混合测序，获得了近五千个宏基因组组装的基因和40多万个碳水化合物代谢相关基因，为深入研究牛瘤胃微生物组提供了参考基因组，可进一步挖掘功能基因和筛选高转化效率菌种提供基础。同时也是近期第三篇Nanopare技术参与发表在自然生物技术杂志在宏基因组领域的文章，可见新技术在宏基因组中应用带来的巨大优势。另两篇详见 https://www.mr-gut.cn/papers/read/1088940721 和 https://www.mr-gut.cn/papers/read/1074446025

瘤胃菌群宏基因组学 MinION纳米孔测序

使用 Nanopore 宏基因组测序实时分析受感染的整形外科器件

通过纳米孔测序和实时数据分析，可以帮助克服临床上假体关节感染难以诊断和治疗的难题。

三代测序 MinION纳米孔测序 Clinical Device-related infection metagenomics

MinION纳米孔测序

香港理工：MinION纳米孔测序用于研究致病菌抗性质粒的多态性

香港理工大学团队的一项研究中，采用了MinION单分子测序平台研究了沙门氏菌抗性质粒中的异质性。在单分子水平上，接合质粒可能含有不同拷贝数的可移动元件，可被看成非典型的质粒组。这一研究展示了单分子测序的独特优势。

MinION纳米孔测序水平基因转移沙门氏菌可移动遗传元件（MGEs）接合转移

FM：利用纳米孔测序技术定量分析城市污水中的抗性组

这是香港大学团队利用MinION纳米孔（Nanopore）测序技术定量分析污水处理厂中的大肠型细菌的耐药基因的研究，Nanopore正在蓬勃向前，从研究到转化应用，都会有很多惊喜，值得特别关注。

城市污水抗性组表型基因型 MinION纳米孔测序