蜜蜂

菌株水平的多样性在细菌物种中广泛存在，可以扩大天然微生物群落的功能潜力。然而，群落在多大程度上因环境/宿主变化而经历菌株组成的持续变化尚不清楚。近日，瑞士洛桑大学研究人员在Genome Biology发表最新研究，使用宏基因组学探究蜜蜂两种行为状态（护士蜂和采集蜂）肠菌差异，发现宿主相关群落中的菌株水平多样性可以随着宿主行为变化而发生一致的变化，从而调节群落的功能潜力，值得关注。

菌株多样性肠菌功能潜力研究论文基础研究宏基因组学

纳米纤维素

农科院：黄麻纳米纤维素对蜜蜂病毒感染及肠道紊乱具有保护作用

蜜蜂作为农业中重要的作物传粉昆虫和科学研究的模式生物，是肠道微生物群研究的理想模型系统。同时，由于病毒的威胁，蜜蜂的种群数量正在逐年下降，目前尚无有效的治疗药物。近日，中国农业科学院侯春生及团队在ACS Nano发表最新研究，通过蜜蜂模型，发现黄麻纳米纤维素对蜜蜂病毒感染及肠道紊乱具有保护作用。总之，该研究为黄麻纳米纤维素作为一种潜在的抗病毒感染的候选药物，提供了理论依据，值得关注。

纳米纤维素蜜蜂研究论文基础研究纳米材料

益生菌

改进递送方法，让益生菌更有效抑制蜜蜂病原体

这是发表在ISME上的一份工作，作者基于前期开发的花粉饼接种法和本文开发的喷雾接种法，使用三联乳杆菌LX3（植物乳杆菌Lp39，鼠李糖乳杆菌GR-1和Api. kunkeei BR-1）分别接种管理蜜蜂（即被驯化的农业蜜蜂），这些蜜蜂来自加利福尼亚周病原体密集的农场。结果显示LX3可以提高育雏上限，诱导转录免疫应答，减少机会致病病原体，以及富集如双歧杆菌、乳酸杆菌等共生有益菌。其中，喷雾接种法对蜜蜂的致死病原体蜜蜂球囊菌有较强的抗菌活性，而花粉饼经LX3发酵后产生不同的氨基酸，发酵后组分更适应蜂群营养需求。这份工作强调了益生菌接种方法对蜂群的影响，在疾病管理中利用两种接种方式的不同益处针对性或联合接种。

益生菌益生菌递送蜜蜂

工程菌

防治蜜蜂的微孢子寄生虫的新方法——工程肠道共生菌

PNAS近期发表的文章，开发出工程化的肠道共生菌，可抑制微孢子虫寄生虫并提高蜜蜂的存活率，且可形成群体免疫，为蜜蜂病虫害防治提供新思路。

工程菌蜜蜂寄生虫

蜜蜂

郑浩团队Nature子刊：工程化蜜蜂肠菌或可递送dsRNA抑制孢子虫

蜜蜂是重要的授粉昆虫，会受到致病细菌、真菌和寄生虫的威胁。研究表明，蜜蜂肠道菌群对东方蜜蜂微孢子虫（Nosema ceranae）感染具有重要的保护作用，并通过基因工程肠道共生菌的应用成功降低了病原体的寄生。近日，中国农业大学郑浩及团队在Nature Communications发表最新研究，利用无菌蜜蜂模型，发现肠道细菌Snodgrassella会调节蜜蜂氧化途径免疫反应，抑制中蜂微孢子虫的寄生。总之，该研究不仅揭示了Nosema的感染机制，还展示了利用工程化肠道细菌保护蜜蜂免受该病原体侵害的潜力，为改善蜜蜂健康提供了新的思路，值得关注。

蜜蜂中蜂微孢子虫研究论文基础研究肠道菌群

蜜蜂

国内团队：大规模基因组监测揭示中国蜜蜂病毒的流行和进化特征

近年来，蜜蜂的经济和环境价值受到全球蜂群崩溃的严重挑战，这些崩溃通常是由传染病爆发引起。然而，由于缺乏全球范围内的大规模和纵向基因组监测，研究人员对蜜蜂病毒多样性、流行性和传播性的了解在很大程度上是模糊的。近日，中国农业科学院蜜蜂研究所徐书法、山东第一医科大学史卫峰及团队在Microbiome发表最新研究，通过宏转录组测序对中国不同地区有临床症状（爬行或颤抖等）东、西部蜜蜂及体外寄生虫螨约2000样本进行了详细表征，强调了中国两种主要蜜蜂物种中已知致病性蜜蜂病毒的广泛多样性和高流行性和遗传多样性，还鉴别到多种新的病毒并命名，对于未来使用合理干预手段减轻蜜蜂的病毒性传染病非常重要，值得关注。

蜜蜂病毒组研究论文基础研究全基因组

工程菌

Nature子刊：利用肠道共生菌介导的RNAi，研究蜜蜂功能基因组学

目前蜜蜂功能基因组学研究主要是利用双链RNA(dsRNA) 注射或喂养来诱导RNAi介导的目标基因敲低，dsRNA注射既费力又有害，而dsRNA喂养价格昂贵，因此急需开发新的方法研究蜜蜂功能基因组学。近日，发表在Nature Protocols上的这篇文章，利用蜜蜂肠道细菌介导的RNAi方法可稳健、持久和系统地抑制蜜蜂基因的表达，本研究为未来研究其他昆虫和动物物种提供了新思路。

工程菌蜜蜂功能基因组学

蜜蜂

Nature子刊：肠道菌群影响蜜蜂的社交网络

肠道菌群影响动物的神经发育和行为，但其是否影响动物的群体生活尚不清楚。近日发表在Nature Ecology & Evolution上的文章，利用蜜蜂探究肠道菌群对宿主社会行为的影响，并发现肠道菌群会影响蜜蜂的社交互动率和社交网络结构，进而影响蜂群内的信息和营养流动。因此，这项研究表明肠道菌群对蜜蜂复杂的社会生活至关重要。

蜜蜂肠道菌群社交昆虫菌群

单细胞技术

郑浩+张翀：用微流控单细胞技术，解析肠道菌群的菌株多样性

菌群分析的单细胞技术能在菌株层面拓展我们对于肠菌的认知。蜜蜂肠道菌群中包含的细菌种类有限，某些菌株拥有独特的基因组潜力和功能，这为菌株水平分析提供了一个很好的模型。中国农业大学郑浩团队与清华大学张翀团队合作在Microbiome发表的最新研究中，建立了一个基于微液滴的微流控平台，将蜜蜂的单个肠菌用微液滴包裹住并进行培养，这样能排除肠菌间的竞争，在培养后富集一些稀有菌株。而后通过宏基因组测序和组装得到细菌基因组，对这些基因组的分析揭示出了蜜蜂肠道菌群中潜在的新菌种，也为肠菌适应宿主的机制提供了新见解。该方法未来有望拓展为高通量培养组学技术，以及分析其他复杂菌群的多样性和功能，值得专业人士参考。

单细胞技术肠道菌群蜜蜂微液滴封装微流体

微塑料颗粒

郑浩+吴晓蒙：纳米微塑料会扰乱蜜蜂肠道菌群及免疫系统

微塑料是指直径小于5毫米的塑料颗粒，其粒径小、生物可降解性低，在水生和陆地生态系统甚至大气中广泛分布。研究发现，在城市周边的蜂场中发现了微塑料的存在。近日，中国农业大学郑浩、吴晓蒙及团队在Science of the Total Environment发表最新研究，发现暴露于100nm的聚苯乙烯颗粒会显著降低蜜蜂全身重量和存活率，诱导其肠道发育不良，随着摄入量的累积，进而会影响蜜蜂肠道菌群组成和免疫系统，减弱对致病性Hafnia alvei菌的抵抗，死亡率显著增加。总之，该研究为未来基于蜜蜂探究微塑料对肠道菌群的影响提供了新见解。

微塑料颗粒蜜蜂研究论文基础研究肠道菌群

食物欲望

福建农林大学Science发文：蜜蜂脑部瞬时激活的多巴胺信号调控食物欲望

哺乳动物中，期望（Wanting）的产生受到中脑边缘多巴胺神经通路调控，但在昆虫中是否存在类似的期望系统尚不清楚。最近，由福建农林大学苏松坤研究员团队牵头，并联合法国图卢兹大学Martin Giurfa教授团队，在Science发表了最新相关研究成果，针对两个科学问题进行了系统研究：采集蜂前往优质食物源的途中是否受欲望系统(Wanting system）驱动？采集蜂在摆尾舞过程中是否通过回忆起优质食物源进而激活欲望系统？结果发现，无论在前往食物源途中还是在摇摆舞中，由于食欲增加和对食物来源的回忆，一个依赖多巴胺的期望系统会在蜜蜂大脑中被暂时激活，表明昆虫与哺乳动物有类似的由积极愉悦刺激产生期望的神经机制。

食物欲望多巴胺信号蜜蜂蜜蜂摇摆舞

蜜蜂菌群

郑浩团队：蜜蜂肠道菌群调节宿主行为和神经功能

蜜蜂是一种高度群居的社会性昆虫，具有丰富的行为，是神经生物学研究中广泛应用的动物模型。蜜蜂的肠道菌群只包括有限数量的菌属，但目前人们对于菌群是否能塑造蜜蜂的大脑活动和行为还不是十分清楚。近期，中国农业大学郑浩团队在Microbiology Spectrum上发表文章，揭示了肠道菌群可以调节蜜蜂行为、大脑基因转录和内循环代谢，突出了肠道菌群在蜜蜂行为中的重要作用，以及不同蜜蜂肠道菌属对宿主生理的复杂相互作用。总之，该研究结果为人们在探究宿主和微生物间的相互作用中提供了一个很有前景的动物模型。

蜜蜂菌群基础研究动物实验蜜蜂昆虫（果蝇、蜜蜂等）

菌群传递

郑浩、胡小松等：遗传因素塑造蜜蜂肠道菌群

蜜蜂肠道菌群是由一组简单、特异的核心细菌构成，主要通过蜜蜂间的社会互动在同蜂巢（姐妹）成员间传播。这个核心菌群在不同蜜蜂个体之间呈现高度的菌株水平多样性，这种菌群的个体差异与多种因素相关，蜜蜂的遗传因素可能在其中有重要作用。中国农业大学郑浩作为通讯作者，近期在Microbiome发表研究，通过宏基因组测序，对不同蜜蜂亚种以及通过人工授精构建的杂交蜂的基因组和微生物组联合分析，发现在菌群的社会传播过程中，宿主基因型可明显影响核心菌的丰度以及菌株水平的构成。此外，与宿主基因型有关的特定双歧杆菌还参与了蜜蜂的“肠脑轴”调控。这些发现揭示了宿主基因型参与塑造蜜蜂肠道菌群菌株水平组成的重要作用，并表明遗传因素可通过调节肠道菌群对蜜蜂的大脑生理和健康带来间接影响。我们特别对该研究通讯作者郑浩教授进行了专访（见“延伸阅读”），以飨读者。

菌群传递蜜蜂遗传-菌群互作肠-脑轴肠道菌群

肠道细菌

蜜蜂肠道细菌的共存机制

微生物群落中的成员之间存在着广泛的合作和竞争，特别是代谢能力相近的物种之间的资源竞争。目前，功能冗余的物种如何在肠道等微生态系统中共存尚不清楚。由于蜜蜂的肠道菌群复杂性较低，且在实验上易于控制，因此它们为研究宿主中的微生物相互作用提供了一个理想的模型。来自瑞士的科研人员在eLife上发表的一项研究发现，功能相近的四种乳酸杆菌在蜜蜂肠道中的共存是营养依赖型的，它们彼此之间糖代谢功能的差异可能是使这四个物种在花粉存在的情况下共存的关键因素。这些发现表明，通过分享宿主饮食中提供的不同营养，功能密切相关的细菌可以在肠道中共存。因此，蜜蜂和其他动物的饮食摄入差异可能会影响肠道细菌的多样性，并可能影响动物的健康。

肠道细菌蜜蜂微生物互作宏转录组学饮食-菌群互作

蜜蜂

农科院：肠道菌群保护蜜蜂抵抗塑料微粒的有害影响

塑料微粒对生物体和生态系统的危害，正在得到人们越来越多的关注。中国农业科学院吴黎明、齐素贞与团队近期在Journal of Hazardous Materials发表研究，揭示了塑料微粒对蜜蜂的危害，以及蜜蜂肠道菌群在其中的保护性作用。

蜜蜂 Polystyrene microplastics honey bees Gut microbiota antibiotics

宿主 - 微生物相互作用

共生菌在蜜蜂免疫系统中的重要作用（综述）

农药暴露、感染性疾病和营养威胁导致较高的蜜蜂死亡率和蜂群损失率。尽管对影响昆虫生理的应激因素的单一及综合效应的研究已有数十年之久，但缺少对蜜蜂共生微生物群落在抵抗环境应激方面的作用的研究。在人类中，抗生素的多代连续使用与许多当代疾病有关。近期发表于Trends in Microbiology的一篇综述，作者们对蜜蜂的情况得出了类似的结论，认为长期暴露于外源性抗菌物质会系统性地损伤蜜蜂体内的微生物群，并妨碍对健康至关重要的且适应宿主的共生菌的跨代转移。作者建议，应将对昆虫共生微生物群的影响纳入农业化学品风险评估的考量中。

宿主 - 微生物相互作用蜜蜂 host–microbe interactions probiotics insect immunity

蜜蜂

两种近缘蜜蜂肠菌菌株水平多样性存在巨大差异？

微生物群落中的菌株多样性被认为具有重要的功能。然而，对于相关微生物群落在这一水平上的多样性差异程度以及可能限制和维持菌株水平多样性的潜在机制知之甚少。近日，洛桑大学研究人员在Current Biology发表最新研究，通过宏基因组学表征西方和东方蜜蜂肠菌菌株水平的差异，发现蜜蜂菌株水平多样性会导致两者间功能差异，进而影响其多糖降解，值得关注。

蜜蜂肠道菌群 metagenomics Gut microbiota honey bee

工程菌

Science封面文章：巧用工程菌，调控蜜蜂基因表达、限制病原体感染

真核生物中，RNA干扰（RNAi）能引起基因沉默，是研究基因功能的有力手段，在传染病治疗和某些疾病的基因治疗方面也有应用前景，Science最新发表的封面研究将RNAi与蜜蜂的肠道共生菌进行了有机结合，使得改造后的工程菌能在蜜蜂肠道中持续释放特定的双链RNA，从而激活蜜蜂的RNAi应答，可用于研究蜜蜂基因功能。此外，这种工程菌方法还能减少特定病原体（比如病毒和寄生螨虫）对蜜蜂的感染，或许有助于改善蜜蜂养殖。

工程菌蜜蜂肠道共生菌 RNA干扰病原体感染

动物菌群

不同类型蜜蜂的肠道菌群差异

春季到秋季期间，成年工蜂可分为2类：年轻的为照顾幼虫的哺乳蜂（nurse），年老的为外出采蜜的觅食蜂（forager），一些于晚秋新出现的成年工蜂可成为冬季蜂。ISME Journal上发表的一项最新研究，对比分析了上述3种工蜂的肠道菌群，鉴定出了菌群负荷、多样性及组成的差异，并发现饮食中的花粉是造成差异的主要原因。

动物菌群蜜蜂 Joonatan Palmu Christin S Börschel Teemu Niiranen

动物益生菌

益生菌抑制蜜蜂的致病菌感染

幼虫类芽孢杆菌感染可引起美洲蜂幼虫腐臭病（AFB）。ISME Journal上发表的一项最新研究，发现使用益生菌（BioPatty，含有3株乳杆菌属菌株）可显著抑制幼虫类芽孢杆菌的感染，并增加感染后蜜蜂幼虫的存活率。

动物益生菌动物益生菌蜜蜂幼虫类芽孢杆菌 Zhuang Li

共生

Nature子刊：细菌、农作物与蜂类之间的互惠共生

微生物在昆虫与植物的交互中可能有重要作用，Nature Communications近期发表的一项研究，探究了植物及其共生微生物如何共同抵抗灰葡萄孢菌。他们发现，球孢链霉菌SP6C4遍布草莓植株内，包括花粉中也存在这个菌。这个菌不仅能帮草莓抵御灰葡萄孢菌感染，还能帮采食的蜜蜂抵抗病原体，而蜜蜂反过来又能将这个菌传播到其它植株上，从而形成一个完整的细菌、植物和蜂类之间的三方互惠共生关系。

共生草莓蜜蜂链霉菌属 Amanda Hazel Dilmore

动物共生菌群

Nature子刊：蜜蜂肠道菌群，菌株水平见差异

蜜蜂肠道菌群的结构较为简单，在高分类水平上具有保守性，但是菌株水平的个体差异显著。本研究利用蜜蜂菌群，指出对于肠道菌群的研究需要从结构研究向功能研究发展，指出了在菌株水平进行研究的必要性，值得参考。

动物共生菌群蜜蜂蜜蜂肠道菌群宏基因组测序动物实验

蜜蜂

Nature子刊：关注蜜蜂宏基因组

欧洲蜜蜂在授粉和食物生产中起着重要作用。蜜蜂的健康是环境，宿主遗传和相关微生物的复杂作用结果。加深对这些因素的了解将有助于应对蜜蜂健康的挑战。本研究使用DNA测序来表征来自英国各地的19个蜜蜂群的基因组和宏基因组。研究结果分析揭示了与蜜蜂相关的微生物群落，并证明了高通量，定向宏基因组学在鉴定农业生态系统中新的生物威胁方面的能力。

蜜蜂宏基因组 Yangyu Liu Yandong Xiao

寿命

蜜蜂的寿命与肠道菌群的关联

工蜂的肠道菌群随着年龄增长，而出现与衰老标志物一致的变化。Microbiome上发表的一项最新研究，分析了蜂王在衰老过程中的肠道菌群变化，鉴定出了与相对短命的工蜂相比，随着年龄增长，更加长寿的蜂王的肠道菌群表现出显著不同的变化。

寿命蜜蜂 Frank B Hu Jun Li

抗生素

ME：抗生素对蜜蜂肠道菌群核心物种的影响

这是Molecular Ecology[IF：6.086]发表的关于抗生素如何影响蜜蜂肠道菌群的研究，很有参考意义，特别推荐！

抗生素遗传多样性蜜蜂 antibiotics genetic diversity

蜜蜂

ESPR：侧孢短芽孢杆菌可促进蜜蜂的生长及蜂蜜生产

一项蜜蜂菌群研究，确定了特定“益生菌”——侧孢短芽孢杆菌对蜜蜂生理和健康状态的促进作用，很值得关注，特别推荐。

蜜蜂侧孢短芽孢杆菌蜂蜜 Antimicrobial agents Brevibacillus laterosporus

种内多样性

FM：菌株水平研究，蜜蜂是理想动物模型（综述）

与脊椎动物不同的是，蜜蜂的肠道菌群非常一致，核心菌群中只包含了8种细菌，这为从菌株水平分析菌群提供了理想的条件，而细菌种内的多样性，也就是菌株水平的分析很关键，为此，用蜜蜂来研究菌株，很理想。

种内多样性菌株水平蜜蜂 Line Matthiessen Line Matthiessen

蜜蜂

NRM综述：群居蜜蜂的肠道菌群

很多菌群的研究，用蜜蜂作为模式生物，Nature Reviews Microbiology专门用一篇综述来介绍它们的菌群有什么特点，有此待遇者，唯蜜蜂也~

蜜蜂肠道菌群 Francesco Russo Antonella Orlando

蜜蜂

mBio综述：蜜蜂微生物组

最近有几篇重要的蜜蜂微生物组的综述，这小蜜蜂感觉是研究微生物的良好模型啊。

蜜蜂蜜蜂微生物组