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微液滴封装
文章数:2篇
单细胞技术
郑浩+张翀:用微流控单细胞技术,解析肠道菌群的菌株多样性
菌群分析的单细胞技术能在菌株层面拓展我们对于肠菌的认知。蜜蜂肠道菌群中包含的细菌种类有限,某些菌株拥有独特的基因组潜力和功能,这为菌株水平分析提供了一个很好的模型。中国农业大学郑浩团队与清华大学张翀团队合作在Microbiome发表的最新研究中,建立了一个基于微液滴的微流控平台,将蜜蜂的单个肠菌用微液滴包裹住并进行培养,这样能排除肠菌间的竞争,在培养后富集一些稀有菌株。而后通过宏基因组测序和组装得到细菌基因组,对这些基因组的分析揭示出了蜜蜂肠道菌群中潜在的新菌种,也为肠菌适应宿主的机制提供了新见解。该方法未来有望拓展为高通量培养组学技术,以及分析其他复杂菌群的多样性和功能,值得专业人士参考。
单细胞技术
肠道菌群
蜜蜂
微液滴封装
微流体
宏基因组
Nature子刊:新技术“读云”可获得高质量宏基因组序列
“读云”的核心是采用了微液滴封装技术降低了宏基因组复杂性,之后再结合现有方法测序和新算法组装。这相当于对宏基因组展开了一场“降维攻击”。
宏基因组
宏基因组算法
微液滴封装
新一代测序技术
C Bosetti