药物-菌群互作

鉴于微生物动态与人类健康间的紧密联系，治疗干预对人类肠道微生物群的影响是一个最受关注的临床问题。目前关于抗菌疗法对GM功能和生化途径的影响却很少被研究。近日，意大利萨萨里大学研究人员在Gut Microbes发表最新研究，表征了幽门螺杆菌感染患者治疗前后粪便宏蛋白质组特征，结果显示蛋白质组学可用来监测药物诱导的转基因和宿主功能重塑，值得关注。

宏蛋白质组学幽门螺杆菌感染研究论文基础研究肠道菌群

药物-菌群互作

国内团队：药物-菌群互作——精准医疗的新重点（综述）

药物反应（IVDR）的个体差异可能是药物不良反应（ADRs）和延长治疗的主要原因，从而造成重大的健康和经济负担。尽管药物基因组学对个体遗传背景对药代动力学（PK）和药效学（PD）的影响进行了广泛的研究，但遗传多样性只能解释有限比例的IVDR。最近的研究强调了肠道微生物群及其代谢物在调节人类疾病治疗结果中的作用。因此，新兴的药物微生物组学（pharmacomicrobiomics ）领域旨在探索微生物群变化与IVDR或ADRs之间的关系。近期中南大学湘雅医院临床药理研究所张伟作为通讯作者在Signal Transduction and Targeted Therapy发表了一篇综述，介绍了药物微生物组学在人类疾病中的进展，以更好地了解IVDR对未来精准医学的影响。

药物-菌群互作精准医疗

药物-菌群互作

想要精神药物更有效，或需先改变肠菌（荟萃分析）

药物与肠道菌群之间存在双向相互作用，约25%的人类靶向药物可以抑制肠道细菌的生长，其中很大一部分是抗精神病药物。药物引起的肠道菌群变化会显著影响其疗效和耐受性。Biological Psychiatry上近期发表的一项系统综述和荟萃分析中，探讨了精神药物是否会改变肠道菌群，以及肠道菌群是否会影响精神药物的疗效和耐受性。分析表明，精神药物治疗与肠道菌群组成的改变有关，反过来肠道菌群可能影响这些药物的疗效和耐受性。

药物-菌群互作精神障碍医学研究荟萃分析抗精神病药物

药物-菌群互作

Cell：新方法解析癌症患者的药物-菌群关联

药物-菌群互作肠道菌群计算模型异基因造血细胞移植

化疗

福建中医药大学：肠道菌群或介导化疗药物导致的组织损伤

结直肠癌多在晚期诊断，难以手术切除，辅助化疗治疗有助于提高手术切除率。五氟尿嘧啶（5-FU），伊立替康（CPT-11），奥沙利铂（L-OHP）广泛应用于结直肠癌治疗，但往往会造成严重的肠道菌群失调、肠道炎症和肠道组织损伤，而影响患者预后。福建中医药大学中西医结合研究院林久茂、彭军及其团队近日在Microbiology Spectrum发表最新研究文章，建立起了肠道菌群变化模式与不同化疗药物引起的肠道损伤程度之间复杂但清晰的网络，为化疗后靶向解毒治疗手段的发展提供了新的思路。

化疗药物-菌群互作组织损伤

药物-菌群互作

宏基因组学结合蛋白质组学，鉴定出可激活霉酚酸酯的肠道细菌酶

霉酚酸酯（MMF）是一种用于预防器官移植排斥和治疗自身免疫性疾病的免疫抑制剂前药，然而约45%的服用MMF的患者会出现胃肠道毒性；肠道细菌的β-葡萄糖醛酸酶（GUS）可将MMF从非活性的霉酚酸葡萄糖醛酸（MPAG）重新激活为活性的霉酚酸（MPA）。GUS酶根据其结构特征具有不同的底物偏好，目前尚未鉴定出重新激活MPA的肠道微生物GUS酶。近日，发表在Gut Microbes的这篇文章中，通过结合宏基因组学与基于活性的蛋白质组学方法，鉴定出可重新激活MPA的肠道细菌酶，可能驱动了MPA诱导的胃肠道毒性。

药物-菌群互作细菌酶多组学

药物-菌群互作

大规模分析药物对人肠道菌群的潜在影响

药物对肠道菌群的影响正得到越来越多的关注。Gastroenterology近期发表一项来自日本的大队列横断面研究，分析了759种药物与肠道菌群组成和功能的关联，其中超过70%的药物是此前的药物-菌群研究中未涉及的。该研究特别关注了多重用药对菌群的影响，并通过对其中一个子队列的纵向分析，揭示了用药情况与菌群动态变化的关系。这些发现为进一步研究药物-菌群互作以及菌群对药物疗效和毒性的影响，奠定了基础。

药物-菌群互作肠道菌群多重用药抗生素耐药基因

肠道菌群代谢产物

王军团队：肠道菌群-宿主互作中的代谢物

肠道菌群代谢产物在健康与疾病中的作用正在得到越来越多的关注。EBioMedicine近期发表了中科院微生物所王军团队的综述，总结了复杂疾病中肠道菌群代谢物的变化，探讨了其中的相关性、因果性和机制，阐述了肠道菌群和药物之间的相互作用对药物疗效的影响，并讨论了从菌群代谢物中开发药物的研究方向和策略。

肠道菌群代谢产物药物-菌群互作宿主-菌群互作

药物-菌群互作

张晨虹、袁慧娟等：降糖药恩格列净改善心血管，或与菌群和代谢物有关

恩格列净（Empaglifozin）是钠-葡萄糖共转运蛋白2 （SGLT2）的选择性抑制剂，通过抑制肾脏近端小管对葡萄糖的重吸收及促进尿糖排泄，来降低2型糖尿病患者的高血糖。已有报道发现恩格列净对2型糖尿病（T2DM）患者有心血管保护作用，但是机制还不明。近期河南省人民医院内分泌科袁慧娟作为通讯作者，河南省人民医院邓欣如和上海交通大学张晨虹等作为共同第一作者，在Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism发表的一篇研究发现，恩格列净（10 mg/d）相比二甲双胍（1700 mg/d）对于有心血管疾病风险的T2DM患者，可能是一种更好的初始治疗方法，其对心血管的益处可能与肠道菌群和血浆代谢物的改变有关。

药物-菌群互作肠道菌群恩格列净代谢组学糖尿病

药物-菌群互作

国内团队：非抗生素药物与抗生素联用，可大幅增加细菌耐药性

天津环境医学与作业医学研究所金敏团队，近期在Gut Microbes发表研究，以常见的肠道细菌大肠杆菌为模型，发现非抗生素药物与抗生素的联合使用，可协同增强细菌的多重耐药性，加速抗生素耐药细菌的进化，并可能加强其传播。这些发现为药物对肠道细菌耐药性的影响带来了新启示。

药物-菌群互作 Non-antibiotic pharmaceutics antibiotic-resistant bacteria antibiotics synergism

药物-菌群互作

帕金森病患者的肠道细菌酪氨酸脱羧酶与病程、临床指标及用药相关

npj Parkinsons Disease上发表的一项纵向队列研究结果，分析了帕金森病患者的肠道细菌酪氨酸脱羧酶丰度与病程、临床指标及用药的关联。

药物-菌群互作研究论文纵向队列研究帕金森病

药物-菌群互作

研究药物-菌群互作的新工具，助力寻找靶向菌群的“老药”

常用的非抗生素药物也可改变肠道菌群，这为研发“老药新用”靶向菌群的治疗方法提供了可能。Journal of Medicinal Chemistry发表的这项研究，报道了一个可研究菌群-药物互作的高通量筛选平台，并以10种FDA批准的老药为例，研究了这些药物对菌群的影响。

药物-菌群互作药物研发

药物-菌群互作

IBD患者的治疗效果与肠道菌群相关（综述）

肠道菌群可能参与IBD的发病机制。IBD患者对治疗的应答不一致的机制尚未明确。Alimentary Pharmacology and Therapeutics上发表的一篇系统性综述文章，分析了19项研究的结果，总结了IBD患者对不同治疗的应答与其肠道菌群之间的关联。

药物-菌群互作综述 IBD

药物-菌群互作

广东省中医院：不同治疗药物对类风湿关节炎患者的肠道菌群的影响

来自广东省中医院的黄闰月和黄清春作为共同通讯作者，在Frontiers in Immunology上发表的一项研究，对比了类风湿关节炎（RA）患者与健康对照的肠道菌群组成及功能差异，并对比了接受不同药物治疗后，RA患者的肠道菌群组成及功能的变化。

药物-菌群互作研究论文纵向队列研究类风湿关节炎化瘀强肾通痹方

药物-菌群互作

Nature：抗生素伤害无辜肠菌，特定解毒剂或能保护

抗生素被用于对抗致病菌，但也会影响共生细菌，扰乱肠道菌群的组成，导致菌群失调和疾病。但不同种类的抗生素对不同肠道细菌的影响，仍然缺乏系统性研究。Nature最新发表的一项研究在前期工作（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1066456444）的基础上，进一步阐明了不同抗生素对肠道共生菌的活性谱，并鉴定出能减少抗生素对共生细菌“误伤”且不影响对致病菌效力的药物，为避免抗生素对肠道菌群造成不良影响提供了新策略。

药物-菌群互作抗生素肠道菌群

药物-菌群互作

用机器学习预测药物-菌群互作（综述）

搞清药物与菌群的相互作用，可指导药物研发和个体化医疗。Biotechnology Advances近期发表综述，回顾了关于药物-菌群互作的研究进展，并探讨了机器学习在该领域中的应用情况和未来前景，推荐专业人士关注。

药物-菌群互作机器学习药物研发人工智能肠道菌群

药物-菌群互作

用于预测药物对肠道细菌影响的机器学习模型

药物可以对肠道菌群产生深远的影响，可能改变其功能并促进疾病的发生。Pharmaceutics近期发表研究，介绍了一种可用于预测药物对40个肠道细菌菌株影响的机器学习模型。

药物-菌群互作机器学习

药物-菌群互作

成都中医药大学：靶向肠道菌群以实现精准医疗（综述）

肠道菌群可能影响药物的疗效与毒性，个体间菌群组成及功能的不同可能导致的药物应答的差异。成都中医药大学的彭成团队在Theranostics上发表的一篇综述文章，详细讨论了以下几个方面：肠道菌群影响药物疗效及毒性的机制、肠道菌群变化导致的药物应答差异、基于肠道菌群的生物标志物用于患者分层及治疗决策、个性化调控肠道菌群以改善药物应答的策略。

药物-菌群互作 Gut microbiota Precision Medicine drug toxicity Drug Efficacy

药物-菌群互作

Cell：鉴定不同个体肠道菌群药物代谢作用的新方案

药物微生物组是菌群研究的新兴热点之一。近期的许多研究表明，肠道菌群的差异或可解释部分药物在个体间的药效差异。然而由于微生物组的复杂性，以及在多种条件下测试数百种药物和数千种代谢产物的巨大技术挑战，导致目前缺乏关于肠道菌群代谢药物的系统性研究。而该研究所提出的MCM-Screen定量实验方案，为药物微生物组的研究提供了新手段，或将进一步推动药物微生物组的发展。有兴趣的读者不妨搭配着阅读之前发表的另一篇关于肠道菌群药物代谢作用的系统性研究（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1048639688）。

药物-菌群互作药物代谢药物研发个体化医学

药物-菌群互作

快速测定个体肠道菌群药物反应的新方法

很多口服药物都可以影响肠道菌群的组成和功能，《Microbiome》发表的一项研究介绍了一种称为RapidAIM的体外检测方法，可测定药物对人体肠道菌群的组成和功能的影响。

药物-菌群互作 gut microbiome Drug response In vitro culturing Metaproteomics

药物-菌群互作

Nature Outlook：药物-微生物组的双向互作

药物与菌群的相互作用是菌群研究的一个新兴热点。近期的一些重量级研究表明，药物与肠道菌群的双向互作对菌群平衡和药物疗效都有不可忽视的作用，是个性化医学中不可或缺的部分。Nature Outlook最新上线的肠道菌群专题文章对此进行了报道，回顾了该领域中的重要发现，并对相关研究者进行了采访，值得关注。

药物-菌群互作个性化医疗 Junqiang Liu Pei Zhang Zhongfan Zheng

药物-菌群互作

Nature子刊：常用药物与肠道菌群组成和代谢功能的关联

肠道菌群可影响药物效力，反过来药物也影响肠道菌群。Nature Communications发表的一项最新研究，对荷兰3个队列的数据进行了分析，鉴定出19种常用药物与肠道菌群特征的关联，重点列举了质子泵抑制剂、二甲双胍、SSRI抗抑郁药以及非抗生素药物与菌群变化的关联。这些发现对于研究药物-菌群互作有参考意义。

药物-菌群互作肠道宏基因组队列研究炎症性肠病肠易激综合征

菌群干预

JAMA：微生物组科学在疾病治疗方面的成果和挑战

人类微生物组研究的一个终极目标，是通过操纵共生菌群来改善健康和疾病。JAMA发表了来自美国NIH国家人类基因组研究所微生物基因组部主任Julia Segre博士等的观点性文章，回顾了微生物组科学在疾病干预方面的近期重要成果和进展，探讨了目前研究所面临的挑战，提出通过“临床观察-机制研究-临床干预”三步走的方式，将微生物组科学向临床实践转化。

菌群干预粪菌移植菌群移植饮食干预药物-菌群互作

肠道菌群体外培养

Nature子刊：可用于高通量菌群靶向药物筛选的体外模型

肠道菌群的体外培养，对于微生物组的转化研究有重要意义。Nature Communications近期发表的一项研究，建立了一种高通量的肠道菌群体外培养模型MiPro，能较好的维持菌群的组成和功能稳定性。结合宏蛋白质组学检测技术，MiPro可作为高通量筛选平台，用于肠道菌群靶向药物的筛选与评价。

肠道菌群体外培养高通量筛选平台药物-菌群互作宏蛋白质组学 Jiang-Ning Hu

抗生素

Cell子刊：饮食可调节肠道菌群对抗生素的易感性

抗生素对肠道菌群的扰动程度，在不同个体间存在差异。Cell Metabolism发表的一项最新研究表明，抗生素可改变肠道内的代谢环境和菌群的转录应答，代谢环境的改变反过来又影响细菌对抗生素的易感性，因而通过饮食干预来调控肠道代谢，或能用来减少抗生素治疗造成的肠道菌群紊乱。

抗生素 metatranscriptomics metagenomics antibiotics Microbiome

关节炎

药科大：小檗碱调节肠道菌群、促进丁酸生成，缓解大鼠关节炎

FASEB Journal近期发表了中国药科大学戴岳和魏志凤与团队的研究，在大鼠模型中揭示了小檗碱通过调节肠道菌群、促进菌群产生丁酸盐进而缓解关节炎的作用和机制。

关节炎 rheumatoid arthritis BUT butyrate synthesis 大鼠

药物-菌群互作

Science子刊：免疫抑制剂霉酚酸酯与肠道菌群互作，引起胃肠毒性

霉酚酸酯（MMF）又称吗替麦考酚酯，是常用的免疫抑制药，广泛应用于预防、治疗移植器官急性排异反应，但有胃肠道副作用。Science advances近期发表的一项研究揭示了MMF胃肠道毒性中肠道菌群的作用，并发现用万古霉素清除表达β-葡萄糖醛酸酶的肠道菌，可预防并逆转MMF的胃肠道副作用。

药物-菌群互作霉酚酸酯免疫抑制药药物代谢药物副作用

药物-菌群互作

Cell子刊：精准医疗中的菌群-药物互作（综述）

菌群与药物的互作可影响药物治疗效果，Cell Host and Microbe今年7月刊发的“微生物与药物”专刊中的这篇综述，详细探讨了菌群-药物互作研究领域的进展，以及用于改善药物疗效的菌群干预策略，值得专业人士参考。

药物-菌群互作药物微生物组学精准医疗

药物-菌群互作

菌群-药物互作影响药物效果（综述）

药物与菌群的互作是菌群研究的热点问题，《Trends in Pharmacological Sciences》近期发表综述，着重讨论了口服药物与肠道菌群的互作，特别是菌群对药物的修饰和代谢及其对药代动力学的影响，值得专业人士关注。

药物-菌群互作 Microbiome pharmacodynamics pharmacology xenobiotics

药物-菌群互作

Science：肠道菌群对药物代谢的贡献有多大？

肠道菌群参与药物代谢过程。Science近期发表了一篇方法学研究，阐述了一种可定量测定肠道菌群对药物代谢贡献的方法，测定了肠道细菌对若干核苷类抗病毒药物、抗焦虑药物的代谢影响。该模型对评估肠道菌群在药物、营养成分等物质代谢过程中的作用具有重要参考价值。

药物-菌群互作方法学药物代谢药物毒性无菌小鼠